【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】finegoldii)、约氏乳杆菌(Lactobacillus johnsonii)、堆肥副土地杆菌(Parapedobacter composti)和Anaerotignum lactatifermentans或图28C中公开的细菌种，并且其中所述方法还包括用(i)PD
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1、PDL1或PDL2抑制剂和(ii)CTLA
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4、B7
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1或B7
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2抑制剂的组合治疗对象。在一些实施方案中，组合物包含至少一种属于以下的属或种中的一者或多于一者的经分离或经纯化的细菌群体：解黄酮菌属、拟杆菌属、丁酸单胞菌属、Dielma、阿克曼氏菌属、别样杆菌属、粪便拟杆菌(Bacteroides stercoris)、狄氏副拟杆菌、Fournierella、Fournierella massiliensis、嗜粪拟杆菌(Bacteroides coprophilus)、Eisenbergiella tayi、蒂西耶氏菌目、Hungateiclostridium thermocellum。
[0008]在另一...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种治疗对象的癌症的方法，所述方法包括：(a)向所述对象施用包含至少一种属于以下的属或种中的一者或多于一者的经分离或经纯化的细菌群体的组合物：解黄酮菌属、Dielma、阿克曼氏菌属、别样杆菌属、拟杆菌属、丁酸单胞菌属、吸血弧菌属、泰泽氏菌属、狄氏副拟杆菌、Fournierella、Fournierella massiliensis、Eisenbergiella tayi、蒂西耶氏菌目、Hungateiclostridium thermocellum、长链多尔氏菌、柯氏喜热菌、Muricomes、地生孢杆菌、沼泽普雷沃氏菌、嗜黑麦乳杆菌、芬氏拟杆菌、约氏乳杆菌、堆肥副土地杆菌和Anaerotignum lactatifermentans；和(b)用(i)PD
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1、PDL1或PDL2抑制剂和(ii)CTLA
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4、B7
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1或B7
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2抑制剂的组合治疗所述对象。2.根据权利要求1所述的方法，其中所述组合物包含至少一种属于以下的属或种中的一者或多于一者的经分离或经纯化的细菌群体：解黄酮菌属、拟杆菌属、丁酸单胞菌属、Dielma、阿克曼氏菌属、别样杆菌属、粪便拟杆菌、狄氏副拟杆菌、Fournierella、Fournierella massiliensis、嗜粪拟杆菌、Eisenbergiella tayi、蒂西耶氏菌目、Hungateiclostridium thermocellum。3.根据权利要求2所述的方法，其中所述组合物包含至少一种属于阿克曼氏菌属的经分离或经纯化的细菌群体。4.根据权利要求1所述的方法，其中所述组合物包含至少一种属于以下的属或种中的一者或多于一者的经分离或经纯化的细菌群体：脆弱拟杆菌、吸血弧菌属、泰泽氏菌属、长链多尔氏菌、柯氏喜热菌、Muricomes、Muricomes intestini、地生孢杆菌、地下地生孢杆菌、Anaerotignum lactatifermentans。5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述癌症为皮肤癌。6.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述癌症为基底细胞皮肤癌、鳞状细胞皮肤癌、黑色素瘤、隆凸性皮肤纤维肉瘤、默克尔细胞癌、卡波西肉瘤、角化棘皮瘤、梭形细胞肿瘤、皮脂腺癌、微囊性附属器癌、乳腺佩吉特病、非典型纤维黄瘤、平滑肌肉瘤或血管肉瘤。7.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述癌症为黑色素瘤。8.根据权利要求7所述的方法，其中所述黑色素瘤为转移性黑色素瘤、恶性雀斑样痣、恶性雀斑样痣黑色素瘤、浅表扩散性黑色素瘤、结节性黑色素瘤、肢端雀斑样痣黑色素瘤、皮肤黑色素瘤或促结缔组织增生性黑色素瘤。9.根据权利要求8所述的方法，其中所述黑色素瘤包括皮肤黑色素瘤。10.根据权利要求1至9中任一项所述的方法，其中所述方法还包括施用至少一种附加的抗癌治疗。11.根据权利要求10所述的方法，其中所述至少一种附加的抗癌治疗为手术疗法、化学疗法、放射疗法、激素疗法、免疫疗法、小分子疗法、受体激酶抑制剂疗法、抗血管生成疗法、细胞因子疗法、冷冻疗法或生物疗法。12.根据权利要求1至11中任一项所述的方法，其中所述(i)的抑制剂、(ii)的抑制剂和/或至少一种附加的抗癌治疗通过瘤内、动脉内、静脉内、血管内、胸膜内、腹膜内、气管内、鞘内、肌肉内、内镜下、病灶内、经皮、皮下、区域性地、定向地、经口或通过直接注射或灌
注施用。13.根据权利要求1至12中任一项所述的方法，其中所述方法定义为在诊断为患有癌性肿瘤的对象中治疗癌症的方法。14.根据权利要求1至13中任一项所述的方法，其中所述方法包括或还包括减少或预防一种或多于一种不良事件。15.根据权利要求1至14中任一项所述的方法，其中所述方法包括或还包括减少或预防一种或多于一种严重的不良事件。16.根据权利要求14或15所述的方法，其中所述不良事件或严重的不良事件还被归类为免疫相关的不良事件。17.根据权利要求1至16中任一项所述的方法，其中已确定所述对象在肠道微生物组中具有不利的微生物分布型。18.根据权利要求17所述的方法，其中所述不利的分布型包括包含属于拟杆菌属、戴阿利斯特菌属、Coprobacter、Intestinibacter和副萨特氏菌属中的一者或多于一者的细菌的细菌群体。19.根据权利要求18所述的方法，其中所述不利的分布型包括包含粪便拟杆菌、粪拟杆菌、肠道拟杆菌、Coprobacter、Intestinibacter bartletti、Parasutterella secunda和产丙酸戴阿利斯特菌中的一者或多于一者的细菌群体。20.根据权利要求18或19所述的方法，其中所述不利的分布型还定义为毒性相关的分布型。21.根据权利要求17所述的方法，其中所述不利的分布型包括包含属于以下的属中的一者或多于一者的细菌的细菌群体：乳杆菌属、拟杆菌属、普雷沃氏菌属、柠檬酸杆菌属、梭菌属、Hungateiclostridium、真杆菌属、哈夫尼菌科、肠杆菌属、哈夫尼菌属、罗斯伯里氏菌属、魏斯氏菌属、芽孢杆菌属、乳酸杆菌属和克雷伯氏菌属。22.根据权利要求21所述的方法，其中所述不利的分布型包括包含以下中的一者或多于一者的细菌群体：罗氏乳杆菌、脆弱拟杆菌、粪源普雷沃氏菌、沙氏普雷沃氏菌、海氏梭菌、Hungateiclostridium aldrichii、鼠柠檬酸杆菌、沟迹真杆菌、弗氏柠檬酸杆菌、霍氏真杆菌、阴沟肠杆菌、蜂房哈夫尼菌、人罗斯拜瑞氏菌、类肠膜魏斯氏菌和产气克雷伯氏菌。23.根据权利要求21或22所述的方法，其中所述不利的分布型还定义为无应答者分布型。24.根据权利要求17至23中任一项所述的方法，其中通过分析来自所述对象的样本中的微生物组确定所述对象包含不利的微生物分布型。25.根据权利要求24所述的方法，其中所述样本为粪便样本。26.根据权利要求24或25所述的方法，其中所述分析包括进行16S核糖体测序和/或宏基因组学全基因组测序。27.根据权利要求1至26中任一项所述的方法，其中所述对象先前已接受过针对癌症的治疗。28.根据权利要求27所述的方法，其中已确定所述对象是对先前的治疗的无应答者。29.根据权利要求27或28所述的方法，其中已确定所述患者对先前的治疗具有毒性应答。
30.根据权利要求27
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29中任一项所述的方法，其中先前的治疗包括免疫检查点阻断单一疗法或联合疗法。31.根据权利要求30所述的方法，其中所述先前的治疗包括仅包含PD
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1、PDL1、PDL2、CTLA
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4、B7
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1或B7
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2抑制剂中一种的免疫检查点阻断单一疗法。32.根据权利要求1至31中任一项所述的方法，其中所述癌症是复发性的。33.根据权利要求1至32中任一项所述的方法，其中所述(i)的抑制剂为抗PD
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1单克隆抗体和/或所述(ii)的抑制剂为抗CTLA
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4单克隆抗体。34.根据权利要求33所述的方法，其中(i)包括纳武单抗、帕博利珠单抗或匹地利珠单抗。35.根据权利要求33或34所述的方法，其中(ii)包括伊匹单抗或曲美木单抗。36.根据权利要求1至35中任一项所述的方法，其中在(i)和(ii)中的所述治疗之前或同时用所述经分离的细菌群体治疗所述对象。37.根据权利要求1至36中任一项所述的方法，其中所述经纯化的细菌群体包含来自至少两个属或种的细菌，并且其中所述两种细菌的比为1:1。38.根据权利要求1至37中任一项所述的方法，其中所述组合物包含至少2个不同的细菌种或属、或细菌属。39.根据权利要求1至38中任一项所述的方法，其中所述组合物在向所述对象施用后提供至少5的α多样性。40.根据权利要求1至39中任一项所述的方法，其中所述对象已被诊断为患有III期或IV期癌症。41.根据权利要求1至40中任一项所述的方法，其中所述癌症包括III期或IV期癌症。42.根据权利要求1至41中任一项所述的方法，其中所述方法还包括施用抗生素。43.根据权利要求42所述的方法，其中在施用所述包含至少一种经分离或经纯化的细菌群体的组合物之前或同时施用所述抗生素。44.一种在对象中治疗癌症的方法，所述方法包括向确定在肠道微生物组中具有有利的微生物分布型的对象施用(i)PD
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1、PDL1或PDL2抑制剂和(ii)CTLA
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4、B7
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1或B7
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2抑制剂的组合。45.根据权利要求44所述的方法，其中所述癌症为皮肤癌。46.根据权利要求44所述的方法，其中所述癌症为基底细胞皮肤癌、鳞状细胞皮肤癌、黑色素瘤、隆凸性皮肤纤维肉瘤、默克尔细胞癌、卡波西肉瘤、角化棘皮瘤、梭形细胞肿瘤、皮脂腺癌、微囊性附属器癌、乳腺佩吉特病、非典型纤维黄瘤、平滑肌肉瘤或血管肉瘤。47.根据权利要求44所述的方法，其中所述癌症为黑色素瘤。48.根据权利要求47所述的方法，其中所述黑色素瘤为转移性黑色素瘤、恶性雀斑样痣、恶性雀斑样痣黑色素瘤、浅表扩散性黑色素瘤、结节性黑色素瘤、肢端雀斑样痣黑色素瘤、皮肤黑色素瘤或促结缔组织增生性黑色素瘤。49.根据权利要求48所述的方法，其中所述黑色素瘤包括皮肤黑色素瘤。50.根据权利要求44至49中任一项所述的方法，其中所述方法还包括施用至少一种附加的抗癌治疗。51.根据权利要求50所述的方法，其中所述至少一种附加的抗癌治疗为手术疗法、化学
疗法、放射疗法、激素疗法、免疫疗法、小分子疗法、受体激酶抑制剂疗法、抗血管生成疗法、细胞因子疗法、冷冻疗法或生物疗法。52.根据权利要求44至51中任一项所述的方法，其中所述(i)的抑制剂、(ii)的抑制剂和/或至少一种附加的抗癌治疗通过瘤内、动脉内、静脉内、血管内、胸膜内、腹膜内、气管内、鞘内、肌肉内、内镜下、病灶内、经皮、皮下、区域性地、定向地、经口或通过直接注射或灌注施用。53.根据权利要求44至52中任一项所述的方法，其中所述方法定义为在患有癌性肿瘤的对象中治疗癌症的方法。54.根据权利要求44至53中任一项所述的方法，其中治疗癌症包括减少或预防一种或多于一种不良事件。55.根据权利要求44至53中任一项所述的方法，其中治疗癌症包括减少或预防一种或多于一种严重的不良事件。56.根据权利要求54或55所述的方法，其中所述不良事件或严重的不良事件还被归类为免疫相关的不良事件。57.根据权利要求44至56中任一项所述的方法，其中所述有利的分布型包括包含属于以下的属或种中的一者或多于一者的细菌的细菌群体：脆弱拟杆菌、吸血弧菌属、泰泽氏菌属、长链多尔氏菌、柯氏喜热菌、Muricomes、Muricomes intestini、地生孢杆菌、地下地生孢杆菌、Anaerotignum lactatifermentans。58.根据权利要求57所述的方法，其中所述有利的分布型包括包含脆弱拟杆菌、吸血弧菌属和泰泽氏菌属中的一者或多于一者的细菌群体。59.根据权利要求57或58所述的方法，其中所述有利的分布型还定义为无毒性分布型。60.根据权利要求44至56中任一项所述的方法，其中所述有利的分布型包括包含属于以下的属或种中的一者或多于一者的细菌的细菌群体：解黄酮菌属、拟杆菌属、丁酸单胞菌属、Dielma、阿克曼氏菌属、别样杆菌属、粪便拟杆菌、狄氏副拟杆菌、Fournierella、Fournierella massiliensis、嗜粪拟杆菌、Eisenbergiella tayi、蒂西耶氏菌目、Hungateiclostridium thermocellum。61.根据权利要求60所述的方法，其中所述有利的分布型包括包含粪便拟杆菌、Butyricimonas faecihominis、珀氏解黄酮菌、Dielma fastidiosa、别样杆菌属和嗜黏蛋白阿克曼氏菌中的一者或多于一者的细菌群体。62.根据权利要求60或61所述的方法，其中所述有利的分布型还定义为有效的分布型。63.根据权利要求44至62中任一项所述的方法，其中通过分析来自所述对象的样本中的微生物组确定所述对象包含有利的微生物分布型。64.根据权利要求63所述的方法，其中所述样本为粪便样本或口腔样本。65.根据权利要求63或64所述的方法，其中分析包括进行16S核糖体测序和/或宏基因组学全基因组测序。66.根据权利要求44至65中任一项所述的方法，其中所述对象先前已接受过针对癌症的治疗。67.根据权利要求66所述的方法，其中已确定所述对象是对先前的治疗的无应答者。68.根据权利要求66或67所述的方法，其中已确定所述患者对先前的治疗具有毒性应
答。69.根据权利要求66至68中任一项所述的方法，其中先前的治疗包括免疫检查点阻断单一疗法或联合疗法。70.根据权利要求69所述的方法，其中所述先前的治疗包括仅包含PD
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1、PDL1、PDL2、CTLA
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4、B7
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1或B7
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2抑制剂中一种的免疫检查点阻断单一疗法。71.根据权利要求44至70中任一项所述的方法，其中所述癌症是复发性的。72.根据权利要求44至71中任一项所述的方法，其中所述(i)和/或(ii)的抑制剂为抗PD
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1单克隆抗体或抗CTLA
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4单克隆抗体。73.根据权利要求72所述的方法，其中(i)包含纳武单抗、帕博利珠单抗或匹地利珠单抗。74.根据权利要求72或73所述的方法，其中(ii)包含伊匹单抗或曲美木单抗。75.根据权利要求44至62中任一项所述的方法，其中所述对象先前未接受过免疫检查点阻断单一或联合疗...
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