与表位结合蛋白缀合的皂苷制造技术

本发明专利技术涉及治疗性组合，其包含第一蛋白质分子并包含第二药物组合物，所述第一蛋白质分子包含用于结合第一细胞表面分子的第一表位的第一结合位点，所述第一蛋白质分子具有与所述第一蛋白质分子的氨基酸残基共价结合的至少一个皂苷，所述第二药物组合物包含不同于所述第一蛋白质分子的第二蛋白质分子，所述第二蛋白质分子包含用于结合不同于所述第一细胞表面分子的第二细胞表面分子的第二表位的第二结合位点，并且包含效应子部分，其中所述第二表位不同于所述第一表位。本发明专利技术的方面是包含本发明专利技术的所述第一蛋白质分子和所述第二蛋白质分子的组合物。本发明专利技术还涉及包含本发明专利技术的所述第一蛋白质分子和效应子部分的抗体

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】与表位结合蛋白缀合的皂苷


[0001]本专利技术涉及包含用于结合第一细胞表面分子的第一表位的第一结合位点的第一蛋白质分子，所述第一蛋白质分子具有通过至少一个连接子和/或通过寡聚或多聚支架与所述第一蛋白质分子的氨基酸残基共价结合或直接与所述第一蛋白质分子的氨基酸残基共价结合的至少一个皂苷。本专利技术还涉及治疗性组合，其中所述治疗性组合包含第一药物组合物和第二药物组合物，所述第一药物组合物包含本专利技术的所述第一蛋白质分子，所述第二药物组合物包含不同于所述第一蛋白质分子的第二蛋白质分子，所述第二蛋白质分子包含用于结合不同于所述第一细胞表面分子的第二细胞表面分子的第二表位的第二结合位点，并且包含效应子部分，其中所述第二表位不同于所述第一表位。此外，本专利技术涉及治疗性组合，其中所述治疗性组合包含(a)本专利技术的所述第一药物组合物，其包含根据本专利技术的所述第一蛋白质分子并且包含用于结合所述第一细胞表面分子上的第一表位的所述第一结合位点；和(b)包含第三蛋白质分子的第三药物组合物，所述第三蛋白质分子包含用于结合(a)的细胞表面分子上的第一表位的所述第一结合位点和效应子部分，其中所述第一蛋白质分子的第一结合位点与所述第三蛋白质分子的第一结合位点相同，并且其中所述第一蛋白质分子可以结合的所述第一细胞表面分子和所述第一细胞表面分子上的所述第一表位与所述第三蛋白质分子可以结合的所述第一细胞表面分子和所述第一细胞表面分子上的所述第一表位相同。本专利技术的一个方面是包含本专利技术的所述第一蛋白质分子和本专利技术的所述第二蛋白质分子的组合物。本专利技术的一个方面涉及包含本专利技术的所述第一蛋白质分子和本专利技术的所述第三蛋白质分子的组合物。本专利技术还涉及包含本专利技术的所述第一蛋白质分子和以下中的任一种或多种的组合物：寡核苷酸，核酸，异种核酸，优选选自载体、基因、细胞自杀诱导转基因、脱氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA)、反义寡核苷酸(ASO、AON)、短干扰RNA (siRNA)、微小RNA(miRNA)、DNA适配体、RNA适配体、mRNA、小环DNA、肽核酸(PNA)、氨基磷酸酯吗啉代寡聚体(PMO)、锁核酸 (LNA)、桥接核酸(BNA)、2
’‑
脱氧
‑2’‑
氟阿拉伯核酸(FANA)、2'
‑
O
‑
甲氧基乙基
‑
RNA(MOE)、2'
‑
O,4'
‑
氨基乙烯桥接核酸、3
’‑
氟己糖醇核酸 (FHNA)、质粒、乙二醇核酸(GNA)和苏糖核酸(TNA)或它们的衍生物中的任一种或多种。本专利技术还涉及包含本专利技术的所述第一蛋白质分子和效应子部分的抗体
‑
药物缀合物或配体
‑
药物缀合物。本专利技术的一个方面涉及药物组合物，其包含本专利技术的所述组合物或本专利技术的所述抗体
‑
药物缀合物或本专利技术的所述配体
‑
药物缀合物，并且任选地还包含药学上可接受的赋形剂。本专利技术还涉及用作药物的本专利技术的所述治疗性组合或本专利技术的所述组合物或本专利技术的所述抗体
‑
药物缀合物或配体
‑
药物缀合联物或本专利技术的所述药物组合物。

技术介绍

[0002]具有治疗性生物活性的分子在理论上在许多情况下适合作为有效治疗性药物应用，以用于治疗有此需要的人类患者的疾病(如癌症)。典型的实例是小分子生物活性部分。然而，目前临床中使用的许多(如果不是全部)潜在的类药物分子和治疗剂存在众多弊端和缺点中的至少一种。当施用于人体时，除了针对待治疗疾病或健康问题的潜在方面的生物
学活性之外，治疗性活性分子还可以发挥脱靶效应。此类脱靶效应是不期望的，并且存在诱发所施用分子的健康甚至危及生命的副作用的风险。正是此类不良事件的发生导致许多类药物化合物和治疗性部分未能通过III期临床试验或甚至IV期临床试验(上市后随访)。因此，强烈期望提供药物分子(如小分子治疗剂)，其中药物分子的治疗效果应该，例如，(1)对驱动疾病的生物因素或生物过程具有高度特异性，(2)足够安全，(3)足够有效，(4)充分针对患病细胞，对非患病细胞几乎没有或没有脱靶活性，(5)具有足够及时的作用方式(例如所施用的药物分子应在特定时间范围内到达人类患者体内的靶位点，并应在靶位点保持特定时间范围)，和/或(6)在患者体内具有足够长的持续治疗活性等等。尽管已经进行了长期和深入的研究，并且尽管在个别解决遇到的困难和缺点的几个领域取得了令人印象深刻的进展，但不幸的是，迄今为止，具有许多或甚至所有上述有益特征的“理想”治疗剂仍无法应用于患者。
[0003]化学疗法是癌症治疗中最重要的治疗选择之一。然而，它通常与较低的治疗窗口有关，因为它对癌细胞比对健康组织中的分裂细胞更没有特异性。单克隆抗体的专利技术提供了利用它们的特异性结合性质作为将细胞毒性剂靶向递送至癌细胞同时不伤害正常细胞的机制的可能性。这可以通过细胞毒性效应物(也被称为有效载荷或弹头)与抗体的化学缀合来实现，以创建抗体
‑
药物缀合物(ADC)。通常，使用非常有效的有效载荷(如emtansine(DM1))，它们的非缀合形式具有有限的治疗指数(比较毒性剂量与有效剂量的比值)。DM1与曲妥珠单抗的缀合物(ado
‑
曲妥珠单抗
‑
emtansine)，也被称为Kadcycla，在猴中将DM1的耐受剂量提高了至少两倍。在过去的几十年中，已经为开发治疗性 ADC做出了巨大的努力和投资。然而，尽管临床前数据很有希望，但将ADC引入临床仍然具有挑战性。2000年批准用于临床的第一个 ADC是吉妥珠单抗ozogamicin(Mylotarg，CD33靶向的，Pfizer/Wyeth)，用于治疗复发性急性髓细胞性白血病(AML)。然而，麦罗塔(Mylotarg) 由于许多问题(包括其安全性状况)，应美国联邦药物管理局(the FederalDrug Administration，FDA)的要求被撤出市场。与接受常规化学疗法的患者相比，接受麦罗塔治疗的患者更容易死亡。2017年，麦罗塔于再次被允许以较低的推荐剂量、与化学疗法组合或单独使用的不同方案以及新的患者群体进入市场。迄今为止，只有5种ADC被批准用于临床，同时大约55种ADC的临床开发已中止。然而，人们的兴趣仍然很高，目前在近600项临床试验中，大约有80种ADC仍处于临床开发阶段。
[0004]尽管有可能使用患者通常无法耐受的有毒有效载荷，但低治疗指数(比较毒性剂量与有效剂量的比值)是导致许多ADC在临床开发中中止的主要问题，这可能是由以下数种机制引起的：诸如对正常细胞的脱靶毒性、对细胞毒剂发展出抗性以及药物在循环中过早释放。FDA 对ADC的系统审查发现，大多数ADC的毒性状况可以根据使用的有效载荷进行分类，而不是使用的抗体，这表明毒性主要由有效载荷的过早释放决定。在大约55种中止的ADC中，估计至少有23种是由于治疗指数不佳造成的。例如，曲妥珠单抗
‑
tesirine缀合物(ADCT
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.第一蛋白质分子，其包含用于结合第一细胞表面分子的第一表位的第一结合位点，所述第一蛋白质分子具有至少一个皂苷，所述至少一个皂苷通过至少一个连接子和/或通过寡聚或多聚支架与所述第一蛋白质分子的氨基酸残基共价结合或直接与所述第一蛋白质分子的氨基酸残基共价结合。2.根据权利要求1所述的第一蛋白质分子，其中所述第一结合位点包含以下或由以下组成：免疫球蛋白、或免疫球蛋白的至少一个结合结构域和/或免疫球蛋白的至少一个结合片段，诸如抗体、IgG、包含Vhh结构域或Vh结构域的分子或由Vhh结构域或Vh结构域组成的分子、Fab、scFv、Fv、dAb、F(ab)2、Fcab片段，和/或包含与细胞表面分子结合的至少一种配体诸如EGF或细胞因子或由与细胞表面分子结合的至少一种配体诸如EGF或细胞因子组成。3.根据权利要求1或2的所述第一蛋白质分子，其中所述第一细胞表面分子的第一表位是第一肿瘤细胞表面分子的肿瘤细胞特异性第一表位，更优选为特异性存在于肿瘤细胞的第一肿瘤细胞表面受体的肿瘤细胞特异性第一表位。4.根据权利要求1
‑
3中任一项所述的第一蛋白质分子，其中所述至少一个皂苷是三萜皂苷和/或在位置C
‑
23中具有醛官能团的属于12,13
‑
脱氢齐墩果烷类型的双糖链三萜皂苷，并且任选地在皂苷的C
‑
3β
‑
OH基团处的碳水化合物取代基中包含葡糖醛酸官能团，和/或分离自霞草属(Gypsophila)物种和/或皂属(Saponaria)物种和/或麦仙翁属(Agrostemma)物种和/或皂树属(Quillaja)物种例如皂皮树(Quillaja saponaria)的皂苷。5.根据权利要求1
‑
4中任一项所述的第一蛋白质分子，其中所述至少一个皂苷是单一特定皂苷或者是两种或更多种不同皂苷的混合物，诸如以下中的一种或多种：表A1或方案1中的皂苷、SO1861、SA1657、GE1741、SA1641、QS
‑
21、QS
‑
21A、QS
‑
21A
‑
api、QS
‑
21A
‑
xyl、QS
‑
21B、QS
‑
21B
‑
api、QS
‑
21B
‑
xyl、QS
‑7‑
xyl、QS
‑7‑
api、QS
‑
17
‑
api、QS
‑
17
‑
xyl、QS1861、QS1862、皂树皂苷、皂素集、QS
‑
18、Quil
‑
A、Gyp1、丝石竹皂苷A、AG1、AG2、SO1542、SO1584、SO1658、SO1674、SO1832、或它们的立体异构体中的任一种和/或它们的任意组合，优选所述皂苷是SO1861和/或GE1741和/或SA1641和/或QS
‑
21和/或具有皂皮酸糖苷核、在C
‑
3β
‑
OH基团处的Gal
‑
(1
→
2)
‑
[Xyl
‑
(1
→
3)]
‑
GlcA碳水化合物取代基和在C
‑
28
‑
OH基团处的Glc
‑
(1
→
3)
‑
Xyl
‑
(1
→
4)
‑
Rha
‑
(1
→
2)
‑
[Xyl
‑
(1
→
3)
‑4‑
OAc
‑
Qui
‑
(1
→
4)]
‑
Fuc碳水化合物取代基的皂苷，和/或是3
‑
O
‑
β
‑
D
‑
吡喃半乳糖基
‑
(1
→
2)
‑
[β
‑
D
‑
吡喃木糖基
‑
(1
→
3)]
‑
β
‑
D
‑
吡喃葡萄糖醛基皂皮酸28
‑
O
‑
β
‑
D
‑
吡喃葡萄糖基
‑
(1
→
3)
‑
β
‑
D
‑
吡喃木糖基
‑
(1
→
4)
‑
α
‑
L
‑
吡喃鼠李糖基
‑
(1
→
2)
‑
[β
‑
D
‑
吡喃木糖基
‑
(1
→
3)
‑
4OAc
‑
β
‑
D
‑
吡喃喹啉基
‑
(1
→
4)]
‑
β
‑
D
‑
吡喃岩藻糖苷，更优选所述皂苷是SO1861和/或QS
‑
21。6.根据权利要求1
‑
5中任一项所述的第一蛋白质分子，其中所述至少一个皂苷为分子量为至少1,500道尔顿并且包含含有在C
‑
23位置处的醛基以及任选在C
‑
16位置处的羟基的齐墩果型三萜，具有在C
‑
3位置处的第一支链碳水化合物侧链的双糖链皂苷，所述第一支链碳水化合物侧链任选含有葡糖醛酸，其中所述皂苷含有酯基和在C
‑
28位置处的第二支链碳水化合物侧链，所述第二支链碳水化合物链优选包含至少四个碳水化合物单元，其任选含有至少一个乙酰基残基如两个乙酰基残基，和/或任选地包含脱氧碳水化合物和/或任选地包含异鼠李糖和/或任选包含葡萄糖和/或任选包含4
‑
甲氧基肉桂酸和/或任选包含5
‑
O
‑
[5
‑
O
‑
Ara/Api
‑
3,5
‑
二羟基
‑6‑
甲基
‑
辛酰基]
‑
3,5
‑
二羟基
‑6‑
甲基
‑
辛酸和/或任选包含通
过酯键与碳水化合物结合的5
‑
O
‑
[5
‑
O
‑
Rha
‑
(1
→
2)
‑
Ara/Api
‑
3,5
‑
二羟基
‑6‑
甲基
‑
辛酰基]
‑
3,5
‑
二羟基
‑6‑
甲基辛酸，或其中至少一个皂苷是QS
‑
21或以下中的任一种或多种：QS
‑
21A、QS
‑
21A
‑
api、QS
‑
21A
‑
xyl、QS
‑
21B、QS
‑
21B
‑
api、QS
‑
21B
‑
xyl、QS
‑7‑
xyl、QS
‑7‑
api、QS
‑
17
‑
api、QS
‑
17
‑
xyl、QS
‑
18、QS1861、质子化QS1861(QS1862)、Quil
‑
A。7.根据权利要求1
‑
6中任一项所述的第一蛋白质分子，其中所述至少一个皂苷是属于在位置C
‑
23中具有醛官能团的12,13
‑
脱氢齐墩果烷类型的双糖链三萜皂苷，其中所述至少一个皂苷通过所述皂苷中的醛官能团，优选地位置C
‑
23中的所述醛官能团，优选地通过至少一个连接子，更优选地通过至少一个可裂解的连接子与所述第一蛋白质分子的氨基酸残基共价偶联，其中所述氨基酸残基优选地选自半胱氨酸和赖氨酸。8.根据权利要求1
‑
7中任一项所述的第一蛋白质分子，其中所述至少一个皂苷是在位置C
‑
23中具有醛官能团的属于12,13
‑
脱氢齐墩果烷类型的双糖链三萜皂苷，并且包含在所述皂苷的C
‑
3β
‑
OH基团处碳水化合物取代基中的葡糖醛酸官能团，其中所述至少一个皂苷通过在所述皂苷的C
‑
3β
‑
OH基团处碳水化合物取代基中的葡糖醛酸官能团，优选通过至少一个连接子，与所述第一蛋白质分子的氨基酸残基共价偶联，其中所述氨基酸残基优选地选自半胱氨酸和赖氨酸。9.根据权利要求4
‑
8中任一项所述的第一蛋白质分子，其中所述至少一个皂苷的位置C
‑
23中的醛官能团与连接子N
‑
ε
‑
马来酰亚胺己酸酰肼共价偶联，所述连接子通过硫醚键与所述第一蛋白质分子中的巯基诸如半胱氨酸的巯基共价偶联。10.根据权利要求4
‑
9中任一项所述的第一蛋白质分子，其中在所述至少一个皂苷的C
‑
3β
‑
OH基团处的碳水化合物取代基中的葡糖醛酸官能团与连接子1
‑
[双(二甲氨基)亚甲基]
‑
1H
‑
1,2,3
‑
三唑并[4,5
‑
b]吡啶鎓3
‑
氧化六氟磷酸酯共价偶联，所述连接子通过酰胺键与所述第一蛋白质分子中的胺基团诸如赖氨酸的胺基团或所述第一蛋白质分子的N
‑
末端共价偶联。11.根据权利要求1
‑
10中任一项所述的第一蛋白质分子，其中所述第一蛋白质分子的第一结合位点结合的所述第一细胞表面分子的第一表位是所述肿瘤细胞特异性受体的肿瘤细胞特异性第一表位，所述肿瘤细胞特异性受体优选地选自：CD71、CA125、EpCAM(17
‑
1A)、CD52、CEA、CD44v6、FAP、EGF
‑
IR、整合素、多配体蛋白聚糖
‑
1、血管整合素α
‑
Vβ
‑
3、HER2、EGFR、CD20、CD22、叶酸受体1、CD146、CD56、CD19、CD138、CD27L受体、PSMA、CanAg、血管整合素α
‑
V、CA6、CD33、间皮素、Cripto、CD3、CD30、CD239、CD70、CD123、CD352、DLL3、CD25、肝配蛋白A4、MUC1、Trop2、CEACAM5、CEACAM6、HER3、CD74、PTK7、Notch3、FGF2、C4.4A、FLT3、CD38、FGFR3、CD7、PD
‑
L1、CTLA4、CD52、PDGFRA、VEGFR1、VEGFR2，更优选地选自：CD71、EGFR、HER2。12.根据权利要求3或11所述的第一蛋白质分子，其中所述肿瘤细胞特异性第一表位、第一肿瘤细胞表面分子或第一肿瘤细胞特异性受体是在权利要求1
‑
11中任一项所述的第一蛋白质分子与所述第一表位或所述第一分子或所述第一受体结合后被所述肿瘤细胞内化的第一表位或第一分子或第一受体，并且其中优选地，当所述第一蛋白质分子与包含所述第一表位的细胞表面分子、肿瘤细胞表面分子或肿瘤细胞特异性受体结合时，经受例如通过内吞作用的肿瘤细胞受体介导的内化，或例如通过内吞作用的肿瘤细胞表面分子介导的内化。13.根据权利要求11或12所述的第一蛋白质分子，其中所述第一蛋白质分子的第一结
合位点包含以下中的任一种或由以下中的任一种组成：西妥昔单抗、达雷木单抗、吉妥珠单抗、曲妥珠单抗、帕尼单抗、本妥昔单抗、奥英妥珠单抗、莫西妥单抗、波妥珠单抗、奥滨尤妥珠单抗、IgG型OKT
‑
9抗CD71单克隆抗体、帕妥珠单抗、利妥昔单抗、奥法木单抗、赫赛汀、阿仑单抗、匹那妥珠单抗、OKT
‑
10抗CD38单克隆抗体、表A2或表A3或表A4的抗体，优选西妥昔单抗或曲妥珠单抗或OKT
‑
9，或它们的至少一种肿瘤细胞受体结合片段和/或它们的至少一种肿瘤细胞受体结合结构域，优选它们的至少一种肿瘤细胞特异性受体结合片段和/或它们的至少一种肿瘤细胞特异性受体结合域。14.治疗性组合，其中所述治疗性组合包含：(a)第一药物组合物，其包含权利要求1
‑
13中任一项所述的第一蛋白质分子和任选的药学上可接受的赋形剂；和(b)第二药物组合物，其包含不同于所述第一蛋白质分子的第二蛋白质分子，所述第二蛋白质分子包含用于结合不同于所述第一细胞表面分子的第二细胞表面分子的第二表位的第二结合位点，并且包含效应子部分，所述第二药物组合物任选地还包含药学上可接受的赋形剂，其中所述第二表位不同于所述第一表位。15.根据权利要求14所述的治疗性组合，其中所述治疗性组合包含：(a)权利要求14所述的第一药物组合物，其包含权利要求1
‑
13中任一项所述的第一蛋白质分子，其中所述第一细胞表面分子上的所述第一表位是第一肿瘤细胞特异性表面分子上的肿瘤细胞特异性第一表位，优选地特异性存在于肿瘤细胞的第一细胞表面受体上的肿瘤细胞特异性第一表位；和(b)权利要求14所述的第二药物组合物，其中所述第二细胞表面分子是不同于所述第一肿瘤细胞特异性表面分子的第二肿瘤细胞特异性表面分子，优选地特异性存在于肿瘤细胞的第二细胞表面受体不同于特异性存在于所述肿瘤细胞的所述第一细胞表面受体，并且其中所述第二表位是肿瘤细胞特异性第二表位。16.治疗性组合，其中所述治疗性组合包含：(a)权利要求14或15所述的第一药物组合物，其包含权利要求1
‑
13中任一项所述的第一蛋白质分子并且包含用于结合所述第一细胞表面分子上的所述第一表位的所述第一结合位点，所述第一药物组合物任选地还包含药学上可接受的赋形剂；和(b)包含第三蛋白质分子的第三药物组合物，所述第三蛋白质分子包含用于结合(a)的细胞表面分子上的所述第一表位的所述第一结合位点和效应子部分，所述第三药物组合物任选地还包含药学上可接受的赋形剂，其中所述第一蛋白质分子的第一结合位点和所述第三蛋白质分子的第一结合位点相同，并且其中所述第一蛋白质分子能够结合的所述第一细胞表面分子和所述第一细胞表面分子上的第一表位与所述第三蛋白质分子能够结合的所述第一细胞表面分子和所述第一细胞表面分子上的第一表位相同。17.治疗性组合，其中所述治疗性组合包含：(a)权利要求16所述的第一药物组合物；和(b)权利要求16所述的第三药物组合物，其中所述第一细胞表面分子在肿瘤细胞表面上表达，并且优选地所述第一细胞表面分子是肿瘤细胞特异性表面分子，并且其中优选地所述第一表位是第一肿瘤细胞特异性表
位。18.根据权利要求1
‑
17中任一项所述的第一蛋白质分子或权利要求14
‑
17中任一项所述的治疗性组合，其中用于结合所述第一细胞表面分子上的所述第一表位的所述第一结合位点是特异性存在于肿瘤细胞的第一细胞表面受体上的肿瘤细胞特异性第一表位的结合位点。19.根据权利要求14
‑
18中任一项所述的治疗性组合，其中所述第二蛋白质分子的第二结合位点和/或所述第三蛋白质分子的第一结合位点包含以下或由以下组成：免疫球蛋白、免疫球蛋白的至少一个结合结构域和/或免疫球蛋白的至少一个结合片段，例如抗体、IgG、包含Vhh结构域或Vh结构域的分子或由Vhh结构域或Vh结构域组成的分子、Fab、scFv、Fv、dAb、F(ab)2、Fcab片段，和/或包含与细胞表面分子结合的至少一种配体诸如EGF或细胞因子或由与细胞表面分子结合的至少一种配体诸如EGF或细胞因子组成。20.根据从属于权利要求14或15或18中的任一项时的权利要求14、15或18、19中任一项所述的治疗性组合，其中用于结合所述第二表位的所述第二蛋白质分子的第二结合位点是特异性存在于所述肿瘤细胞的第二细胞表面受体上的肿瘤细胞特异性第二表位的第二结合位点，其中所述第二结合位点不同于所述第一结合位点。21.根据权利要求1
‑
20中任一项所述的第一蛋白质分子或从属于权利要求14或15或18或19中的任一项时的权利要求14、15或18、19、20中任一项所述的治疗性组合，其中所述第一和第二蛋白质分子包含分别用于结合第一和第二肿瘤细胞特异性受体上的第一和第二肿瘤细胞特异性表位的所述第一和第二结合位点，所述受体不同并且存在于同一肿瘤细胞，其中所述第一和第二结合位点不同并且所述第一和第二肿瘤细胞特异性表位不同。22.根据权利要求1
‑
20中任一项...

【专利技术属性】
技术研发人员：鲁本，
申请(专利权)人：夏里特柏林大学医学院，
类型：发明
国别省市：