【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】含有优良事件EE
‑
GM4的植物,和用于在生物样品中识别所述事件的方法和试剂盒,以及其处理
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2018年5月25日提交的第62/676,434号美国临时申请和2018 年6月18日提交的第62/686,662号美国临时申请权利,以上申请的内容以全文引用的方式并入本文中。
[0003]本专利技术涉及转基因大豆植物、植物材料和种子,其特征在于在大豆基因组中的特定位置处具有赋予线虫抗性和除草剂耐受性的特定转化事件,用如本文所述的化合物和/或生物防治剂或混合物处理。本专利技术还涉及用如本文所述的化合物和/或生物防治剂或混合物处理的种子,并且涉及改良包含至少如所描述的优良事件的大豆产率的方法,其中大豆植物或种子或其中生长或打算生长大豆植物或种子的土壤用如本文所述的化合物和/或生物防治剂或混合物处理。在不存在一种或多种HPPD抑制剂除草剂或线虫侵染的情况下,在等效于相应非转化大豆遗传背景的不同遗传背景中,本专利技术的大豆植物组合线虫抗性和除草剂耐受性表型与农学性能、遗传稳定性和功能性。
技术介绍
[0004]转基因在植物中的表型表达通过一种或多种基因自身的结构或其在植物基因组中的位置来确定。同时,基因组中的不同位置处转基因或“插入T
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DNA”的存在将以不同方式影响植物的总体表型。农学上或工业上,通过遗传操纵成功地在植物中引入商业上令人感兴趣的性状可为取决于不同因素的冗长程序。经遗传转化的植物的实际转化和再生仅是一系列选择步骤 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种大豆植物、细胞、植物部分或种子,其包含以下核酸分子中的任一个:a)核酸分子,其包含与SEQ ID No.1、3或5中任一个的序列或与SEQ ID No.2、4或6中任一个的序列或所述序列的互补序列基本上类似的核苷酸序列,b)核酸分子,其包含与SEQ ID No.3、4、5、6、24或25的核苷酸序列或其互补序列具有至少99%序列一致性的核苷酸序列,c)核酸分子,其包含SEQ ID No.1或3或SEQ ID No.2或4中任一个的核苷酸序列或所述序列的互补序列,或包含SEQ ID No.1或3和SEQ ID No.2或4的核苷酸序列或其互补序列,d)核酸分子,其包含SEQ ID No.1或3或SEQ ID No.2或4中任一个的核苷酸序列或所述序列的互补序列,和SEQ ID No.7和9的核苷酸序列或其互补序列,或包含SEQ ID No.1或3和SEQ ID No.2或4的核苷酸序列或所述序列的互补序列,和SEQ ID No.7和9的核苷酸序列或其互补序列,e)核酸分子,其包含SEQ ID No.11核苷酸位置188到核苷酸位置7368的核苷酸序列,或与其具有至少98%、或至少99%、或至少99.5%或至少99.9%序列一致性的核苷酸序列,f)核酸分子,其包含SEQ ID No.11核苷酸位置188到核苷酸位置7101的核苷酸序列,其包含SEQ ID No.5或24和SEQ ID No.6或24的核苷酸序列或其互补序列,g)核酸分子,其能够从以登录号PTA
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123624保藏于ATCC的种子获得,其中所述核酸分子包含SEQ ID No.1、3或5中任一个的核苷酸序列和SEQ ID No.2、4或6中任一个的核苷酸序列,其中所述大豆植物、细胞、植物部分、种子或其后代或其生长或打算生长的土壤用如本文所述的化合物和/或生物防治剂或其混合物中的一种或多种,如来自以下中的任一个的化合物和/或生物防治剂或混合物处理:H1、H2、H3、H4、H5、IAN1、IAN2、IAN3、IAN4、IAN5、IAN6、IAN7、IAN8、IAN9、IAN10、IAN11、IAN12、IAN13、IAN14、IAN15、IAN16、IAN17、IAN18、IAN19、IAN20、IAN21、IAN22、IAN23、IAN24、IAN25、IAN26、IAN27、IAN28、IAN29、IAN30、SIAN1、F1、F2、F3、F4、F5、F6、F7、F8、F9、F9、F10、F11、F12、F13、F14、F15、F16、SF1、P1、BCA1、BCA2、BCA3、BCA4、BCA5、BCA6、BCA7、BCA8;BCA9、BCA10、NC1、NC2、NC3、SBCA1、SAI1、SC1和SC2。2.一种大豆植物、细胞、植物部分或种子,其在其基因组中各自包含优良事件EE
‑
GM4,其中所述优良事件为基因座包含含有嵌合HPPD
‑
4蛋白质编码基因和嵌合Cry14Ab
‑
1蛋白质编码基因的插入T
‑
DNA,和直接环绕所述插入T
‑
DNA的5'和3'侧接序列,如以保藏号PTA
‑
123624保藏于ATCC的参考种子,如还包含SEQ ID No.3的核苷酸序列和SEQ ID No.4的核苷酸序列的所述植物、细胞、部分或种子中所发现,其中所述大豆植物、细胞、植物部分或种子或其生长或打算生长的土壤用如本文所述的化合物和/或生物防治剂或其混合物中的一种或多种处理。3.根据权利要求1或2所述的植物、植物部分或种子,其中其生长或打算生长的土壤用所述化合物和/或生物防治剂或其混合物中的一种或多种处理,并且其中所述植物、植物部分或种子在用如本文所述的化合物和/或生物防治剂或其混合物中的一种或多种处理的土壤中种植或播种。4.根据权利要求1到3中任一项所述的植物、细胞、植物部分或种子,其中所述植物、细胞、植物部分或种子还包含原生大豆SCN抗性基因座或基因,如来自以下抗性源的SCN抗性基因或基因座中的任一个:PI 548316、PI 567305、PI 437654、PI 90763、PI 404198B、PI 88788、PI 468916、PI 567516C、PI 209332、PI 438489B、PI 89772、Peking、PI 548402、PI 404198A、PI 561389B、PI 629013、PI 507471、PI 633736、PI 507354、PI 404166、PI 437655、PI 467312、PI 567328、PI 22897或PI 494182,或来自表1的抗性源的SCN抗性基因
或基因座中的任一个,或来自抗性源PI 88788、PI 548402、PI 209332、PI 437654或其组合的SCN抗性基因或基因座中的任一个。5.一种杂草防除的方法,其包含在所述大豆植物出苗之前但在播种所述种子之后,用HPPD抑制剂除草剂和杀线虫剂处理播种根据权利要求1到4中任一项所述的大豆种子的田地。6.一种方法,其用于保护根据权利要求1到4中任一项所述的出苗大豆植物以免与杂草竞争,所述方法包含在种植所述大豆植物或播种所述种子之前,用HPPD抑制剂除草剂和杀线虫剂处理待播种或种植所述大豆种子或植物的田地,随后在已处理的所述田地中种植或播种所述大豆植物或种子。7.根据权利要求5或6所述的方法,其中所述杀线虫剂为或含有杀线虫化合物或杀线虫生物防治剂(如坚强芽孢杆菌(Bacillus firmus)、西沢巴斯德氏芽菌(Pasteuria nishizawae)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、里诺吉伯克氏菌(Burkholderia rinojensis)或解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)),如本文所述。8.一种方法,其用于产生对SCN具有抗性和/或对HPPD抑制剂除草剂具有耐受性的大豆植物,其包含将对SCN的抗性和/或对HPPD抑制剂除草剂的耐受性引入到大豆植物的基因组中,其通过使第一大豆植物,如不具有Cry14Ab
‑
1编码基因并且不具有HPPD
‑
4编码基因的大豆植物,与包含优良事件EE
‑
GM4的第二大豆植物杂交,并且选择包含优良事件EE
‑
GM4的后代植物的种子,所述方法包括用如本文所述的一种或多种化合物和/或一种或多种生物防治剂或包含其的混合物中的一种或多种处理所述种子的步骤,其中所述优良事件包含根据权利要求1所述的核酸分子,或其中所述优良事件为所述基因座包含含有嵌合HPPD
‑
4蛋白质编码基因和嵌合Cry14Ab
‑
1蛋白质编码基因的插入T
‑
DNA,和直接环绕所述插入T
‑
DNA的5'和3'侧接序列,如以保藏号PTA
‑
123624保藏于ATCC的参考种子,如还包含SEQ ID No.3的核苷酸序列和SEQ ID No.4的核苷酸序列的所述植物中所发现。9.一种根据权利要求1到4中任一项所述的植物、种子、部分或细胞以及所述化合物和/或生物防治剂或混合物的用途,其用于产生大豆种子。10.一种根据权利要求1到4中任一项所述的经处理的大豆植物或种子的用途,其用于生长线虫抗性和/或HPPD抑制剂除草剂耐受性植物。11.一种增加大豆植物产率的方法,其用于当在含有、曾含有或预期含有线虫或线虫卵,如SCN、RKN、短体线虫(Pratylenchus)或肾形线虫的田地中种植时,所述方法包含以下步骤:1)获得包含优良事件EE
‑
GM4的大豆植物或种子,和2)在所述田地中种植或播种所述植物或种子,其中包含所述优良事件的参考种子以保藏号PTA
‑
123624保藏于ATCC,所述方法包含用如本文所述的一种或多种化合物和/或一种或多种生物防治剂或包含其的混合物中的一种或多种处理所述植物或种子的步骤。12.一种增加大豆植物产率的方法,其用于侵染有猝死综合征的含SCN田地中,或引起大豆的缺铁失绿症的含SCN田地中的大豆植物,所述方法包含播种包含优良事件EE
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GM4的经处理的种子,其中包含所述优良事件的参考种子以保藏号PTA
‑
123624保藏于ATCC,其中所述种子用如本文所述的一种或多种化合物和/或一种或多种生物防治剂或包含其的混合物中的一种或多种,如一种或多种杀线虫、杀昆虫或杀真菌化合物和/或一种或多种生物防
治剂,或一种或多种杀线虫、杀昆虫和杀真菌化合物和/或生物防治剂的组合处理。13.根据权利要求1到4中任一项所述的植物、细胞、植物部分或种子,或其生长或打算生长的土壤,其用以下杀线虫剂中的任一种处理:棉铃威(alanycarb)、涕灭威(aldicarb)、虫螨威(carbofuran)、丁硫克百威(carbosulfan)、噻唑磷(fosthiazate)、硫线磷(cadusafos)、杀线威(oxamyl)、硫双灭多威(thiodicarb)、乐果(dimethoate)、灭线磷(ethoprophos)、特丁硫磷(terbufos)、阿维菌素(abamectin)、溴甲烷和其它卤代烃、选自棉隆(diazomet)和威百亩(metam)的异氰酸甲酯产生剂、三氟咪啶酰胺(fluazaindolizine)、联氟砜(fluensulfone)、氟吡菌酰胺(fluopyram)、噻恶嗪芬(tioxazafen)、N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺、顺式茉莉酮(cis
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Jasmone)、过敏蛋白(harpin)、印楝油(Azadirachta indica oil)或印楝素(Azadirachtin)。14.根据权利要求1到4中任一项所述的植物、细胞、植物部分或种子,或其生长或打算生长的土壤,其用以下杀线虫剂中的任一种处理:噻唑磷、硫线磷、硫双灭多威、阿维菌素、三氟咪啶酰胺、氟吡菌酰胺、噻恶嗪芬、N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺、顺式茉莉酮、过敏蛋白、印楝油或印楝素。15.根据权利要求14所述的植物、细胞、植物部分或种子,其用选自由以下组成的群组的组合处理:噻唑磷和硫线磷、噻唑磷和硫双灭多威、噻唑磷和阿维菌素、噻唑磷和三氟咪啶酰胺、噻唑磷和氟吡菌酰胺、噻唑磷和噻恶嗪芬、噻唑磷和N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺、噻唑磷和顺式茉莉酮、噻唑磷和过敏蛋白、噻唑磷和印楝油、噻唑磷和印楝素、硫线磷和噻唑磷、硫线磷和硫双灭多威、硫线磷和阿维菌素、硫线磷和三氟咪啶酰胺、硫线磷和氟吡菌酰胺、硫线磷和噻恶嗪芬、硫线磷和N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺、硫线磷和顺式茉莉酮、硫线磷和过敏蛋白、硫线磷和印楝油、硫线磷和印楝素、硫双灭多威和噻唑磷、硫双灭多威和硫线磷、硫双灭多威和阿维菌素、硫双灭多威和三氟咪啶酰胺、硫双灭多威和氟吡菌酰胺、硫双灭多威和噻恶嗪芬、硫双灭多威和N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺、硫双灭多威和顺式茉莉酮、硫双灭多威和过敏蛋白、硫双灭多威和印楝油、阿维菌素和硫线磷、阿维菌素和硫双灭多威、阿维菌素和三氟咪啶酰胺、阿维菌素和氟吡菌酰胺、阿维菌素和噻恶嗪芬、阿维菌素和N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺、阿维菌素和顺式茉莉酮、阿维菌素和过敏蛋白、阿维菌素和印楝油、阿维菌素和印楝素、三氟咪啶酰胺和阿维菌素、三氟咪啶酰胺和氟吡菌酰胺、三氟咪啶酰胺和噻恶嗪芬、三氟咪啶酰胺和N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺、三氟咪啶酰胺和顺式茉莉酮、三氟咪啶酰胺和过敏蛋白、三氟咪啶酰胺和印楝油、三氟咪啶酰胺和印楝素、氟吡菌酰胺和三氟咪啶酰胺、氟吡菌酰胺和噻恶嗪芬、氟吡菌酰胺和N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺、氟吡菌酰胺和顺式茉莉酮、氟吡菌酰胺和过敏蛋白、氟吡菌酰胺和印楝油、氟吡菌酰胺和印楝素、噻恶嗪芬和N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺、噻恶嗪芬和顺式茉莉酮、噻恶嗪芬和过敏蛋白、噻恶嗪芬和印楝油、噻恶嗪芬和印楝素、N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺和顺式茉莉酮、N
‑
[1
‑
(2,6
‑
二氟苯基)
‑
1H
‑
吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺和过敏蛋白、N
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[1
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(2,6
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二氟苯基)
‑
1H
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吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺和印楝油、N
‑
[1
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(2,6
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二氟苯基)
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1H
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吡唑
‑3‑
基]
‑2‑
三氟甲基苯甲酰胺和印楝素、顺式茉莉酮和过敏蛋白、顺式茉莉酮和印楝油、顺式茉莉酮和印楝素、过敏蛋白和印楝油以及过敏蛋白和印楝素。16.根据权利要求1到4或13到15中任一项所述的植物、细胞、植物部分或种子,或其生长或打算生长的土壤,其用选自由以下组成的群组的生物防治剂处理:芽孢杆菌(Bacillus)属菌株、短芽孢杆菌(Brevibacillus)属菌株、伯克氏菌(Burkholderia)属菌株、溶杆菌(Lysobacter)属菌株、巴斯德氏芽菌(Pasteuria)属菌株、节丛孢(Arthrobotrys)属菌株、毒虫霉(Nematoctonus)属菌株、漆斑菌(Myrothecium)属菌株、拟青霉(Paecilomyces)属菌株、木霉(Trichoderma)属菌株和冢村氏菌(Tsukamurella)属菌株。17.根据权利要求16所述的植物、细胞、植物部分或种子,或其生长或打算生长的土壤,其用选自由以下组成的群组的生物防治剂处理:解淀粉芽孢杆菌、坚强芽孢杆菌、侧孢芽孢杆菌(Bacillus laterosporus)、迟缓芽孢杆菌(Bacillus lentus)、地衣芽孢杆菌、线虫芽孢杆菌(Bacillus nematocida)、短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)、枯草芽孢杆菌、穿刺芽孢杆菌(Bacillus penetrans)、苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)、侧孢短芽孢杆菌(Brevibacillus laterosporus)、里诺吉伯克氏菌、抗生素溶杆菌(Lysobacter antibioticus)、产酶溶杆菌(Lysobacter enzymogenes)、西沢巴斯德氏芽菌、穿刺巴斯德氏芽菌(Pasteuria penetrans)、分支巴斯德氏芽菌(Pasteuria ramosa)、肾状巴斯德氏芽菌(Pasteuria reniformis)、多刺巴斯德氏芽菌(Pasteuria thornei)、美高协巴斯德氏芽菌(Pasteuria usage)、指状节丛孢(Arthrobotrys dactyloides)、少孢节丛孢(Arthrobotrys oligospora)、多孢节丛孢(Arthrobotrys superba)、地理毒虫霉(Nematoctonus geogenius)、滑孢毒虫霉(Nematoctonus leiosporus)、疣孢漆斑菌(Myrothecium verrucaria)、淡紫拟青霉(Paecilomyces lilacinus)、宛氏拟青霉(Paecilomyces variotii)、棘孢木霉(Trichoderma asperellum)、哈茨木霉(Trichoderma harzianum)、绿色木霉(Trichoderma viride)、里法依哈茨木霉(Trichoderma harzianum rifai)和微代谢冢村氏菌(Tsukamurella paurometabola)。18.根据权利要求17所述的植物、细胞、植物部分或种子,或其生长或打算生长的土壤,其用选自由以下组成的群组的生物防治剂处理:解淀粉芽孢杆菌菌株IN937a、解淀粉芽孢杆菌菌株FZB42、解淀粉芽孢杆菌菌株FZB24、解淀粉芽孢杆菌菌株NRRL B
‑
50349、解淀粉芽孢杆菌菌株ABI01、解淀粉芽孢杆菌菌株B3、解淀粉芽孢杆菌菌株D747、解淀粉芽孢杆菌菌株APM
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1、解淀粉芽孢杆菌菌株TJ1000、解淀粉芽孢杆菌菌株AP
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136、解淀粉芽孢杆菌菌株AP
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188、解淀粉芽孢杆菌菌株AP
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218、解淀粉芽孢杆菌菌株AP
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219、解淀粉芽孢杆菌菌株AP
‑
295、解淀粉芽孢杆菌菌株MBI 600、解淀粉芽孢杆菌菌株PTA
‑
4838、解淀粉芽孢杆菌菌株F727、坚强芽孢杆菌菌株I
‑
1582、坚强芽孢杆菌菌株NRRL B
‑
67003、坚强芽孢杆菌菌株NRRL B
‑
67518、坚强芽孢杆菌菌株GB126、侧孢芽孢杆菌菌株ATCC PTA
‑
3952、侧孢芽孢杆菌菌株ATCC PTA
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3593、地衣芽孢杆菌菌株ATCC PTA
‑
6175、地衣芽孢杆菌SB3086、地衣芽孢杆菌CH200、地衣芽孢杆菌RTI 184、地衣芽孢杆菌CH200和地衣芽孢杆菌RTI 184的组合、枯草芽孢杆菌解淀粉变种菌株FZB24、苏云金芽孢杆菌菌株EX297512、苏云金芽孢杆菌菌株CR
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371或苏云金芽孢杆菌菌株AQ52、侧孢短芽孢杆菌菌株ATCC 64、侧孢短芽孢杆菌菌株NRS 1111、侧孢短芽孢杆菌菌株NRS 1645、侧孢短芽孢杆菌菌株NRS 1647、侧孢短芽孢杆菌菌株
BPM3、侧孢短芽孢杆菌菌株G4、侧孢短芽孢杆菌菌株NCIMB 41419、里诺吉伯克氏菌、里诺吉伯克氏菌菌株A396、抗生素溶杆菌菌株13
‑
1、产酶溶杆菌菌株C3、疣孢漆斑菌菌株AARC
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0255、淡紫拟青霉菌株251、宛氏拟青霉菌株Q
‑
09、西沢巴斯德氏芽菌菌株Pn1、棘孢木霉菌株ICC 012、棘孢木霉菌株SKT
‑
1、棘孢木霉菌株T34、棘孢木霉菌株T25、棘孢木霉菌株SF04、棘孢木霉菌株TV1、棘孢木霉菌株T11、哈茨木霉菌株ICC012、里法依哈茨木霉T39、里法依哈茨木霉菌株KRL
‑
AG2、绿色木霉菌株TV1、绿色木霉菌株TV25、深绿木霉(Trichoderma atroviride)菌株CNCM I
‑
1237、深绿木霉菌株CNCM I
‑
1237、深绿木霉菌株NMI编号V08/002387、深绿木霉菌株NMI编号V08/002388、深绿木霉菌株NMI编号V08/002389、深绿木霉菌株NMI编号V08/002390、深绿木霉菌株ATCC 20476、深绿木霉菌株T11、深绿木霉菌株LC52、深绿木霉菌株SC1、深绿木霉菌株SKT
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1、深绿木霉菌株SKT
‑
2、深绿木霉菌株SKT
‑
3和微代谢冢村氏菌菌株C
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92。19.根据权利要求1到4中任一项或根据权利要求13到18中任一项所述的植物、细胞、植物部分或种子,其中所述处理为种子处理...
【专利技术属性】
技术研发人员:H,
申请(专利权)人:巴斯夫农业种子解决方案美国有限责任公司,
类型:发明
国别省市:
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