【技术实现步骤摘要】
一种用于乳腺癌患者预后预测的模型及建立方法
本专利技术属于生物医学
,涉及一种用于乳腺癌患者预后预测的模型及建立方法。
技术介绍
乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤。自上世纪70年代末,随着生活习惯的改变和人口老龄化的加速,乳腺癌的发病率在世界范围内呈现逐年递增趋势,2018年全球女性乳腺癌新发病例高达2,088,849例,占所有新发肿瘤的11.6%;死亡病例达626,679例,占肿瘤死亡病例总数的6.6%。据我国肿瘤登记中心的统计数据显示,2015年全国约有26.86万新增乳腺癌女性患者,其发病率约37.86/10万,高居女性恶性肿瘤榜首。目前,临床主要沿用肿瘤形态学特征及其病理学分期来判断乳腺癌患者的预后情况,常见指标包括:肿瘤大小、有无淋巴结转移、组织学分级及临床病理分期等。近年来,国内外众多研究团队相继发现,乳腺癌是一类在分子水平上具有高度异质性的恶性肿瘤,这种分子异质性致使不同患者在临床表现、治疗反应和预后生存等方面表现出显著的差异。越来越多的临床病例显示,同一病理类型或临床分期的乳腺癌患者,即使经历相同的 ...
【技术保护点】
1.一种用于乳腺癌患者预后预测的模型,其特征在于,由以下十个lncRNAs表达量联合判断:AL138789.1,AL513123.1,LINC00536,BCAR4,AC079414.1,LHX1-DT,AC006262.3,MIR3150BHG,AC105398.1,AL133467.1。/n
【技术特征摘要】
1.一种用于乳腺癌患者预后预测的模型,其特征在于,由以下十个lncRNAs表达量联合判断:AL138789.1,AL513123.1,LINC00536,BCAR4,AC079414.1,LHX1-DT,AC006262.3,MIR3150BHG,AC105398.1,AL133467.1。
2.根据权利要求1所述用于乳腺癌患者预后预测的模型,其特征在于,计算公式为风险评分=(0.634×表达量AL138789.1)+(0.488×表达量AL513123.1)+(0.254×表达量LINC00536)+(0.262×表达量BCAR4)+(0.825×表达量AC079414.1)+(0.253×表达量LHX1-DT)+(1.115×表达量AC006262.3)+(-0.779×表达量MIR3150BHG)+(-1.414×表达量AC105398.1)+(-0.739×表达量AL133467.1)。
3.权利要求1或2所述用于乳腺癌患者预后预测模型的建立方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)数据获取
下载TCGA数据库中乳腺癌患者的临床数据及乳腺癌组织和例正常乳腺组织的RNA-Seq转录组数据;
(2)差异lncRNAs筛选
利用R软件DESeq2包筛选出在乳腺癌组织和正常乳腺组织中差异表达的lncRNAs;
(3)候选预后相关lncRNAs鉴定
利用R软件survival和survminer软件包进行单因素Cox回归分析、Kaplan-Meier生存分析共同鉴定与患者总生存期具有关联性的差异表达的lncRNAs作为候选预后相关lncRNAs;
(4)...
【专利技术属性】
技术研发人员:王传新,杜鲁涛,李培龙,杨雪梅,李娟,齐秋晨,
申请(专利权)人:山东大学第二医院,
类型:发明
国别省市:山东;37
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