【技术实现步骤摘要】
快速简易提取厌氧真菌DNA的方法及应用
本专利技术涉及菌株DNA的提取
,具体涉及快速简易提取厌氧真菌DNA的方法及应用。
技术介绍
厌氧真菌的DNA提取是厌氧真菌分子生物学研究中一项重要工作。目前,真菌基因组提取方法主要有CTAB法、SDS提取法、尿素提取法及酶解法等。上述提取方法的提取步骤大体相似,关键在于如何有效的破碎细胞壁。目前,常用的厌氧真菌细胞破壁的方法有(1)经典的液氮研磨法。(2)液氮冻融(和玻璃珠振荡)法。该方法使用液氮,增加了成本及设备要求;(3)酶解法。用于丝状真菌破壁的酶比较昂贵,在处理大量样品时很不经济;(4)化学试剂(氯化苄)法。化学试剂存在环保上的隐患。上述提取厌氧真菌DNA的方法大多为液氮研磨破碎厌氧真菌的细胞壁,但是破壁效果差,或用专用细胞破碎仪破碎厌氧真菌的细胞壁,然而细胞破碎仪的成本高,破壁过程繁琐,普及率不高。本领域技术人员最常用的真菌基因组提取方法是CTAB法,但CTAB法提取过程繁琐,所需试剂种类繁多,提取效果一般。针对上述技术问题,本领域技术人员研究出来了用于提取厌 ...
【技术保护点】
1.快速简易提取厌氧真菌DNA的方法,其特征在于,所述的方法包括如下步骤:/n(1)菌株培养:将厌氧真菌接种在厌氧培养基里,加入复合抗生素,静置培养;/n(2)收集菌体:将步骤(1)得到的菌液离心,取菌丝体;/n(3)破壁:将步骤(2)得到的菌丝体被快速液氮研磨后取0.1-1g加入到离心管中,再加入钢珠,冷却,振荡离心管,振荡期间离心管保持冷冻状态,使厌氧真菌细胞壁破碎;/n(4)抽提DNA:向步骤(3)得到的溶液中加入抽提缓冲液,振荡,恒温水浴后,加入乙酸铵,混匀,冷却,离心,取上清液,弃沉淀物和钢珠;上清液用等体积的Tris饱和酚:氯仿:异戊醇溶液抽提2次,混匀,离心, ...
【技术特征摘要】 【专利技术属性】
1.快速简易提取厌氧真菌DNA的方法,其特征在于,所述的方法包括如下步骤:
(1)菌株培养:将厌氧真菌接种在厌氧培养基里,加入复合抗生素,静置培养;
(2)收集菌体:将步骤(1)得到的菌液离心,取菌丝体;
(3)破壁:将步骤(2)得到的菌丝体被快速液氮研磨后取0.1-1g加入到离心管中,再加入钢珠,冷却,振荡离心管,振荡期间离心管保持冷冻状态,使厌氧真菌细胞壁破碎;
(4)抽提DNA:向步骤(3)得到的溶液中加入抽提缓冲液,振荡,恒温水浴后,加入乙酸铵,混匀,冷却,离心,取上清液,弃沉淀物和钢珠;上清液用等体积的Tris饱和酚:氯仿:异戊醇溶液抽提2次,混匀,离心,去除杂蛋白;
(5)沉淀DNA:取步骤(4)得到的上层水相至另一离心管中,加入异丙醇,混匀,低温放置以沉淀DNA;离心,弃上清,用乙醇洗涤沉淀,用无菌双蒸水溶解沉淀,即得厌氧真菌DNA。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述的厌氧培养基的配制步骤如下:酵母膏1.0g,蛋白胨1.0g,葡萄糖1.0g,NaHCO37.0g,刃天青1.0g/L1mL,L-半胱氨酸盐酸盐1.7g,晨饲前采集瘤胃液8000×g,4℃离心20min后的上清170mL,盐溶液I165mL,盐溶液II165mL,蒸馏水定容至1000mL;盐溶液I的配制步骤如下:NaCl6g,(NH4)2SO43g,KH2PO43g,CaCl2·2H2O0.4g,MgSO4·2H2O0.6g,蒸馏水定容至1000mL;盐溶液II配制步骤如下:K2HPO44g,蒸馏水定容至1000mL。
技术研发人员:魏亚琴,王霄霄,苟琦敏,
申请(专利权)人:甘肃省科学院生物研究所,
类型:发明
国别省市:甘肃;62
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