【技术实现步骤摘要】
一种金针菇FL1980菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用
本专利技术属于金针菇菌种的检测
,具体涉及一种金针菇FL1980菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法及其构建方法与应用。
技术介绍
金针菇(Flammulinafiliformis)是一种普遍栽培的食用菌,通常分为白色和黄色品种。其栽培历史悠久,生产总量逐年提升,目前已成为我国工厂化食用菌企业中发展速度最快、规模最大的一个品种。我国工厂化栽培金针菇的日产量约占我国食用菌工厂化总产量的47.12%。金针菇营养丰富、味道鲜美且兼具药用价值,不仅富含蛋白质、矿物质和维生素等各种营养成分,而且具有抗肿瘤、增强免疫调节、抗病毒、降血脂、抗疲劳和护肝等多种药用保健作用,深受消费者喜爱。优质菌种在金针菇单产和质量中的贡献率举足轻重。我国的金针菇工厂化栽培菌株以国外选育的首潮产量高、生长周期短和耐储藏的白色菌株为主导。金针菇育种工作相对滞后,也是导致目前国产菌株市场占有率小的原因。但是相对于目前主导的工厂化菌株而言,我国有着丰富的金针 ...
【技术保护点】
1.一种金针菇FL1980菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法,其特征在于:所述指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成,具体序列如下:/n
【技术特征摘要】
1.一种金针菇FL1980菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的鉴定方法,其特征在于:所述指纹图谱由6对微卫星DNA标记组成,具体序列如下:
相应带型编号组合为:(2+9)/(5+12)/(6+8)/(2+6)/6/(1+3)。
2.权利要求1所述的金针菇FL1980菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的构建方法,其特征在于:包括,
(1)菌丝培养:将金针菇菌种转接到马铃薯葡萄糖琼脂固体培养基上,25℃培养5~10d后收集菌丝;
(2)基因组DNA的提取:用TAKARA公司的TaqHotStart扩增试剂盒提取上述菌丝的基因组DNA,紫外分光光度法检测总基因组DNA浓度和纯度,调整样品DNA的浓度一致;
(3)微卫星DNA分子标记的检测:对上述提取的DNA进行基因微卫星DNA标记的PCR扩增;
(4)电泳检测:将上述PCR扩增得到的产物与甲酰胺加样缓冲液混匀,变性,上机检测;
(5)GeneMapper数据分析;找到相应带型编号组合为:(2+9)/(5+12)/(6+8)/(2+6)/6/(1+3)的菌种。
3.根据权利要求2所述的金针菇FL1980菌种的微卫星DNA标记指纹图谱的构建方法,其特征在于:所述步骤(2)基因组DNA的提取,其具体方法包括:
(1)将菌丝样本加入液氮充分研磨;
(2)向研磨好的粉末中迅速加入360μLBufferSTE和40μLBufferSDS,迅速涡旋混匀后,将离心管放在65℃水浴15min,水浴过程中颠倒离心管以混合样本数次;
(3)加入5μLRNaseSolution至裂解液中,涡旋混匀,室温静置15-30min;
(4)加入140μLBufferPS,涡旋震荡30s,冰上放置10min;
(5)室温下,13000g离心5min,小心转移400μL上清液至新的离心管中;
(6)加入600μLBufferPBD至样品中,涡旋混匀30s;
(7)把DNA结合柱装在收集管,转移一半混合液至柱子中,8000g离心1min;
(8)倒弃滤液把柱子装回收集管,转移剩余混合液至柱子中,8000g离心1min;
(9)倒弃滤液把柱子装回收集管,加入600μLBufferGW2至柱子中,8000g离心1min;
(10)重复步骤9;
(11)倒弃滤液把柱子装回收集管,10000g离心2min去除柱子中残留的乙醇;
(12)将柱子转移至新的1.5ml离心管中,加入30μL预热至65℃的BufferAE至柱子的膜中央,室温静置2min,10000g离心1min;
(13)取2μLD...
【专利技术属性】
技术研发人员:吴莹莹,李燕,鲍大鹏,茅文俊,杨瑞恒,陈洪雨,
申请(专利权)人:上海市农业科学院,
类型:发明
国别省市:上海;31
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