测序仪成像对焦方法及装置、设备、存储介质制造方法及图纸

技术编号:32288998 阅读:46 留言:0更新日期:2022-02-12 19:57
本发明专利技术属于基因测序技术领域,公开了一种测序仪成像对焦方法及装置、设备、存储介质,通过在对测序仪的物镜执行初始调焦过程以确定目标位置之后,当物镜在目标位置拍摄获得目标图像时,对目标图像进行清晰度评分,若目标图像的清晰度评分小于评分阈值,对物镜执行重新调焦过程以重新确定目标位置,并重复执行拍摄目标图像进行清晰度评分的步骤,直至目标图像的清晰度评分大于或等于评分阈值;其中,重新调焦过程包括初始调焦过程的全部或部分步骤;可以实现实时自动对焦,即便在对同一测序样品进行测序的过程中,也可以保证一直捕获到清晰图像,更准确地识别碱基,可以提高测序仪的工作效率和准确度。作效率和准确度。作效率和准确度。

【技术实现步骤摘要】
测序仪成像对焦方法及装置、设备、存储介质


[0001]本专利技术属于基因测序
,具体涉及一种测序仪成像对焦方法及装置、设备、存储介质。

技术介绍

[0002]工作距离,指的是调准焦点时的物镜前缘与样品表面的距离。理论工作距离,指的是产品手册中对物镜说明时标注的工作距离。
[0003]在基因测序仪的应用领域,碱基识别是高通量基因测序的核心环节,它主要是指从含有碱基信息的荧光点图中获得基因序列信息。目前都是通过相机捕获荧光点图,但是每次拍摄的时候,荧光点的位置都会改变,都需要进行微小距离调整及成像质量实时判断,才能捕获清晰的图像。这种手动对焦的方式,使得测序仪的工作效率和准确度都比较低。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于提供一种测序仪成像对焦方法及装置、设备、存储介质,可以实现自动对焦,实时捕获不同样品的清晰图像,提高测序仪的工作效率和准确度。
[0005]本专利技术实施例第一方面公开一种测序仪成像对焦方法,包括:
[0006]对所述测序仪的物镜执行初始调焦过程,以确定目标位置;
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.测序仪成像对焦方法,其特征在于,包括:对所述测序仪的物镜执行初始调焦过程,以确定目标位置;控制所述物镜在所述目标位置对测序样品进行拍摄,获得目标图像;确定所述目标图像中的多个荧光样品点;将所述多个荧光样品点划分为清晰样品点、模糊样品点和错误样品点;将清晰样品点数量、模糊样品点数量、错误样品点数量、各个所述荧光样品点的灰度值和边长作为输入数据,输入至预先构建好的清晰度评分模型,得到所述目标图像的清晰度评分;若所述目标图像的清晰度评分小于评分阈值,对所述物镜执行重新调焦过程,以重新确定目标位置,并重复执行所述控制所述物镜在所述目标位置对测序样品进行拍摄获得目标图像的步骤,直至所述目标图像的清晰度评分大于或等于所述评分阈值;其中,所述重新调焦过程包括所述初始调焦过程的全部或部分步骤。2.如权利要求1所述的测序仪成像对焦方法,其特征在于,所述确定所述目标图像中的多个荧光样品点,包括:计算所述目标图像的每一个像素点的灰度值;将所述灰度值达到灰度阈值的像素点确定为荧光像素点;判断以所述荧光像素点为中心的九宫格域内的荧光像素点数量是否至少为二;若是,判定所述九宫格域内的所有荧光像素点连续,且属于同一个荧光样品点;若否,判定所述荧光像素点为荧光样品点的边界点;遍历所述目标图像的各个所述荧光像素点之后,获得多个荧光样品点。3.如权利要求1所述的测序仪成像对焦方法,其特征在于,所述将所述多个荧光样品点划分为清晰样品点、模糊样品点和错误样品点,包括:将各个所述荧光样品点投影到X轴和Y轴,获得各个所述荧光样品点的投影数据;根据所述投影数据,确定出荧光像素点最多的一边的荧光像素点数量作为所述荧光样品点的边长;若任一荧光样品点的边长小于或等于清晰阈值,判定该荧光样品点为清晰样品点;若任一荧光样品点的边长大于所述清晰阈值,且小于或等于模糊阈值,判定该荧光样品点为模糊样品点;若任一荧光样品点的边长大于所述模糊阈值,判定该荧光样品点为错误样品点。4.如权利要求1至3任一项所述的测序仪成像对焦方法,其特征在于,所述初始调焦过程包括粗调焦步骤、中调焦步骤和细调焦步骤;其中,所述粗调焦步骤包括:确定所述物镜满足理论工作距离的理论位置,从位于所述理论位置上方的第一起点开始,控制所述物镜以第一指定步长每向下移动一次,拍摄获得一个样品图像,并对所述样品图像进行清晰度评分,直至所述样品图像的清晰度评分与粗调焦理想评分的接近度量值满足预设条件;根据粗调焦过程获得的多个样品图像的清晰度评分,确定出粗调焦过程最高分时所述物镜的第一位置;其中,所述第一起点与所述理论位置的距离为第一距离;所述中调焦步骤包括:从位于所述第一位置上方的第二起点开始,控制所述物镜以第二指定步长每向下移动一次,拍摄获得一个样品图像,并对所述样品图像进行清晰度评分,
直至所述样品图像的清晰度评分与中调焦理想评分的接近度量值满足所述预设条件;根据中调焦过程获得的多个样品图像的清晰度评分,确定出中调焦过程最高分时所述物镜的第二位置;其中,所述第二指定步长小于所述第一指定步长,所述第二起点与所述第一位置的距离为第二距离,所述第二距离小于所述第一距离;所述细调焦步骤包括:从位于所述第二位置上方的第三起点开始,控制所述物...

【专利技术属性】
技术研发人员:张必良辜键洲J奥维利
申请(专利权)人:广州市锐博生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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