本发明专利技术提供了一组标志物组合及其应用。所述标志物组合包括ERRFI1、EGFR、SDC2、PPP1R3C、PYGM和GPC3基因；优选地，所述标志物组合是EGFR、PYGM和GPC3的组合。所述标志物组合可以应用于预测白血病患者的预后；优选地，所述白血病是急性髓细胞白血病。血病是急性髓细胞白血病。血病是急性髓细胞白血病。
【技术实现步骤摘要】
一组标志物组合及其在预测AML病患预后中的应用
[0001]本专利技术涉及生物
，具体涉及一组标志物组合及其在预测AML病患预后中的应用。
技术介绍
[0002]急性髓细胞性白血病(Acute myeloid leukemia，LAML，AML)，被定义为通过造血系统增殖，克隆，异常分化和偶尔分化差的治疗细胞渗透到骨髓，血液和其他组织中的一类癌症。AML是成人中最常见的急性白血病类型，约占病例的70％。超过四十年来，LAML的治疗标准并未发生显著变化，仍由阿糖胞苷加蒽环类药物作为基础药物的强化联合化疗组成。尽管大多数患者已实现缓解，但由于复发性疾病，高达70％的成年人和30％的儿童在最初临床治疗后的5年内将无法生存。这突显了对新治疗手段的迫切及其预后预测的需求，以使LAML患者能够持续康复。
[0003]众所周知，在实体瘤中，肿瘤细胞的过度增殖会导致严重的缺氧，这可能影响肿瘤进展。同样，在血液系统恶性肿瘤中，有人认为细胞的异常增殖和积累会导致骨髓微环境中的低氧环境。有研究表明，低氧条件可触发白血病细胞走向分化，分化伴随着缺氧诱导因子蛋白表达水平及与DNA结合活性的增高，这种现象不依赖LAML亚型而广泛存在。
[0004]目前，肿瘤缺氧的研究方法还很有限，且尚未在LAML中进行系统的缺氧基因的研究。这项研究首次使用了足量RNA
‑
Seq分析数据来开发低氧风险模型，作为预测LAML组的预后生物标志物。这种方法可能会帮助临床医生做出重要的治疗决策。
[0005]在本研究中，我们下载了TCGA数据库中LAML的RNA
‑
Seq数据和临床数据。通过GSEA(hallmark
‑
hypoxia)获得200个缺氧基因。TCGA数据库中LAML的RNA
‑
Seq数据7:3分为训练集和验证集，对训练集利用单因素、多因素Cox回归分析筛选预后缺氧基因，并构建缺氧风险模型，检测其对LAML预后价值。最后我们采用验证集数据对缺氧风险模型进行验证，进一步确定缺氧风险模型的有效性。联合临床病理特征的关系验证其独立预后价值。
技术实现思路
[0006]本专利技术提供了一组标志物组合及其应用。
[0007]标志物组合
[0008]一方面本专利技术提供了一种预测疾病预后的标志物组合，所述标志物组合包括ERRFI1、EGFR、SDC2、PPP1R3C、PYGM或GPC3基因。
[0009]优选地，所述标志物组合包括EGFR、PYGM和GPC3。
[0010]优选地，所述标志物组合是EGFR、PYGM和GPC3的组合。
[0011]优选地，所述EGFR是与人第7号染色体的第55,019,017～55,211,628位的序列有至少90％同源性的序列。
[0012]优选地，所述PYGM是与人第11号染色体的第64,746,389～64,760,715位的序列有至少90％同源性的序列。
[0013]优选地，所述GPC3是与人X染色体的第133,535,745～133,985,616位的序列有至少90％同源性的序列。
[0014]优选地，所述至少90％是指90％，91％，92％，93％，94％，95％，96％，97％，98％，99％和100％。
[0015]所述标志物组合中的EGFR的基因序列是人第7号染色体的第55,019,017
‑
55,211,628位。
[0016]所述标志物组合中的PYGM的基因序列是人第11号染色体的第64,746,389
‑
64,760,715位。
[0017]所述标志物组合中的PYGM的基因序列是人X染色体的第133,535,745
‑
133,985,616位。
[0018]优选地，所述标志物组合还包括其他基因。
[0019]优选地，所述其他基因包括结构基因和/或非结构基因。
[0020]优选地，所述非结构基因包括顺式作用元件和/或反式作用元件。
[0021]优选地，其他基因是白血病融合基因。
[0022]优选地，所述白血病融合基因包括BCR
‑
ABL(b2a2)、BCR
‑
ABL(b3a2)、BCR
‑
ABL(e1a2)、E2A
‑
PBX1、TEL
‑
AML1、MLL
‑
AF4(e10/e4)、CBFB
‑
MYH11(A type)、AML1
‑
ETO、PML
‑
RARA(L form)、PML
‑
RARA(S form)、AML1/MPSI/EV11、DEK/CAN、AML1/MTG8。
[0023]优选地，所述疾病包括急性髓细胞白血病(AML，LAML)、急性淋巴细胞白血病(ALL)、急性早幼粒细胞白血病(APL)、慢性淋巴细胞白血病(CLL)、慢性粒细胞白血病(CML)、慢性嗜中性粒细胞白血病(CNL)、急性未分化细胞白血病(AUL)、幼淋巴细胞白血病(PML)、幼年型粒
‑
单核细胞白血病(JMML)、成人T细胞急性淋巴细胞白血病、急性髓系白血病伴三系病态造血(AML/TMDS)、混合血系白血病(MLL)、急性单核细胞性白血病(AMOL)。
[0024]优选地，所述疾病是急性髓细胞白血病。
[0025]优选地，所述预后的指标包括客观缓解率(Objective Response Rate，ORR)、总体存活率(Overall survival rate，Overall survival，OS)、无进展生存期(progression
‑
free survival，PFS)、疾病进展时间(time to progress，TTP)、无病生存期(Disease
‑
free survival，DFS)、治疗失败时间(time to treatment failure，TTF)、应答率(RR)、完全应答(CR)、部分应答(PR)。
[0026]优选地，所述预后的指标是总体存活率(Overall survival rate，Overall survival，OS)。
[0027]优选地，所述预后的指标是1～10年的总体存活率。具体地，所述1～10年是1年、2年、3年、4年、5年、6年、7年、8年、9年、10年。
[0028]优选地，所述预后的指标是1年、3年或5年的总体存活率。
[0029]预测疾病预后的试剂
[0030]另一方面本专利技术提供了一种用于预测前述疾病预后的试剂。
[0031]优选地，所述试剂包括检测前述标志物组合中每个基因各自的表达量所需的试剂。
[0032]优选地，所述试剂包括反转录试剂、血液抽提试剂、内参引物、用于指示DNA合成量的荧光物质、qPCR反应缓冲液、本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种预测疾病预后的标志物组合，所述标志物组合包括EGFR、PYGM或GPC3；优选地，所述标志物组合是EGFR、PYGM和GPC3的组合；优选地，所述标志物组合还包括其他基因。优选地，所述EGFR的基因序列是人第7号染色体的第55,019,017
‑
55,211,628位；优选地，所述PYGM的基因序列是人第11号染色体的第64,746,389
‑
64,760,715位；优选地，所述PYGM的基因序列是人X染色体的第133,535,745
‑
133,985,616位。2.权利要求1所述的标志物组合，其特征在于，所述标志物组合预测的是包括急性髓细胞白血病、急性淋巴细胞白血病、急性早幼粒细胞白血病、慢性淋巴细胞白血病、慢性粒细胞白血病、慢性嗜中性粒细胞白血病、急性未分化细胞白血病、幼淋巴细胞白血病、幼年型粒
‑
单核细胞白血病、成人T细胞急性淋巴细胞白血病、急性髓系白血病伴三系病态造血、混合血系白血病、急性单核细胞性白血病在内的血液疾病的预后；优选地，所述标志物组合预测的是急性髓性白血病的预后。3.权利要求1所述的标志物组合，其特征在于，所述标志物组合预测疾病预后的指标包括客观缓解率、总体存活率、无进展生存期、疾病进展时间、无病生存期、治疗失败时间、应答率、完全应答、部分应答；优选地，所述预测疾病预后的指标是总体存活率；优选地，所述预测疾病预后的指标是1
‑
10年的总体存活率；优选地，所述预测疾病预后的指标是1年、3年或5年的总体存活率。4.一种预测疾病预后的试剂，所述试剂包括检测权利要求1所述的标志物组合中的一种或多种基因的表达量所需的试剂；优选地，所述表达量包括mRNA表达量或蛋白表达量；优选地，所述试剂还包括处理样品的试剂；优选地，所述疾病是权利要求2所述的疾病。5.一种改善疾病预后的药物组合物，所述药物组合物包括能改变权利...
【专利技术属性】
技术研发人员：郭祥瑞，高洁，官士兵，
申请(专利权)人：山东第一医科大学附属省立医院山东省立医院，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。