集成工作流中低拷贝数核酸的增强的检测制造技术

技术编号:30414963 阅读:25 留言:0更新日期:2021-10-24 16:19
本发明专利技术涉及在自动化或半自动化平台上的集成工作流中检测低拷贝数核酸的方法和策略。本发明专利技术的方法打开了扩展已经开发的自动化工作流的范围的可能性,以使它们甚至能够处理非常稀释的样品,例如体液,包括液体活检。包括液体活检。包括液体活检。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】集成工作流中低拷贝数核酸的增强的检测
专利

[0001]本专利技术涉及在自动化或半自动化平台上的集成工作流中检测低拷贝数核酸的方法和策略。本专利技术的方法打开了扩展已经开发的自动化工作流的范围的可能性,以使它们甚至能够处理非常稀释的样品,例如体液,包括液体活检。
[0002]专利技术背景
[0003]在监测患者的生理和/或病理状态中,液体活检研究引起了很多关注。这主要是因为它提供了非侵入性采样,从而潜在地允许早期诊断和频繁监测。一个很好的例子是在癌症的早期阶段检测体液中的循环肿瘤标志物(ctDNA)。但是,由于它们的负载对每个样品量而言非常低,因此其有效检测非常具有挑战性,并且不仅需要高度灵敏和稳健的诊断测定,而且还需要具有处理大样品量的能力。
[0004]当前存在使用诊断流体盒来提供稳健的遗传标志物测试的几种出色的高度灵敏的平台。这种系统的优点之一是其紧凑的手持式设计,其极大地促进了易用性和存储方面的考虑。鉴于尺寸最小化是即时医疗(POC)设备的普遍趋势,并且其中许多设备使用基于二氧化硅的Boom提取技术,该技术需要大量试剂,包括例如促本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种在包括提取室和扩增室的自动化系统中检测低拷贝数核酸的方法,所述方法包括:

向自动化系统的提取室提供包含低拷贝数核酸的样品,所述提取室包括用于DNA吸附的二氧化硅表面并且与加热器相邻;

将核酸吸附至二氧化硅表面;

在二氧化硅表面的存在下进行核酸的预扩增;

从二氧化硅表面洗脱预扩增的核酸;

将预扩增的核酸运输至自动化系统的扩增室,所述扩增室与提取室流体连接;

在所述扩增室中扩增预扩增的核酸;其中自动化系统被配置为将预扩增反应仅定位在二氧化硅表面的占据提取室的与加热器相邻的区域的部分,并且在提取室内的二氧化硅表面的剩余部分保持基本上没有预扩增反应。2.根据权利要求1所述的方法,其中通过压力控制来完成定位。3.根据权利要求2所述的方法,其中预扩增包括在最高温度与最低温度之间的对称热循环。4.根据前述权利要求中的任一项所述的方法,其中将最高温度和最低温度各自保持至少30秒,优选至少45秒,最优选至少1分钟。5.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中通过使生物样品与羟基磷灰石固体支持物接触获得包含低拷贝数核酸的样品。6.根据权利要求5所述的方法,其中生物样品与羟基磷灰石固体支持物的接触是在Na
+
、Li
+
或Mg
2+
阳离子的存在下进行的。7.根据权利要求6所述的方法,其中包含低拷贝数核酸的样品是用优选包含KHPO4...

【专利技术属性】
技术研发人员:M
申请(专利权)人:拜奥卡蒂斯生物股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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