一种分子动力学仿真测试系统技术方案

本发明专利技术公开了一种分子动力学仿真测试系统，具体涉及分子动力学技术领域，包括建立模块，用于建立分子动力学数据库和分子动力学仿真软件；所述分子动力学数据库储存于服务器中，且包含有各种分子动力学研究模型；预处理模块，对所述分子动力学数据库进行预设的连接处理，以实现所述分子动力学数据库与所述分子动力学仿真软件Materials Studio的通信连接；仿真测试模块，用于基于所述分子动力学仿真软件Materials Studio、所述分子动力学数据库，对所述分子动力学研究模型进行软硬件协同仿真测试。本发明专利技术可以确保数值计算可复现性，最大程度还原模拟过程，便于程序的移植、调试、验证和确认。

【技术实现步骤摘要】
一种分子动力学仿真测试系统
本专利技术涉及分子动力学
，更具体地说，本专利技术涉及一种分子动力学仿真测试系统。
技术介绍
分子动力学是一门结合物理，数学和化学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，以在由分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本，从而计算体系的构型积分，并以构型积分的结果为基础进一步计算体系的热力学量和其他宏观性质。数值计算可复现性是指当科学计算在具有不同类型和数量的处理单元的同一台或不同的机器上运行多次时，获得相同的结果，是程序调试，验证和确认的关键。在排除随机数因素影响外，数值计算不可复现的原因是计算机表示精度有限，造成浮点的加法运算不具有结合律，即(a+b)+c不等于a+(b+c)。并行计算因其计算量大、并行执行模式复杂加剧了数值计算不可复现的问题。这导致判断是否将程序正确的移植到新的系统越来越困难，因为计算结果很快偏离基准案例。由于计算机只能表示有限精度，表达的计算数据本身存在截断误差，同时由于动态调度，并行执行的影响使得计算顺序存在不确定性。而大规模并本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种分子动力学仿真测试系统，其特征在于，包括：/n建立模块，用于建立分子动力学数据库和分子动力学仿真软件；所述分子动力学数据库储存于服务器中，且包含有各种分子动力学研究模型，基于分子动力学仿真软件Materials Studio构建三维纳米界面模型；/n第一选择模块，用于根据分子动力学研究模型的结构需求，从所述分子动力学数据库中选择目标数据；所述分子动力学数据库在所述分子动力学仿真软件Materials Studio中搭建；/n第二选择模块，用于根据所述分子动力学的功能仿真需求，从所述服务器中选取分子动力学研究模型；/n预处理模块，用于利用所述分子动力学仿真软件Materials Stud...

【技术特征摘要】
1.一种分子动力学仿真测试系统，其特征在于，包括：
建立模块，用于建立分子动力学数据库和分子动力学仿真软件；所述分子动力学数据库储存于服务器中，且包含有各种分子动力学研究模型，基于分子动力学仿真软件MaterialsStudio构建三维纳米界面模型；
第一选择模块，用于根据分子动力学研究模型的结构需求，从所述分子动力学数据库中选择目标数据；所述分子动力学数据库在所述分子动力学仿真软件MaterialsStudio中搭建；
第二选择模块，用于根据所述分子动力学的功能仿真需求，从所述服务器中选取分子动力学研究模型；
预处理模块，用于利用所述分子动力学仿真软件MaterialsStudio，对所述分子动力学数据库进行预设的连接处理，以实现所述分子动力学数据库与所述分子动力学仿真软件MaterialsStudio的通信连接；
仿真测试模块，用于基于所述分子动力学仿真软件MaterialsStudio、所述分子动力学数据库，对所述分子动力学研究模型进行软硬件协同仿真测试。


2.根据权利要求1所述的一种分子动力学仿真测试系统，其特征在于，所述仿真测试模...

【专利技术属性】
技术研发人员：包建东，钟岗，王财勇，
申请(专利权)人：安徽众新电子科技有限公司，
类型：发明
国别省市：安徽;34