一种斑节对虾PmGFPT2基因及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种斑节对虾PmGFPT2基因，所述基因的碱基序列如SEQ ID NO：2所示。所述编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO：3所示。还公开了上述基因或所述基因的编码蛋白在提高斑节对虾耐氨氮方面的应用。以及一种斑节对虾GFPT2基因氨氮相关的SNP位点的筛选方法和上述方法筛选的斑节对虾耐氨氮相关的SNP位点在斑节对虾育种方面的应用。

【技术实现步骤摘要】
一种斑节对虾PmGFPT2基因及其应用
本专利技术属于分子生物学
，具体涉及一种斑节对虾PmGFPT2基因及其应用。
技术介绍
己糖胺通路(HBP)是葡萄糖代谢途径之一，是所有生物普遍存在的代谢途径，葡萄糖进入细胞后，首先转化为6-磷酸葡萄糖(Fru6P)，然后谷氨酰胺6-磷酸果糖酰胺转移酶(glutamine:fructose-6-phosphateaminotransferase2,GFPT2)将氨和Fru6P合成为6-磷酸葡糖胺(GlcN6P)，再经由中间代谢环节，最终产物为二磷酸尿嘧啶N-乙酰氨基葡萄糖(UDP-GlcNAc)。GFPT2是氨基己糖生物合成限速酶，也被称为葡糖胺-6-磷酸合成酶(glucosamine-6-phosphatesynthase)，主要参与几丁质的合成和蛋白质的糖基化，UDP-GlcNAc是细菌和真菌细胞壁的主要成分，是蛋白质糖基化的重要底物，也是几丁质的活性前体，几丁质是节肢动物的表皮和中肠围食膜(PM)的主要成分，是形成哺乳动物的糖蛋白、粘多糖基础，在葡萄糖调节中发挥着重要的作用。与GFPT2作用相本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种斑节对虾PmGFPT2基因，其特征是：所述基因的碱基序列如SEQ ID NO：2所示。/n

【技术特征摘要】
1.一种斑节对虾PmGFPT2基因，其特征是：所述基因的碱基序列如SEQIDNO：2所示。


2.权利要求1所述的斑节对虾PmGFPT2基因的编码蛋白，其特征是：所述编码蛋白的氨基酸序列如SEQIDNO：3所示。


3.根据权利要求1所述的斑节对虾PmGFPT2基因，其特征是：所述PmGFPT2基因的cDNA全长为3399bp，包括开放阅读框ORF2097bp，5’端非编码区(UTR)65bp，3’端非编码区(UTR)1237bp，PmGFPT2基因的ORF推测包含698个氨基酸，分子量为78.3101KDa，理论等电点为6.31。


4.权利要求1所述斑节对虾PmGFPT2基因的克隆方法，其特征是包括以下步骤：首先提取斑节对虾不同离体组织的总RNA，合成cDNA第一条链，用做RACE模板，并将斑节对虾不同离体组织的总RNA反转录，用作荧光定量PCR样品；然后根据斑节对虾cDNA文库中的EST序列，设计PmGFPT2基因ORF的引物和RACE引物，即得到斑节对虾PmGFPT2基因的全长。


5.根据权利要求4所述斑节对虾PmGFPT2基因的克隆方法，其特征是：所述PmGFPT2基因ORF的引物包括qPCR引物PmGFPT2和内参引物PmEF-1α，其中所述qPCR引物PmGFPT2包括PmGFPT2-qF和PmGFPT2-qR，其碱基序列如SEQIDNO：4和SEQIDNO：5所示，所述内参引物PmEF-1α包括PmEF-1α-qF和PmEF-1α-qR，其碱基序列如SEQIDNO：6和SEQIDNO：7所示；所述RACE引物包括PmGFPT2-5’GSP1、PmGFPT2-5’GSP2、PmGFPT2-3’GSP1和PmGFPT2-3’GSP2，其碱基序列分别如SEQIDNO：8～11所示。


6.权利要求1或3所述的基因或权利要求2所述编码蛋白在提高斑节对虾耐氨氮方面的应用。


7.一种斑节对虾PmGFPT2基因氨氮相关的SNP位点的筛选方法，其特征是包括以下步骤：
(1)样品选择：选择非洲野生群体，泰国野生群体和中国三亚野生群体作为SNP位点筛选样品，选择耐氨氮极端群体以及氨氮敏感群体作为SNP分型样品，并选取标...

【专利技术属性】
技术研发人员：李运东，周发林，江世贵，丁阳阳，
申请(专利权)人：中国水产科学研究院南海水产研究所，
类型：发明
国别省市：广东;44