【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】在不进行细胞纯化的情况下进行微生物分析
本公开涉及感染的检测、感染性微生物病原体的鉴定以及针对这些感染的有效抗微生物剂治疗的确定。
技术介绍
由抗生素耐药性细菌引起的威胁生命的感染的流行加剧了全球性医疗保健危机。该问题部分地由当前诊断方法需要很多天来确定用于治疗感染的最优抗微生物剂治疗的事实驱动。由缓慢测试引起的延误导致次优治疗、不良结果以及对引起抗生素耐药性扩散的强力广谱抗生素的过度使用。由于由耐药性细菌引起的感染造成的死亡率正在急剧增加。《对抗微生物剂耐药性的综述(ReviewonAntimicrobialResistance)》的2014报告估计，到2050年，抗微生物剂耐药性将是每年大于1000万死亡的原因。使用针对引起感染的特定病原体的最佳有效抗生素进行的早期治疗可以极大改善医疗结果，包含预防死亡。不幸的是，当前用于鉴定有效针对性抗生素的方法(被称为抗微生物剂敏感性测试(AST)方法)需要很多天来递送结果。当前抗微生物剂敏感性测试花费这么长时间的一个原因是测试需要大量——大约几百万经过纯化的病原体细胞。其需...
【技术保护点】
1.一种用于抗微生物剂敏感性测试的方法，所述方法包括：/n获得多种微生物样本；/n将所述样本分配到孔中，其中所述孔中的至少一些孔包含不同药剂或不同浓度的一种或多种药剂；/n温育所述孔中的所述样本以允许响应于所述不同药剂或不同浓度的药剂的差异生长；以及/n对每个孔中的特异性物种的单独细胞进行计数以鉴定抑制所述特异性物种生长的药剂或药剂的浓度。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20181004 US 62/741,2531.一种用于抗微生物剂敏感性测试的方法，所述方法包括：
获得多种微生物样本；
将所述样本分配到孔中，其中所述孔中的至少一些孔包含不同药剂或不同浓度的一种或多种药剂；
温育所述孔中的所述样本以允许响应于所述不同药剂或不同浓度的药剂的差异生长；以及
对每个孔中的特异性物种的单独细胞进行计数以鉴定抑制所述特异性物种生长的药剂或药剂的浓度。
2.根据权利要求1所述的方法，其进一步包括在对不含抗微生物剂的对照孔进行温育之后，对所述对照孔中的细胞进行计数。
3.根据权利要求2所述的方法，其进一步包括将在每个孔中计数的细胞数量与来自所述对照孔的计数进行比较以确定在暴露于所述不同药剂或不同浓度的药剂时微生物的活力。
4.根据权利要求1所述的方法，其中所述温育步骤包含以物种特异性方法对所述微生物进行荧光标记，并且所述计数步骤包含对每个孔进行成像并且对图像中的荧光斑点进行计数。
5.根据权利要求4所述的方法，其中所述标记使用靶特异性荧光团标记的核酸或核酸类似物探针，并且所述计数依赖于荧光原位杂交。
6.根据权利要求1所述的方法，其中所述步骤不包含核酸扩增。
7.根据权利要求1所述的方法，其中所述温育步骤持续小于约一小时并且在低于约40摄氏度的温度下在生长培养基中进行。
8.根据权利要求1所述的方法，其中所述分配、温育和计数步骤使用包含所述孔的盒进行。
9.根据权利要求8所述的方法，其进一步包括：
将所述样本的一部分转移到所述盒中，其中所述盒包含微生物结合性磁珠；以及
将所述盒装载到分析仪中，其中所述分析仪使用磁体将所述微生物与所述样本的其它部分分离并且使用成像子系统执行所述计数步骤。
10.根据权利要求9所述的方法，
其中所述分析仪使用气动子系统在所述盒内执行所述分配步骤，
其中所述孔位于所述盒内并且预装载有所述不同药剂或不同浓度的药剂，
其中在所述分配步骤和所述温育步骤之后，所述分析仪将所述孔中的内含物转移到对应的试剂孔以将其中经过温育的样本暴露于所述微生物结合性磁珠和物种特异性可检测标记。
11.根据权利要求9所述的方法，其中所述分析仪使用磁体将所述微生物结合性磁珠和所结合的单独微生物拉到所述盒内的检测表面。
12.根据权利要求11所述的方法，其中所述磁体拉动所述微生物结合性磁珠穿过从所述检测表面排除未经结合的可检测标记的染料垫。
13.根据权利要求11所述的方法，其中所述分析仪使用转盘和/或机械盒输送工具将所述盒转移到成像子系统以执行所述计数步骤。
14.根据权利要求10所述的方法，其中所述物种特异性可检测标记包含荧光核酸探针，所述荧光核酸探针与特异性微生物物种的靶核酸杂交。
15.根据权利要求14所述的方法，其中所述温育和计数步骤实现基本上在生理温度下在所述分析仪内的荧光原位杂交(FISH)分析。
16.根据权利要求23所述的方法，其中鉴定抑制所述微生物生长的所述抗微生物剂包括将所述经过温育的样本中的复合物的数量与未经温育的样本中的复合物的数量进行比较。
17.根据权利要求9所述的方法，其中在所述差异生长之后，所述...
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