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用于筛查鼻咽癌的方法及应用技术

技术编号:26783400 阅读:134 留言:0更新日期:2020-12-22 16:56
本发明专利技术公开用于筛查鼻咽癌的方法及应用。本发明专利技术的方法包括:测量来源于EBV阳性鼻咽癌细胞系中SYK基因两端或其内部的EBV相关超级增强子的信号强度得到测量值的步骤;将所述测量值与对照值比较的步骤;当测量值高于对照值时,将受试者评估为患鼻咽癌的风险高,当测量值低于或等于对照值时,将受试者评估为患鼻咽癌的风险低。本发明专利技术通过探索超级增强子在EBV阳性鼻咽癌细胞系中的特征,揭示了一种EBV在鼻咽癌细胞中产生新的超级增强子,引起促癌基因SYK的表达上调,并进一步调控鼻咽癌细胞发生发展的新机制以及与鼻咽癌治疗相关的新策略,其调控机制进一步在细胞水平和空间结构进行了验证。

【技术实现步骤摘要】
用于筛查鼻咽癌的方法及应用
本专利技术属于生物医学领域,具体涉及用于筛查鼻咽癌的方法及应用。
技术介绍
鼻咽癌(nasopharyngealcarcinomas,NPC)是原发于鼻咽部上皮的恶性肿瘤,在我国南方和东南亚地区高发,具有明显的地域性。世界卫生组织将鼻咽癌分为三种类型:鳞状细胞癌(WHO1型)、非角化性癌(WHO2型)和未分化癌(WHO3型)。目前认为鼻咽癌的发生主要与EB病毒(Epstein-Barrvirus,EBV)感染、遗传易感性、饮食与环境等因素相关,几乎98%的鼻咽癌与EBV感染相关。EBV(又称为人类疱疹病毒4,humanherpesvirustype4,HHV4),由双链DNA包裹的环状核心蛋白、核衣壳、被膜、包膜构成,是第一个发现的与人类肿瘤相关的病毒。EBV主要经唾液传播,感染世界上大约95%的人口,是最常见,持续性的病毒感染。EBV可感染B淋巴细胞和上皮细胞。在急性感染期,EBV最初感染口咽部的复层鳞状上皮,随后复制并感染口咽部的B淋巴细胞,并能长期潜伏于循环记忆B淋巴细胞中。通常首次感染EBV后,无明显本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于筛查鼻咽癌的方法,其特征在于,所述方法包括:/na.测量来源于EBV阳性受试者的样品中SYK基因两端或其内部的EBV相关超级增强子的信号强度得到测量值的步骤;/nb.将所述测量值与对照值比较的步骤;和/nc.当所述测量值高于所述对照值时,将所述受试者评估为患鼻咽癌的风险高,当所述测量值低于或等于所述对照值时,将所述受试者评估为患鼻咽癌的风险低。/n

【技术特征摘要】
1.一种用于筛查鼻咽癌的方法,其特征在于,所述方法包括:
a.测量来源于EBV阳性受试者的样品中SYK基因两端或其内部的EBV相关超级增强子的信号强度得到测量值的步骤;
b.将所述测量值与对照值比较的步骤;和
c.当所述测量值高于所述对照值时,将所述受试者评估为患鼻咽癌的风险高,当所述测量值低于或等于所述对照值时,将所述受试者评估为患鼻咽癌的风险低。


2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对照值为从与所述受试者的年龄相当的正常对象的样品获得的SYK基因两端或其内部的EBV相关超级增强子的信号强度值。


3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述样品为鼻咽癌组织或血液。


4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述超级增强子为H3k27ac富集区;优选地,所述超级增强子包含至少2个能够与H3K27ac结合的区域,且各区域的片段间隔小于12.5kb。


5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述超级增强子通过以下步骤确定:采用H3K27ac抗体,特异性地富集结合的DNA片段,构建文库后进行高通量测序,得到测序数据后进行数据处理,所述数据处理包括找到H3k27ac富集区域。


6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述数据处理包括:采用macs2鉴定H3k27ac信号峰富...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨帆时伟丽
申请(专利权)人:杨帆时伟丽
类型:发明
国别省市:河南;41

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