【技术实现步骤摘要】
一种模块化的单细胞快速分析系统构建方法
[0001]本专利技术属于单细胞分析
,具体涉及一种模块化的单细胞快速分析系统构建方法。
技术介绍
[0002]单细胞分析技术是一种具有高灵敏度、高选择性、高时空分辨等特点的新型细胞研究技术,目前常见的单细胞分析技术有单细胞分离、单细胞测序(single cell sequencing)等。
[0003]单细胞分离常用的方法有流式细胞分离法。单细胞测序技术是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术。它能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性,在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域发挥重要作用,正成为生命科学研究的焦点。且该技术由于灵敏度和准确度高,非常适用于生物学和医学检测。但现在的单细胞分析没有形成体系,且分析过程差别较大,因此需要构建一种模块化的单细胞快速分析系统。
技术实现思路
[0004]为了克服上述现有技术的不足,本专利技术提供了一种模块化的单细胞快速分析系统构建方法,该方法用于构建一种 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种模块化的单细胞快速分析系统构建方法,其特征在于:具体包括如下,(1)对新鲜的组织样本通过酶解等方式制备单细胞,对分选出的单细胞进行高通量测序,获得原始数据(Raw data),对原始数据进行预处理(质控),然后对细胞进行测序信息分析,获得质控后细胞测序数据信息;(2)根据细胞测序数据信息对数据标准化,将细胞分群,进行细胞亚群分析,使用软件采用相应的算法对细胞类型进行判断;(3)对分群后的细胞进行生物信息学分析,包括功能描述、细胞演化和机制分析等。2.根据权利要求1所述的一种模块化的单细胞快速分析系统构建方法,其特征在于:所述(1)中的细胞进行预处理包括:表达量统计、细胞数量判断、基因组对比、数据过滤。3.根据权利要求1所述的一种模块化的单细胞快速分析系统构建方法,其特征在于:所述(2)中的数据标准化的方法为:将细胞分群,使用软件对细胞类型进行判断。4.根据权利要求1所述的一种模块化的单细胞快速分析系统构建方法,其特征在于:所述(2)中细胞亚群分析包括细胞特征基因分析。5.根据权利要求4所述的一种模块化的单细胞快速分析系统构建方法,其特征在于:所述细胞特征基因分析的方法为:对于每个细胞亚群,将基因表达值与其他所有亚群做比较,获得每个亚群中差异高表达的基因,并且按照log2FoldChange从大到小排列选取靠前的若干基因作为候选特征基因。6.根据权利要求1所述的一种模块化的单细胞快速分析系统构建方法,其特征在于:所述(2)中的数据标准化的方法,将细胞分群的方法为:对细...
【专利技术属性】
技术研发人员:张博,陈伟东,
申请(专利权)人:江西烈冰生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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