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固相识别雌激素受体的雌二醇衍生物筛选方法技术

技术编号:30645708 阅读:29 留言:0更新日期:2021-11-04 00:52
本发明专利技术公开了一种固相识别雌激素受体的雌二醇衍生物筛选方法。该方法包括:以雌二醇

【技术实现步骤摘要】
固相识别雌激素受体的雌二醇衍生物筛选方法


[0001]本专利技术涉及生物材料
,特别是涉及一种固相识别雌激素受体的雌二醇衍生物筛选方法。

技术介绍

[0002]核雌激素受体,也常被简称为雌激素受体,是雌激素导致的内分泌干扰效应的重要作用位点。经典的雌激素基因组信号通路研究表明,雌激素(即雌激素受体的配体)通过结合雌激素受体的LBD(配体结合结构域,Ligand binding domain)区域,使雌激素受体发生变构,变构体在相关转录辅助调节因子(共激活因子或共抑制因子)的共同作用下,通过与目标基因序列上的雌激素响应元件结合与否,诱导或抑制特定基因的表达。其中雌激素与雌激素受体蛋白结合是调控响应基因表达从而产生效应的分子起始事件,该过程具有高度的专一性,理论上可以结合所有经核受体通路发挥不良效应的环境雌激素。根据雌激素与雌激素受体相互作用发展起来的体外生物检测技术具有灵敏度高、操作费用低、实验周期短、伦理道德上可接受等优点备受关注。
[0003]在体外生物检测技术构建中,常需要设计雌二醇衍生物,用其合成雌二醇<br/>‑
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种固相识别雌激素受体的雌二醇衍生物筛选方法,其特征在于,所述筛选方法包括:以雌二醇

雌激素受体LBD复合物晶体构象为基础,运用分子对接对不同结构雌二醇衍生物与雌激素受体LBD的结合能力进行计算机模拟分析,筛选出满足预设要求的雌二醇衍生物;对筛选出的雌二醇衍生物,采用分子动力学模拟进行结构稳定性和能量变化的分析,筛选出与雌激素受体LBD具有高特异性高亲和力的衍生物。2.根据权利要求1所述的固相识别雌激素受体的雌二醇衍生物筛选方法,其特征在于,所述的采用分子动力学模拟进行结构稳定性和能量变化的分析的步骤之前,还包括:根据筛选出的雌二醇衍生物,以及雌二醇

雌激素受体LBD晶体结构,建立分子动力学模拟的复合物初始结构;将所述复合物初始结构采用Gromacs程序进行检查,排除掉发生原子位置冲突的雌二醇衍生物

雌激素受体LBD复合物。3.根据权利要求2所述的固相识别雌激素受体的雌二醇衍生物筛选方法,其特征在于,所述的采用分子动力学模拟进行结构稳定性和能量变化的分析的步骤之前,还包括:根据复合物初始结构中雌二醇衍生物的连接臂尾端在雌激素受体LBD结合口袋外的暴露程度进行筛选。4.根据权利要求1所述的固相识别雌激素受体的雌二醇衍生物筛选方法,其特征在于,采用分子动力学模拟进行结构稳定性和能量变化的分析,根据分子动力学模拟分析得到的模拟轨迹和构象变化进行筛选。5.根据权利要求4所述的固相识别雌激素受体的雌二醇衍生物筛选方法,其特征在于,所述的根据分子动力学模拟分析得到的模拟轨迹和构象变化进行筛选的步骤中,包括:根据分子动力学模拟分析结果提取关键指标,根据所述关键指标进行筛选;其中,所述关键指标包括均方根偏差、均方根涨落、结合能和氢键数目...

【专利技术属性】
技术研发人员:周小红朱茜谭集穗
申请(专利权)人:清华大学
类型:发明
国别省市:

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