微生物菌株基因组分析方法、装置及电子设备制造方法及图纸

本公开提供了微生物菌株基因组分析方法、装置及电子设备。该方法的一具体实施方式包括：确定目标基因组数据；对目标基因组进行基因组分析，得到相应的基因组分析结果，其中，基因组分析包括比较基因组分析、基因组组分分析和基因功能分析中的至少一种；将目标基因组数据和相应的基因组分析结果发送至目标服务器，以进行存储。该实施方式能够对微生物菌株的基因组测序数据进行加工、整合和存储，实现相关信息的统一化管理。

【技术实现步骤摘要】
微生物菌株基因组分析方法、装置及电子设备
本公开涉及微生物
，具体涉及微生物菌株基因组分析方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质。
技术介绍
微生物菌株可以表示同种微生物不同来源的纯种培养，从自然界中分离得到的每一个微生物纯培养都可称一个菌株。对所有已知的微生物菌株进行全基因组测序数据进行处理、分析、注释、物种鉴定、数据保存以及信息发布是十分重要的。用这些信息可以支撑更深入科学研究和产业应用，最终服务于与人类息息相关的工业生产、农业种植、检验检测、环境保护等领域。但是，目前全球并没有一个完善的平台供人们获取所有已测序的菌株信息。目前已测序的菌株分别来自于全球不同的测序机构，使用了不同的测序方法和数据分析注释算法。对这些数据信息的使用需要统一的质量控制与再加工。因此，有必要提出一种新的对微生物菌株基因组进行分析的技术方案。
技术实现思路
本公开提出了微生物菌株基因组分析方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质。第一方面，本公开提供了一种微生物菌株基因组分析方法，包括：确定目标基因组数据；本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种微生物菌株基因组分析方法，包括：/n确定目标基因组数据；/n对所述目标基因组进行基因组分析，得到相应的基因组分析结果，其中，所述基因组分析包括比较基因组分析、基因组组分分析和基因功能分析中的至少一种；/n将所述目标基因组数据和相应的基因组分析结果发送至目标服务器，以进行存储。/n

【技术特征摘要】
1.一种微生物菌株基因组分析方法，包括：
确定目标基因组数据；
对所述目标基因组进行基因组分析，得到相应的基因组分析结果，其中，所述基因组分析包括比较基因组分析、基因组组分分析和基因功能分析中的至少一种；
将所述目标基因组数据和相应的基因组分析结果发送至目标服务器，以进行存储。


2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述确定目标基因组数据，包括：
获取目标微生物菌株的菌株编号；
在公开基因组数据库中查询与所述目标微生物菌株的菌株编号匹配的公开基因组数据；
响应于查询到，将所查询到的公开基因组数据确定为所述目标基因组数据。


3.根据权利要求2所述的方法，其中，所述确定目标基因组数据，还包括：
响应于未查询到，确定所述目标微生物菌株的高通量测序数据；
将所述目标微生物菌株的高通量测序数据确定为所述目标基因组数据。


4.根据权利要求3所述的方法，其中，所述确定所述目标微生物菌株的高通量测序数据，包括：
获取所述目标微生物菌株对应的多个高通量测序单元；
对所述多个高通量测序单元进行拼接，得到所述基因组数据。


5.根据权利要求4所述的方法，其中，所述对所述多个高通量测序单元进行拼接，得到所述基因组数据，包括：
获取所述目标微生物菌株的16srRNA基因序列，其中，所述16srRNA基因通过对所述目标微生物菌株进行测序获得；
在16srRNA基因序列数据库中查询与所述目标微生物菌株的16srRNA基因序列匹配的参考基因组数据；
响应于查询到，根据所述参考基因组数据对所述多个高通量测序单元进行拼接；
响应于未查询到，对所述多个高通量测序单元进行从头拼接。


6.根据权利要求1所述的方法，其中，所述比较基因组分析包括结构变异共线性分析、共有和特有基因分析、基因家族分析、单核苷酸多态性分析、插入缺失标记分析和进化树分析中的至少一种。
优选地，所述基因组组分分析包括基因成分分析、重复序列分析、非编码RNA预测、CRISPR序列预测中的至少一种；
优选地，所述基因功能分析包括基因组功能注释、致病和耐药性分析中的至少一种。


7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法，其中，所述将所述目标基因组数据和相应的基因组分析结果发送至目标服务器，包括：
将所述基因组分析结果转换为至少一套RDF三元组；
将将所述目标基因组数据和相应的所述至少一套RDF三元组发送至所述目标服务器。


8.一种微生物菌株基因组分析装置，包括：
基因组...

【专利技术属性】
技术研发人员：史文聿，范国梅，孙清岚，吴林寰，马俊才，
申请(专利权)人：中国科学院微生物研究所，
类型：发明
国别省市：北京;11