一种糖肽表位预测方法、存储介质及终端设备技术

本发明专利技术公开了一种糖肽表位预测方法、存储介质及终端设备，其中，方法包括步骤：基于天然主要组织相容性复合体数据，构建抗原呈递概率预测模型；从糖肽数据库中收集肽段糖基化位点信息及其对应的肽段序列，构建糖基化位点数据集；基于所述糖基化位点数据集，构建糖基化位点预测模型；将待预测肽段序列输入所述抗原呈递概率预测模型，预测所述待预测肽段序列的抗原呈递分数；将抗原呈递分数大于阈值的待预测肽段序列输入所述糖基化位点预测模型，预测所述待预测肽段序列的糖基化位点。通过本发明专利技术方法能够直接预测糖肽的免疫原性，在提高肽段筛选效率的同时，能够更准确地预测具有免疫原性的糖肽，为疫苗设计、自身免疫以及癌症的研究提供重要工具。提供重要工具。提供重要工具。

【技术实现步骤摘要】
一种糖肽表位预测方法、存储介质及终端设备


[0001]本专利技术涉及神经网络模型应用
，尤其涉及一种糖肽表位预测方法、存储介质及终端设备。

技术介绍

[0002]主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex，MHC)是哺乳动物基因组中负责编码部分免疫系统的基因簇，在哺乳动物的移植排斥反应、免疫应答和免疫调控等方面起着重要的作用。在免疫应答过程中，抗原呈递细胞吞噬、摄取含有蛋白大分子的抗原性异物，并将经过处理的含有表位的多肽片段与MHC类分子结合，并于细胞表面呈递给T细胞。MHC I类分子将胞内抗原肽呈递给细胞毒性T细胞，MHC II类分子将胞外抗原肽呈递给辅助T细胞刺激细胞免疫和体液免疫。因此，识别哪些肽段能和MHC分子结合对理解宿主与病原体的相互作用十分重要，对疫苗设计、传染病、自身免疫和癌症的研究起着关键步骤。
[0003]蛋白质糖基化是一种高度异质性的翻译后修饰，参与细胞信号转导、细胞粘附以及细胞识别等多种生物学过程，主要包括蛋白质N
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糖基化和蛋白质O
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种糖肽表位预测方法，其特征在于，包括步骤：基于天然主要组织相容性复合体数据，构建抗原呈递概率预测模型；从糖肽数据库中收集肽段糖基化位点信息及其对应的肽段序列，构建糖基化位点数据集；基于所述糖基化位点数据集，构建糖基化位点预测模型；将待预测肽段序列输入所述抗原呈递概率预测模型，预测所述待预测肽段序列的抗原呈递分数；将抗原呈递分数大于阈值的待预测肽段序列输入所述糖基化位点预测模型，预测所述待预测肽段序列的糖基化位点。2.根据权利要求1所述的糖肽表位预测方法，其特征在于，所述基于天然主要组织相容性复合体数据，构建抗原呈递概率预测模型的步骤包括：测量天然主要组织相容性复合体的结合肽段与主要组织相容性复合体之间的亲和力大小，获得亲和力测量数据；基于所述亲和力测量数据构建亲和力预测模型；使用单等位基因样本的质谱数据，构建抗原加工预测模型；结合所述亲和力预测模型和所述抗原加工预测模型，构建抗原呈递概率预测模型。3.根据权利要求1所述的糖肽表位预测方法，其特征在于，所述糖肽数据库包括dbPTM数据库、U...

【专利技术属性】
技术研发人员：毛家维，王鹏，
申请(专利权)人：南方科技大学，
类型：发明
国别省市：