基于GC-MS建立分子网络的方法及其应用技术

本发明专利技术公开了一种基于GC‑MS建立分子网络的方法，包括：GC‑MS分析与原始数据采集；使用MSconvert软件将原始数据转换成mzXML格式；采用ADAP对原始数据进行处理，构建提取的离子色谱图EICs，并检测色谱峰；利用光谱反褶积对色谱图进行比对和层次聚类；生成.mgf文件和.csv文件；用MetGem软件打开.mgf文件和.csv文件，形成分子网络；使用可视化软件，进行分子网络图编辑。本发明专利技术实现了GC‑MS分子网络的建立，该方法可用于单个或多个样本中不同分子结构族群的鉴定，还可用于指导香原料的开发、鉴别和挥发性代谢物的标记等。

【技术实现步骤摘要】
基于GC-MS建立分子网络的方法及其应用
本专利技术涉及气相色谱-质谱联用数据解析
，特别是一种基于GC-MS建立分子网络的方法及其应用。
技术介绍
现有分子网络，根据二级质谱碎片离子(MS/MS)的相似度，将具有相似结构的天然产物分子按照相似度高低依次整合为一张可视化的网络图谱。通过分子网络图可以清晰地看到一个样本中所有的质谱碎片离子及它们之间的相互关系，同一类化合物分子聚集成簇，而不同类型的化合物将形成多个不同的分子簇。该技术可用于快速分析复杂样本中的已知化合物及其类似物，以及不同来源样本的化学成分定量表征。分子网络技术已经在微生物、海洋生物、植物、药物代谢等方面取得了不错的研究进展，尤其在近3年的时间，迅速成为研究人员的关注热点。但是目前使用的分子网络都是基于LC-MS/MS而建立的，适用于难挥发性成分的分析检测，对于挥发性成分是不可行的。因为关于挥发性成分的研究中，使用的是GC-MS分析技术。挥发性成分的感官特征是与其化学成分的结构相关的，尤其是特定的香味特征往往与结构中的某种官能团或结构片段相关。例如羧基、醛基、酯和羟基本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于GC-MS建立分子网络的方法，其特征在于，包括以下步骤：/n(1)GC-MS分析与原始数据采集；/n(2)使用MSconvert软件将原始数据转换成mzXML格式；/n(3)采用ADAP对原始数据进行处理，构建提取的离子色谱图EICs，并检测色谱峰；/n(4)利用光谱反褶积对色谱图进行比对和层次聚类；/n(5)生成.mgf文件和.csv文件；/n(6)用MetGem软件打开步骤(5)的.mgf文件和.csv文件，形成分子网络；/n(7)使用可视化软件，进行分子网络图编辑。/n

【技术特征摘要】
1.一种基于GC-MS建立分子网络的方法，其特征在于，包括以下步骤：
(1)GC-MS分析与原始数据采集；
(2)使用MSconvert软件将原始数据转换成mzXML格式；
(3)采用ADAP对原始数据进行处理，构建提取的离子色谱图EICs，并检测色谱峰；
(4)利用光谱反褶积对色谱图进行比对和层次聚类；
(5)生成.mgf文件和.csv文件；
(6)用MetGem软件打开步骤(5)的.mgf文件和.csv文件，形成分子网络；
(7)使用可视化软件，进行分子网络图编辑。


2.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法，其特征在于，步骤(1)中的GC-MS分析，质谱条件为EI源，并采用全扫模式。


3.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法，其特征在于，步骤(3)中ADAP对原始数据进行处理时，参数设置为：信噪比为5-8，最小峰高为100-2000，系数阈值为50-100，峰漂移时间范围为0-0.5分钟，保留时间漂移范围为0-0.5分钟。


4.根据权利要求1所述的基于GC-MS建立分子网络的方法，其特征在于，步骤(4)中的光谱反褶积对色谱图进行比对和层次聚类采用RANSAC算法。


5.根据权利要求1所述的基于GC...

【专利技术属性】
技术研发人员：叶烨，李东亮，
申请(专利权)人：四川中烟工业有限责任公司，
类型：发明
国别省市：四川;51