长链非编码RNALINC01565在急性髓系白血病预后中的应用制造技术

本发明专利技术属于白血病预后评估技术领域，具体涉及提供一种长链非编码RNA LINC01565在急性髓系白血病预后中的应用。本发明专利技术研究了LncRNA LINC01565在急性髓系白血病的临床相关性和预后价值。研究结果显示，LINC01565高表达的AML患者与低表达的AML患者相比具有更低的总生存期。在化疗组中，LINC01565的高表达预示着更差的预后，但在移植组中，LINC01565高低表达组患者的生存期之间无显著差异。因此，LINC01565是急性髓系白血病AML预后的稳定的生物标志物，但其预后意义可能会被移植所消除。但其预后意义可能会被移植所消除。但其预后意义可能会被移植所消除。

【技术实现步骤摘要】
长链非编码RNA LINC01565在急性髓系白血病预后中的应用


[0001]本专利技术涉及白血病预后评估
，具体涉及长链非编码RNA LINC01565在急性髓系白血病预后中的应用。

技术介绍

[0002]急性髓系白血病(AML)是一种遗传多样性的造血系统恶性肿瘤，其髓系分化和成熟受到干扰。先进的治疗方法发展迅速，但许多急性髓系白血病患者仍经历不良结局。传统上，化疗和异基因造血干细胞移植是急性髓系白血病患者的两种主要治疗方法。目前已发现许多基因突变，如NPM1、FLT3
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ITD和DNMT3A可作为AML的预后因素，但这些突变的预后影响仍不理想。因此，在急性髓系白血病中识别具有更好预后表现的预后因素非常重要。
[0003]长非编码核糖核酸是长度超过200纳米的非编码核糖核酸家族的成员。尽管lncRNAs的蛋白质编码能力有限，甚至没有该能力，但它们参与了许多重要的生物学过程，包括剪接、转录、表观遗传基因表达和染色质修饰。竞争性内源性核糖核酸假说(ceRNA)假设lncRNAs可以通过海绵化微小核糖核酸来调节mRNAs的表达。在肿瘤细胞中，lncRNAs也在增殖、迁移、侵袭和抵抗中发挥重要作用。许多研究发现，在急性髓系白血病中lncRNAs调节失调。例如，过度激活lncRNA SOX61导致AML细胞系中细胞增殖增加并抑制细胞凋亡。LncRNA SBF2
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AS1通过海绵抑制肿瘤抑制因子miR
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188
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5p抑制白血病细胞凋亡和细胞周期停滞。lncRNA H22854表达的降低与复发的高风险相关。LINC01565，又名GR6和C3orf27，是一种长基因间非蛋白编码RNA。据报道，GR6在USCD
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AML1细胞系和伴有3q21q26综合征的AML患者中被激活。然而，LINC01565在急性髓系白血病中的作用以及LINC01565与急性髓系白血病预后的关系仍有待阐明。

技术实现思路

[0004]本专利技术通过从TCGA数据库、TARGET数据库和GTEx数据库分别下载两个AML队列和一个正常骨髓样本队列的转录组谱，用DESeq2在TCGA
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AML队列和GTEx队列之间进行lncRNAs的差异表达分析。Kaplan
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Meier生存分析和对数秩检验用于评估LINC01565在TCGA
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AML队列和TARGET
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AML队列中的预后价值。差异表达基因的功能富集和ceRNA网络用于研究LINC01565在急性髓系白血病中的潜在机制。
[0005]在GEPIA数据库的33种肿瘤中，LINC01565在AML中的表达最高，在TCGA
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AML队列中LINC01565的表达与正常组织相比显著上调。此外，LINC01565的高表达与TCGA成人急性髓系白血病队列和TARGET儿童急性髓系白血病队列的不良预后相关。此外，LINC01565的高表达也表明仅接受化疗的患者预后不良，而在TCGA
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急性髓系白血病队列中接受同种HSCT治疗的患者中未发现显著差异。多变量分析表明LINC01565是急性髓系白血病的独立预后因素。差异基因和功能富集分析显示，LINC01565可能通过参与或影响ECM受体互作通路和一些与免疫相关的信号通路如细胞因子
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细胞因子受体相互作用信号通路和中性粒细胞胞外陷阱形成信号通路对AML进行调控。
[0006]基于LINC01565相关的ceRNA网络建立了一个预后模型，ceRNA网络分析显示，LINC01565与microRNA miR
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210和miR
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152以及13个蛋白质编码基因共同组成调控AML疾病的网络，该网络可能通过影响过渡金属离子转运通路对AML进行调控。
[0007]进一步地发现LINC01565在急性髓系白血病中上调，是急性髓系白血病稳定的不良预后因素，但其预后影响可被allo
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HSCT超越。这一发现初步揭示了LINC01565在急性髓系白血病中的作用，为急性髓系白血病的诊断和治疗提供了新的视角。
附图说明
[0008]图1为LINC01565的基因表达分析中，利用PEGIA数据库研究LINC01565在泛癌组织中的表达结果。
[0009]图2为LINC01565的基因表达分析中，LINC01565在TCGA
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AML队列和TCGA
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AML队列两种不同样本类型中的表达情况。
[0010]图3为LINC01565的基因表达分析中，LINC01565在ELN分层系统分层的不同AML患者中的表达情况。
[0011]图4为LINC01565的基因表达分析中，LINC01565在按细胞遗传学分层的八个亚组急性髓系白血病患者中的表达情况。
[0012]图5为TCGA
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AML队列和TARGET
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AML队列中LINC01565不同表达的总生存率(OS)和无事件生存期(EFS)的卡普兰
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迈耶曲线。A)TCGA
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AML队列中LINC01565高表达组和低表达组的OS卡普兰
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迈耶曲线。B)TCGA
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AML队列中LINC01565高表达组和低表达组的EFS卡普兰
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迈耶曲线。C)TARGET
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AML队列中LINC01565高表达组和低表达组的OS卡普兰
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迈耶曲线。D)TCGA
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AML队列中LINC01565高表达组和低表达组的EFS卡普兰
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迈耶曲线。
[0013]图6为不同LINC01565表达组的临床特征，X轴是LINC01565高表达组的频率，y轴是LINC01565低表达组的频率。
[0014]图7为TCGA
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AML队列中接受不同治疗的患者总生存期(OS)和无事件生存期(EFS)的卡普兰
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迈耶曲线。A)LINC01565高表达组和低表达组接受化疗的OS的卡普兰
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迈耶曲线。B)LINC01565高表达组和低表达组接受化疗的EFS卡普兰
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迈耶曲线。C)LINC01565高表达组和低表达组接受骨髓移植的OS的卡普兰
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迈耶曲线。D)LINC01565高表达组和低表达组的接受骨髓移植的EFS的卡普兰
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迈耶曲线。
[0015]图8为LINC01565 ceRNA网络。
具体实施方式
[0016]为使本专利技术要解决的技术问题、技术方案和优点更加清楚，下面将结合具体实施例进行详细描述。
[0017]1、材料和方法
[0018]GEPIA分析
[0019]GEPIA本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种AML患者预后用的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物为长链非编码RNA LINC01565。2.根据权利要求1所述的AML患者预后用的生物标志物，其特征在于，AML患者为经化疗法治疗的患者或未治疗的患者。3.根据权利要求1或2所述的一种AML患者预后用的生物标志物在急性髓系白血病患者预后评估中的应用。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，预后评估包括根据RNA LINC01565的表达情况预判AML患者的生存期。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，RNA LINC01565高表达的AML患者预判比RNA LINC01565低表达的AML患者具有更短的生存期。6.根据权利要求1或2所述的一种AML患者预后用的生物标志物在制备以RNA LINC01565作为...

【专利技术属性】
技术研发人员：曾添晟，赖国锋，陆家雯，梁美，冯雪，
申请(专利权)人：广州齐凯生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：