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蜱传脑炎病毒报告病毒TBEV Nluc 2A的构建方法及其应用技术

技术编号:28966693 阅读:66 留言:0更新日期:2021-06-23 09:06
本发明专利技术公开了蜱传脑炎病毒报告病毒TBEV Nluc 2A的构建方法及其应用。本发明专利技术构建出了含有Nluc 2A报告基因的报告病毒,使可以通过检测Nluc荧光素酶信号来监测TBEV、研究病毒毒力,并且可作为抗病毒药物筛选的有力工具。

【技术实现步骤摘要】
蜱传脑炎病毒报告病毒TBEVNluc2A的构建方法及其应用
本专利技术涉及蜱传脑炎病毒(TBEV)报告病毒的构建,特别涉及稳定表达含有Nluc荧光素酶的报告病毒的构建及其活性检测。
技术介绍
在中国,第一例人类蜱传脑炎(TBE)病例于1943年被发现。TBE在中国的分布与其蜱媒的分布密切相关。我国TBE病例均为远东亚型,由全沟硬蜱传播。内蒙古大兴安岭、黑海龙江小兴安岭、吉林省长白山林区是东北地区典型的TBE疫区。西北地区的新疆天山北坡林区和阿尔泰南坡林区也有间歇性的TBE报告。此外,TBE在云南(中国西南部)和西藏(中国西部)也有报道。由于TBE在中国不是强制报告的传染病,缺乏对该病的监测,其发病率很可能被低估。并且该病有区域性、季节性、职业性等特征,因此增强我国对该病的检测和对TBEV的相关研究以达到对该病的控制是必要且可行的。蜱传脑炎病毒(TBEV)是黄病毒蜱传类群中最重要的一种。TBEV有一个约11千碱基长的正链RNA基因组,基因组包括5'UTR和3'UTR以及一个开放阅读框(Openreadingframe,ORF),基因组总共编码3414个氨基酸,并翻译成单个多蛋白,该多蛋白经共转录和转录后加工成三种结构蛋白(Structuralprotein,SP)和七种非结构蛋白(Non-structuralprotein,nSP)[21]。其中,结构蛋白有C、PrM和E蛋白,非结构蛋白有NS1、NS2A、NS2B、NS3、NS4A、NS4B和NS5。相比于其他黄病毒尤其是蚊媒病毒,蜱传病毒研究相对较少,很多功能是基于其他黄病毒的研究推理出的。Nluc是荧光素酶系统家族的最新成员,可用于生物发光应用,这种小荧光素酶是从深海虾中提取的,并经过人工优化的一种荧光素酶,它的底物是呋喃嗪。Nluc分子量较小,且该系统显示出比FLuc和RLuc高150倍以上的活性,发光输出保持稳定,持续时间比其他的荧光素酶长。因此,在几种荧光素酶中,Nluc基因在生物发光和报告基因的应用上都比其他荧光素酶更稳定、更灵敏。
技术实现思路
本专利技术的目的是构建出含有Nluc荧光素酶的蜱传脑炎病毒的报告病毒,使其可以在细胞中稳定表达,并且可以通过检测Nluc荧光素酶信号来研究病毒毒力,可作为抗病毒药物筛选的有力工具。本专利技术采用的技术方案是:蜱传脑炎病毒报告病毒TBEVNluc2A的构建方法,包括如下步骤:1)SnaBI-C38片段的克隆:以TBEV感染性克隆为模板,引物1和引物2为特异性引物,PCR扩增蜱传脑炎病毒SnaBI-C38片段;所述引物1和引物2的序列为:引物1:5’-TACGTATTAGTCATCGCTATTAC-3’;引物2:5’-GTGTGAAGACCATCACGAGTCCATTTGGC-3’;PCR反应条件为:95℃预变性5min;98℃10s,58℃30s,68℃1min为一个循环,进行35个循环,最后68℃延伸7min。2)P2A序列和Nluc基因的连接:将P2A序列设计在引物上,并分两轮PCR将P2A序列连接到Nluc基因上。第一轮PCR:以Nluc-pGEMT为模板,Nluc-F和P2ANlucR1为引物进行PCR,扩增好目的片段后,回收目的条带。引物Nluc-F:5’-ATGGTCTTCACACTCGAAG-3’;引物P2ANlucR1:5’-CAGCAGGCTGAAGTTAGTAGCTCCGCTTCCCGCCAGAATGCGTTCGCAC-3’;PCR反应条件为:95℃预变性5min;98℃10s,58℃30s,68℃1min为一个循环,进行35个循环;最后68℃延伸7min。第二轮PCR:以第一轮PCR回收的目的条带为模板,Nluc-F和P2ANlucR2为引物进行PCR,扩增好目的片段后,回收目的条带。引物Nluc-F:5’-ATGGTCTTCACACTCGAAG-3’;引物P2ANlucR2:5’-AGGTCCAGGGTTCTCCTCCACGTCTCCAGCCTGCTTCAGCAGGCTGAAGTTAG-3’;PCR反应条件为:95℃预变性5min;98℃10s,58℃30s,68℃1min为一个循环,进行35个循环;最后68℃延伸7min。将第二轮PCR回收的目的条带连接到pGEMT载体上,命名为Nluc2ApGEMT。3)Nluc-P2A片段的克隆:以Nluc2ApGEMT为模板,引物3和引物4为特异性引物,扩增出片段Nluc-P2A,此时该片段与前后两部分有重叠序列;所述引物3和引物4的序列为:引物3:5’-CAAATGGACTCGTGATGGTCTTCACACTCGAAG-3’;引物4:5’-CTTCCCGGCCATAGGTCCAGGGTTCTCCTC-3’;PCR反应条件为:95℃预变性5min;98℃10s,58℃30s,68℃1min为一个循环,进行35个循环,最后68℃延伸7min。4)C1-AflⅡ片段的克隆:以TBEVFL为模板,引物5和引物6为特异性引物,扩增出片段C1-AflⅡ;所述引物5和引物6的序列为:引物5:5’-GAACCCTGGACCTATGGCCGGGAAGGCCATTC-3’;引物6:5’-CTTAAGCAACACTCCAGTCTGG-3’;PCR反应条件为:95℃预变性5min;98℃10s,56℃30s,68℃2min30s为一个循环,进行35个循环;最后68℃延伸7min。5)构建SnaBI-C38-Nluc-P2A-C1-AflⅡ片段:以引物1和引物6为特异性引物,步骤1)获得的SnaBI-C38片段、步骤3)获得的Nluc-P2A片段和步骤4)获得的C1-AflⅡ片段为模板,通过重叠延伸PCR,将此三个片段连接在一起,得到SnaBI-C38-Nluc-P2A-C1-AflⅡ片段;PCR反应条件为:95℃预变性5min;98℃10s,56℃30s,68℃3min为一个循环,进行35个循环;最后68℃延伸7min。6)含有Nluc荧光素酶的TBEV报告病毒的构建:将步骤5)获得的SnaBI-C38-Nluc-P2A-C1-AflⅡ片段和TBEV的感染性克隆用SnaBI和AflⅡ双酶切,将酶切片段跑胶回收,再用T4连接酶进行连接。构建含有Nluc荧光素酶的TBEV报告病毒TBEVNluc2A。本专利技术的有益效果是:1、本专利技术通过将构建的含有Nluc荧光素酶的TBEVNluc2A质粒转染至BHK21细胞,进行荧光素酶活性检测,验证了本专利技术TBEVNluc2A的可用性。2、本专利技术获得的TBEVNluc2A质粒转染后可以用于检测蜱传脑炎病毒的复制情况。3、本专利技术构建了含有Nluc荧光素酶的TBEV报告病毒,为进一步研究TBEV的抗病毒药物的筛选奠定了基础。...

【技术保护点】
1.蜱传脑炎病毒报告病毒TBEV Nluc 2A的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:/n1)SnaBI-C38片段的克隆:以TBEV FL为模板,引物1和引物2为特异性引物,PCR扩增蜱传脑炎病毒SnaBI-C38片段;所述引物1和引物2的序列为:/n引物1:/n5’-TACGTATTAGTCATCGCTATTAC-3’;/n引物2:/n5’-GTGTGAAGACCATCACGAGTCCATTTGGC-3’;/n2)P2A序列和Nluc基因的连接:将P2A序列设计在引物上,并分两轮PCR将P2A序列连接到Nluc基因上;第一轮PCR:Nluc-pGEMT为模板,Nluc-F和P2A Nluc R1为引物进行PCR,扩增好目的片段后,回收目的条带;进行第二轮PCR:第一轮PCR回收的目的条带为模板,Nluc-F和P2A Nluc R2为引物进行PCR,扩增好目的片段后,回收目的条带;将第二轮PCR回收的目的条带连接到pGEM T载体上,命名为Nluc 2A pGEM T;所述引物Nluc-F、引物P2A Nluc R1和引物P2A Nluc R2的序列为:/n引物Nluc-F:/n5’-ATGGTCTTCACACTCGAAG-3’;/n引物P2A Nluc R1:/n5’-CAGCAGGCTGAAGTTAGTAGCTCCGCTTCCCGCCAGAATGCGTTCGCAC-3’;/n引物P2A Nluc R2:/n5’-AGGTCCAGGGTTCTCCTCCACGTCTCCAGCCTGCTTCAGCAGGCTGAAGTTAG-3’;/n3)Nluc-P2A片段的克隆:以Nluc 2A pGEM T为模板,引物3和引物4为特异性引物,扩增出Nluc-P2A片段;所述引物3和引物4的序列为:/n引物3:/n5’-CAAATGGACTCGTGATGGTCTTCACACTCGAAG-3’;/n引物4:/n5’-CTTCCCGGCCATAGGTCCAGGGTTCTCCTC-3’;/n4)C1-AflⅡ片段的克隆:以TBEV FL为模板,引物5和引物6为特异性引物,扩增出C1-AflⅡ片段;所述引物5和引物6的序列为:/n引物5:/n5’-GAACCCTGGACCTATGGCCGGGAAGGCCATTC-3’;/n引物6:/n5’-CTTAAGCAACACTCCAGTCTGG-3’;/n5)构建SnaBI-C38-Nluc-P2A-C1-AflⅡ片段:以引物1和引物6为特异性引物,以步骤1)获得的SnaBI-C38片段、步骤3)获得的Nluc-P2A片段和步骤4)获得的C1-AflⅡ片段为模板,通过重叠延伸PCR,将三个片段连接在一起,得到SnaBI-C38-Nluc-P2A-C1-AflⅡ片段;/n6)将SnaB I-C38-Nluc-P2A-C1-AflⅡ片段和TBEV的感染性克隆用SnaBI和AflⅡ双酶切,将酶切片段跑胶回收,再用T4连接酶进行连接,获得蜱传脑炎病毒报告病毒TBEV Nluc2A。/n...

【技术特征摘要】
1.蜱传脑炎病毒报告病毒TBEVNluc2A的构建方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)SnaBI-C38片段的克隆:以TBEVFL为模板,引物1和引物2为特异性引物,PCR扩增蜱传脑炎病毒SnaBI-C38片段;所述引物1和引物2的序列为:
引物1:
5’-TACGTATTAGTCATCGCTATTAC-3’;
引物2:
5’-GTGTGAAGACCATCACGAGTCCATTTGGC-3’;
2)P2A序列和Nluc基因的连接:将P2A序列设计在引物上,并分两轮PCR将P2A序列连接到Nluc基因上;第一轮PCR:Nluc-pGEMT为模板,Nluc-F和P2ANlucR1为引物进行PCR,扩增好目的片段后,回收目的条带;进行第二轮PCR:第一轮PCR回收的目的条带为模板,Nluc-F和P2ANlucR2为引物进行PCR,扩增好目的片段后,回收目的条带;将第二轮PCR回收的目的条带连接到pGEMT载体上,命名为Nluc2ApGEMT;所述引物Nluc-F、引物P2ANlucR1和引物P2ANlucR2的序列为:
引物Nluc-F:
5’-ATGGTCTTCACACTCGAAG-3’;
引物P2ANlucR1:
5’-CAGCAGGCTGAAGTTAGTAGCTCCGCTTCCCGCCAGAATGCGTTCGCAC-3’;
引物P2ANlucR2:
5’-AGGTCCAGGGTTCTCCTCCACGTCTCCAGCCTGCTTCAGCAGGCTGAAGTTAG-3’;
3)Nluc-P2A片段的克隆:以Nluc2ApGEMT为模板,引物3和引物4为特异性引物,扩增出Nluc-P2A片段;所述引物3和引物4的序列为:
引物3:
5’-CAAATGGACTCGTGATGGTCTTCACACTCGAAG-3’;
引物4:
5’-CTTCCCGGCCATAGGTCCAGGGTTCTCCTC-3’;
4)C1-AflⅡ片段的克隆:以TBEVFL为模板,引物5和引物6为特异性引物,扩增出C1-AflⅡ片段;所述引物5和引物6的序列为:
引物5:
5’-GAACCCTGGACCTATGGCCGGGAAGGCCATTC-3’;
引物6:
5’-CTTAAGCAACACTCCAGTCTGG-3’;
5)构建SnaBI-C38-Nluc-P2A-C1-AflⅡ片段:以引物1和引物6为特异性引物,以步骤1)获得的SnaBI-C38片段、步骤3)获得的Nluc-P2A片段和步骤4)获得的C1-AflⅡ片段为模板,通过重叠延伸PCR,将三个片段连接在一起,得到SnaBI-C38-Nluc-P2A-C1-AflⅡ片段;
6)将SnaBI-C38-Nluc-P2A-C1-AflⅡ片段和TBEV的感染性克隆用SnaBI和AflⅡ双酶切,将酶切片段跑胶回收,再用T4连接酶进行连接,获得蜱传脑炎病毒报告病毒TBEVNluc2A。


2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述蜱传脑炎病毒报告病毒TBEVNluc2A的DNA序列如SEQIDNO.1所示。


3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,步...

【专利技术属性】
技术研发人员:朱春玉王旌羽李辉张学敏高薇胡媛媛
申请(专利权)人:辽宁大学
类型:发明
国别省市:辽宁;21

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