密封蛋白-6抗体和药物缀合物制造技术

本公开提供了结合至密封蛋白

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】密封蛋白
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6抗体和药物缀合物
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2019年3月20日提交的美国临时申请第62/821,391号的权益，所述申请的全部内容以引用的方式整体并入本文。
[0003]以引用的方式并入电子提交的材料
[0004]以引用的方式整体并入本文的是与此同时提交并且如下标识的计算机可读核苷酸/氨基酸序列表：2019年3月20日创建的名为"54086P1_Seqlisting.txt"的338,714ASCII(文本)文件。

技术介绍

[0005]抗体构成了强大的治疗剂，其特征在于副作用有限，因为它们能够特异性地靶向细胞、细菌、病毒或毒素上的不同抗原。在1986年，第一种治疗性单克隆抗体Orthoclone OKT3被引入市场。从那时起，此类生物制药产品显著增长。在2014年底，美国或欧洲批准了47种单克隆抗体产品用于治疗多种疾病，包括癌症和炎症性疾病、心血管疾病、呼吸系统疾病和感染性疾病。
[0006]目前，美国食品和药品管理局批准了十多种单克隆抗体来治疗癌症。这些剂之中有阿仑单抗其被指出用于慢性淋巴细胞性白血病(CLL)；和曲妥珠单抗其用于治疗乳腺癌。将一些抗体用化学治疗药物标记，包括例如本妥昔单抗安适利(brentuximab vedotin)和Ado
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曲妥珠单抗恩美坦新(Ado
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trastuzumab emtansine)其他抗体产品，如博纳吐单抗(blinatumomab)(Blincyto)被设计来识别并结合至两种不同的抗原。尽管此类抗体产品的商业可获得性，但目前的癌症发病率和癌症死亡率仍然高。据报告，每年每100,000名男性和女性的癌症发病率超过450人，并且每年每100,000名男性和女性的癌症死亡率刚超过170人。

技术实现思路

[0007]本文提供了结合至密封蛋白
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6(CLDN6)的抗原结合蛋白。在各个方面，本公开的抗原结合蛋白结合至人CLDN6并且任选地结合至小鼠CLDN6。在各个方面，所述抗原结合蛋白结合至CLDN6的细胞外结构域(ECD)。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至CLDN6的ECD的细胞外环2(EL2)。在各个方面，所述抗原结合蛋白结合至EL2，并且不结合至CLDN6的ECD的细胞外环1(EL1)。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至人密封蛋白家族的另外成员，包括例如密封蛋白
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3(CLDN3)、密封蛋白
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4(CLDN4)和密封蛋白
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9(CLDN9)。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至CLDN6以及CLDN4和CLDN9中的至少一者。在各种情况下，所述抗原结合蛋白结合至CLDN6，并且不结合至密封蛋白家族的任何其他成员。在各个方面，所述抗原结合蛋白结合至由人卵巢癌细胞(例如OVCA429细胞)内源性表达的CLDN6，并且在FACS亲和力测定中表现出对OVCA429细胞的小于约1200nM的IC50。在各种情况下，本公开的抗原结合蛋白在没有任何其他部分附接至所述抗原结合蛋白的情况下抑制受试者(例如人)中的肿瘤生长。
[0008]在各个方面，抗原结合蛋白包含(a)SEQ ID NO:504或SEQ ID NO:507的重链CDR1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；(b)SEQ ID NO:505或SEQ ID NO:508的重链CDR2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；(c)SEQ ID NO:506或SEQ ID NO:509的重链CDR3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；(d)SEQ ID NO:449或SEQ ID NO:476的轻链CDR1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；(e)SEQ ID NO:450或SEQ ID NO:477的轻链CDR2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；(f)SEQ ID NO:451或SEQ ID NO:454的轻链CDR3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；和/或(g)(a)
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(f)中的任何两者或更多者的组合。
[0009]在各个方面，抗原结合蛋白包含(a)SEQ ID NO:490
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503中的任一个的重链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为S1
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S12的重链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；(b)SEQ ID NO:380
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383、388
‑
390、479和481中的任一个的轻链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为S1
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S12的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或(a)和(b)两者。
[0010]在各个方面，抗原结合蛋白包含选自由以下组成的组的一对氨基酸序列：(a)SEQ ID NO:389和490；(b)SEQ ID NO:389和491；(c)SEQ ID NO:389和492；(d)SEQ ID NO:389和493；(e)SEQ ID NO:389和494；(f)SEQ ID NO:389和495；(g)SEQ ID NO:383和496；(h)SEQ ID NO:383和497；(i)SEQ ID NO:383和498；(j)SEQ ID NO:383和499；(k)SEQ ID NO:383和500；(l)SEQ ID NO:383和501；(m)SEQ ID NO:383和503；(n)SEQ ID NO:389和502；(o)在图22中标记为S1的重链可变区序列和在图22中标记为S1的轻链可变区序列；(p)在图22中标记为S2的重链可变区序列和在图22中标记为S2的轻链可变区序列；(q)在图22中标记为S3的重链可变区序列和在图22中标记为S3的轻链可变区序列；(r)在图22中标记为S4的重链可变区序列和在图22中标记为S4的轻链可变区序列；(s)在图22中标记为S5的重链可变区序列和在图22中标记为S5的轻链可变区序列；(t)在图22中标记为S6的重链可变区序列和在图22中标记为S6的轻链可变区序列；(u)在图22中标记为S7的重链可变区序列和在图22中标记为S7的轻链可变区序列；(v)在图22中标记为S78的重链可变区序列和在图22中标记为S8的轻链可变区序列；(w)在图22中标记为S89的重链可变区序列和在图22中标记为S9的轻链可变区序列；(x)在图22中标记为S910的重链可变区序列和在图22中标记为S10的轻链可变区序列；(y)在图22中标记为S11的重链可变区序列和在图22中标记为S11的轻链可变区序列；或(z)在图22中标记为S1本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包括：a.SEQ ID NO:504或SEQ ID NO:507的重链CDR1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；b.SEQ ID NO:505或SEQ ID NO:508的重链CDR2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；c.SEQ ID NO:506或SEQ ID NO:509的重链CDR3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；d.SEQ ID NO:449或SEQ ID NO:476的轻链CDR1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；e.SEQ ID NO:450或SEQ ID NO:477的轻链CDR2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；f.SEQ ID NO:451或SEQ ID NO:454的轻链CDR3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；和/或g.(a)
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(f)中的任何两者或更多者的组合。2.如权利要求1所述的抗原结合蛋白，其中所述变体序列具有至少约80％或至少或约85％序列同一性。3.如权利要求2所述的抗原结合蛋白，其中所述变体序列具有至少约90％序列同一性或至少或约95％序列同一性。4.如权利要求1
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3中任一项的权利要求所述的抗原结合蛋白，其中：a.所述抗原结合蛋白结合至人密封蛋白6(CLDN6)蛋白(SEQ ID NO:200)；b.所述抗原结合蛋白结合至CLDN6的细胞外结构域(ECD)的细胞外环2(EL2)，并且不结合至CLDN6的所述ECD的细胞外环1(EL1)；c.不结合至密封蛋白3(CLDN3)、密封蛋白4(CLDN4)和密封蛋白9(CLDN9)中的任一者，并且以小于约1200nM抑制参考抗体与由OVCA429细胞内源性表达的CLDN6的结合；或d.它们的组合。5.如权利要求1
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4中任一项所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白结合至氨基酸序列WTAHAIIRDFYNPLVAEAQKREL(SEQ ID NO:2)内的表位。6.如权利要求5所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白结合至CLDN6的氨基酸序列TAHAIIRDFYNPL(SEQ ID NO:3)或LVAEAQKREL(SEQ ID NO:4)。7.如权利要求1至6中任一项所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白不结合至密封蛋白3(CLDN3)、密封蛋白4(CLDN4)和密封蛋白9(CLDN9)中的任何一者或更多者。8.如权利要求7所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白不结合至CLDN3。9.如权利要求8所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白结合至CLDN6、CLDN4和CLDN9。10.如权利要求8所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白不结合至CLDN9。11.如权利要求10所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白结合至CLDN6和CLDN4。12.如权利要求8所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白不结合至CLDN4。13.如权利要求12所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白结合至CLDN6和CLDN9。14.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包括SEQ ID NO:449的轻链CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:450的轻链CDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:451的
轻链CDR3氨基酸序列，以及SEQ ID NO:504的重链CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:505的重链CDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:506的重链CDR3氨基酸序列中的一个或两个。15.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包括SEQ ID NO:476的轻链CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:477的轻链CDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:454的轻链CDR3氨基酸序列，以及SEQ ID NO:507的重链CDR1氨基酸序列、SEQ ID NO:508的重链CDR2氨基酸序列和SEQ ID NO:509的重链CDR3氨基酸序列中的一个或两个。16.如权利要求11
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15中任一项所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包括选自由以下组成的组的六个CDR氨基酸序列：a.SEQ ID NO:449
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451和504
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506；以及b.SEQ ID NO:476、477、454和507
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509。17.如权利要求11
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16中任一项所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包括：a.SEQ ID NO:490
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503中的任一个的重链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为S1
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S12的重链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或b.SEQ ID NO:380
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383、388
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390、479和481中的任一个的轻链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为S1
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S12的轻链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或c.(a)和(b)两者。18.如权利要求17所述的抗原结合蛋白，其中所述变体序列具有至少约80％或至少约85％序列同一性。19.如权利要求18所述的抗原结合蛋白，其中所述变体序列具有至少约90％或至少约95％序列同一性。20.如权利要求17
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19中任一项所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包括一对氨基酸序列：a.SEQ ID NO:389和490；b.SEQ ID NO:389和491；c.SEQ ID NO:389和492；d.SEQ ID NO:389和493；e.SEQ ID NO:389和494；f.SEQ ID NO:389和495；g.SEQ ID NO:383和496；h.SEQ ID NO:383和497；i.SEQ ID NO:383和498；j.SEQ ID NO:383和499；k.SEQ ID NO:383和500；l.SEQ ID NO:383和501；m.SEQ ID NO:383和503；n.SEQ ID NO:389和502；o.在图22中标记为S1的重链可变区序列和在图22中标记为S1的轻链可变区序列；
p.在图22中标记为S2的重链可变区序列和在图22中标记为S2的轻链可变区序列；q.在图22中标记为S3的重链可变区序列和在图22中标记为S3的轻链可变区序列；r.在图22中标记为S4的重链可变区序列和在图22中标记为S4的轻链可变区序列；s.在图22中标记为S5的重链可变区序列和在图22中标记为S5的轻链可变区序列；t.在图22中标记为S6的重链可变区序列和在图22中标记为S6的轻链可变区序列；u.在图22中标记为S7的重链可变区序列和在图22中标记为S7的轻链可变区序列；v.在图22中标记为S78的重链可变区序列和在图22中标记为S8的轻链可变区序列；w.在图22中标记为S89的重链可变区序列和在图22中标记为S9的轻链可变区序列；x.在图22中标记为S910的重链可变区序列和在图22中标记为S10的轻链可变区序列；y.在图22中标记为S11的重链可变区序列和在图22中标记为S11的轻链可变区序列；或z.在图22中标记为S12的重链可变区序列和在图22中标记为S12的轻链可变区序列。21.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白是抗体。22.如权利要求21所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白是单克隆抗体。23.如权利要求21或22所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白是IgG。24.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白在软琼脂3D增殖测定中抑制至少约50％的集落生长。25.如前述权利要求中任一项所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白抑制注射有人癌细胞的异种移植小鼠中的肿瘤生长。26.如权利要求25所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白抑制注射有卵巢癌细胞、黑素瘤癌细胞、膀胱癌细胞或子宫内膜癌细胞的异种移植小鼠中的肿瘤生长。27.如权利要求26所述的抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白抑制注射有卵巢癌细胞、膀胱癌细胞或子宫内膜癌细胞的异种移植小鼠中的至少50％的肿瘤生长。28.一种抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包括：a.SEQ ID NO:504或SEQ ID NO:507的重链CDR1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；b.SEQ ID NO:505或SEQ ID NO:508的重链CDR2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；c.SEQ ID NO:506或SEQ ID NO:509的重链CDR3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；d.SEQ ID NO:449或SEQ ID NO:476的轻链CDR1氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；e.SEQ ID NO:450或SEQ ID NO:477的轻链CDR2氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；f.SEQ ID NO:451或SEQ ID NO:454的轻链CDR3氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或g.(a)
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(f)中的任何两者或更多者的组合。29.一种抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包括选自由以下组成的组的六个CDR氨基酸序列：a.SEQ ID NO:449
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451和504
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506；以及
b.SEQ ID NO:476、477、454和507
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509。30.一种抗原结合蛋白，所述抗原结合蛋白包括：a.SEQ ID NO:490
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503中的任一个的重链可变区氨基酸序列，或在图22中标记为S1
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S12的重链可变区氨基酸序列，或其仅相差一个或两个氨基酸或具有至少或约70％序列同一性的变体序列；或b.SEQ ID NO:380
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383、388
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【专利技术属性】
技术研发人员：D，
申请(专利权)人：加利福尼亚大学董事会，
类型：发明
国别省市：