HTR1A在低级别胶质瘤的预后中的应用制造技术

本发明专利技术公开了HTR1A在低级别胶质瘤的预后中的应用。本发明专利技术的第一方面，提供定量检测HTR1A的试剂在制备用于低级别胶质瘤的预后产品中的应用。根据本申请实施例的应用，至少具有如下有益效果：本发明专利技术通过一系列生物信息学分析方法来筛选低级别胶质瘤与正常组织中差异表达的基因或其蛋白质，首次提出HTR1A基因或者HTR1A蛋白作为低级别胶质瘤预后进行判断的生物标志物，弥补了现有低级别胶质瘤预后指标的不足，具有良好的临床价值。具有良好的临床价值。具有良好的临床价值。

【技术实现步骤摘要】
HTR1A在低级别胶质瘤的预后中的应用


[0001]本申请涉及胶质瘤诊断
，尤其是涉及HTR1A在低级别胶质瘤的预后中的应用。

技术介绍

[0002]胶质瘤是目前最常见的原发性中枢神经系统恶性肿瘤之一，约占所有中枢神经系统恶性肿瘤的80％。根据WHO描述的相关标准，胶质瘤可以分为I～IV级，其中，I、Ⅱ级为低级别，Ⅲ、IV级为高级别。I级胶质瘤为良性肿瘤，多发于儿童，治疗方法以手为主；III～IV级胶质瘤为恶性肿瘤，多发于中老年，治疗时需要结合手术、放疗及化疗等多种手段；相比之下，II级胶质瘤为低级别胶质瘤(low grade glioma，LGG)，其介于良性与恶性之间，多发于中青年。低级别胶质瘤有去分化和转化为高级别胶质瘤的倾向，术后容易复发且升高级别，临床上存在较高的致残率和病死率。因此，有必要提供一种能够对低级别胶质瘤进行有效预后评估的产品。

技术实现思路

[0003]本申请旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本申请提出一种具有良好的预后价值的低级别胶质瘤标志物。
[0004]本申请的第一方面，提供定量检测HTR1A的试剂在制备用于低级别胶质瘤的预后产品中的应用。
[0005]根据本申请实施例的应用，至少具有如下有益效果：
[0006]本申请通过一系列生物信息学分析方法来筛选低级别胶质瘤与癌旁组织和正常组织中差异表达的基因或其蛋白质，首次提出HTR1A基因或者HTR1A蛋白作为低级别胶质瘤预后判断的生物标志物，弥补了现有低级别胶质瘤相关指标的不足，具有良好的临床价值。
[0007]其中，HTR1A(5
‑
Hydroxytryptamine Receptor 1A)是5
‑
羟色胺受体1A，HTR1A基因编码5
‑
羟色胺的G蛋白偶联受体，属于5
‑
羟色胺受体亚家族。可能与G蛋白偶联受体活性以及和G蛋白偶联的血清素受体活性相关。
[0008]在本申请的一些实施方式中，试剂在基因水平或蛋白水平上定量检测HTR1A。在基因水平上定量检测HTR1A的试剂通过以下方法进行，具体包括但不限于聚合酶链反应(PCR)、等温扩增反应(如环介导等温扩增LAMP、重组酶聚合酶扩增RPA等)、探针杂交技术、RNA印迹等方法。在蛋白水平上定量检测HTR1A蛋白的试剂通过以下方法进行，包括但不限于酶联免疫反应(ELISA)、放射免疫反应(IRA)、免疫组化染色、蛋白质印迹、电泳、液相色谱
‑
质谱/质谱(LC
‑
MS/MS)等。
[0009]在本申请的一些实施方式中，在基因水平上定量检测HTR1A的试剂选自引物、探针和基因芯片。其中，引物是指能够特异性扩增HTR1A基因的引物，探针是指能够特异性识别HTR1A基因或者该基因转录本的探针，基因芯片是指在基底材料(具体包括但不限于聚合物如尼龙膜、硝酸纤维素膜以及玻璃等)上固定有前述的探针的阵列所形成的复合结构。
[0010]在本申请的一些实施方式中，在蛋白水平上定量检测HTR1A的试剂包括特异性抗体。其中，特异性抗体是指能够特异性识别HTR1A编码蛋白的抗体，具体包括但不限于单克隆抗体及多克隆抗体中的至少一种。
[0011]在本申请的一些实施方式中，预后判断包括预测受试者的生存率。其中，生存率是特定时间节点下受试者存活的概率。例如一年生存率、两年生存率、三年生存率、五年生存率、十年生存率等。一般而言，生存率可以分为总体生存率、中位生存率、无进展生存率等。在本申请的实施例中，申请人发现，低级别胶质瘤患者的HTR1A表达情况与其生存率密切相关，因而可以根据HTR1A的表达水平来预测受试者的生存率。可以理解的是，除了生存率之外的其它预后指标也可以作为预后判断的一个参数或指标。
[0012]在本申请的一些实施方式中，生存率为总体生存率、无复发生存率、无进展生存率中的至少一种。总体生存率(overall survival，OA)是指从确认患有低级别胶质瘤开始到因为任何原因引起死亡的时间。无复发生存率(recurrence
‑
free survival，RFS)是指初次手术到最早出现复发证据的时间。无进展生存率(progression
‑
free survival，PFS)是指由随机至第一次发生疾病进展或任何原因死亡的时间，其中，疾病进展是指肿瘤增长、肿瘤原发病灶转移、发现新病灶等。
[0013]在本申请的实施例中，申请人发现受试者的HTR1A的表达水平与受试者的总体生存率等存在显著相关性，因而可以通过HTR1A的表达水平来预测受试者的生存率。进一步HTR1A的表达差异显示，其在肿瘤组织中表达显著降低，而且HTR1A表达较低的组中，患者的总体生存率降低。因此，可以根据HTR1A的表达水平对低级别胶质瘤患者的预后做出较为准确的预测。具体而言，可以给出一个HTR1A表达水平的设定值，该设定值可以根据正常人和/或非低级别胶质瘤患者的正常样本的HTR1A的表达水平而确定，例如，选择合适样本数量的正常样本的HTR1A的表达水平的平均值，或基于该平均值设定一个合理的倍数，如0.9倍、0.8倍、0.7倍、0.6倍、0.5倍等，当受试者的HTR1A的表达水平低于该设定值时，判断为低级别胶质瘤的预后较差。可以理解的是，基于平均值，或平均值的倍数所确定的设定值的需要具有良好的分类意义，可以通过基于该设定值的分类对已知样本采用常用的统计学检验方法进行检验，当结果具有统计学意义时，表明该设定值可以作为判断标准使用。可以理解的是，也可以将特定的一个或多个低级别胶质瘤患者数据库或实际的低级别胶质瘤诊断病例中HTR1A的表达水平进行排序，得到相应的中位值，以该中位值，或基于该平均值设定一个合理的倍数，如0.9倍、0.8倍、0.7倍、0.6倍、0.5倍等作为设定值，当受试者的HTR1A的表达水平低于该设定值时，判断为低级别胶质瘤的预后较差。进一步，设定值可以根据不同的预后水平而设定多个以形成相应的梯度，当HTR1A的表达水平落入其中一个梯度范围内，判断为预后的一种情况。
[0014]本申请实施例提供HTR1A作为低级别胶质瘤预后的标志物，因为在数据库分析中发现其在低级别胶质瘤的肿瘤组织中表达显著降低；同时，Kaplan
‑
Meier Plotter分析mRNA的表达同样发现随着HTR1A的表达降低，患者的总体生存率降低；而且多因素回归分析也表明，HTR1A可以作为低级别胶质瘤的预后因子。
[0015]本申请的第二方面，还提供一种低级别胶质瘤的预后产品，该预后产品包括定量检测HTR1A的试剂。
[0016]在本申请的一些实施方式中，试剂包括特异性扩增HTR1A的引物、特异性识别
HTR1A的探针、特异性识别HTR1A蛋白的抗体中的至少一种。
[0017]在本申请的一些实施方式中，预后产品还包括阳性对照品、阴性对照品、缓冲液中的至少一种。其中，阳性对照品和阴性对照品本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.定量检测HTR1A的试剂在制备用于低级别胶质瘤的预后产品中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂在基因水平或蛋白水平上定量检测HTR1A。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，在基因水平上定量检测HTR1A的所述试剂选自引物、探针和基因芯片。4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，在蛋白水平上定量检测HTR1A的所述试剂包括特异性抗体。5.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述预后包括预测受试者的生存率。6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于...

【专利技术属性】
技术研发人员：戴勇，张巍，汤冬娥，徐勇，蔡晚霞，
申请(专利权)人：深圳市人民医院，
类型：发明
国别省市：