cfDNA在早期乳腺癌无创诊断中的应用制造技术

本发明专利技术公开了cfDNA在早期乳腺癌无创诊断中的应用，本发明专利技术公开了诊断乳腺癌具有较高敏感性和特异性的cfDNA标志物以及基于该标志物制备的诊断乳腺癌的产品；本发明专利技术同时公开了筛选癌症标志物的方法。

【技术实现步骤摘要】
cfDNA在早期乳腺癌无创诊断中的应用
本专利技术属于生物医药领域，涉及cfDNA在早期乳腺癌无创诊断中的应用。
技术介绍
乳腺癌是女性中最常见的癌症，也是导致女性癌症死亡的第二大原因，仅次于肺癌。国家癌症中心最新统计，我国乳腺癌新发病例主要在30-59岁，是45岁以下女性癌症死亡的首要原因(CHENW,ZHENGR,BAADEPD,etal.CancerstatisticsinChina,2015[J].CACancerJClin,2016,66(2):115-132.)。目前公认的乳腺癌检出黄金标准是三联评估:1)临床检查，2)乳房X线检查和/或超声检查，3)细针穿刺细胞学检查(SALODZ,SINGHY.Comparisonoftheperformanceofmachinelearningalgorithmsinbreastcancerscreeninganddetection:Aprotocol[J].JPublicHealthRes,2019,8(3):1677.)。已证实乳房X线摄影用于乳腺癌筛查可以降低乳腺癌的病死率。乳腺本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于预测早期乳腺癌的标志物，其特征在于，所述标志物选自一个或多个差异甲基化区域，所述差异甲基化区域选自chr1：237343683-237344683、chr2：3723342-3724342、chr2：3978342-3979342、chr2：22327459-22328459、chr4：164543184-164544184、chr6：84666439-84667439、chr8：79343444-79344444、chr15：26569301-26570301、chr15：33374552-33375552、chr15：97703143-97704143。/n

【技术特征摘要】
1.用于预测早期乳腺癌的标志物，其特征在于，所述标志物选自一个或多个差异甲基化区域，所述差异甲基化区域选自chr1：237343683-237344683、chr2：3723342-3724342、chr2：3978342-3979342、chr2：22327459-22328459、chr4：164543184-164544184、chr6：84666439-84667439、chr8：79343444-79344444、chr15：26569301-26570301、chr15：33374552-33375552、chr15：97703143-97704143。


2.一种检测早期乳腺癌的试剂，其特征在于，所述试剂能够检测样本中权利要求1中的所述的标志物的甲基化状态。


3.根据权利要求2所述的试剂，其特征在于，所述试剂采用焦磷酸测序、亚硫酸氢盐测序、定量和/或定性的甲基化特异性聚合酶链式反应、定量和/或定性的亚硫酸氢盐特异性聚合酶链式反应、数字聚合酶链式反应、联合亚硫酸氢盐的靶向测序、DNA印迹法、限制性界标基因组扫描、单核苷酸引物延伸、CpG岛微阵列、单核苷酸引物延伸SNUPE、联合亚硫酸氢钠限制性内切酶分析法或质谱法检测所述的差异甲基化区域的甲基化状态。


4.根据权利要求2所述的试剂，其特征在于，所述试剂包括：
能够扩增所述甲基化区域的引物组；或
能够与所述甲基化区域杂交的探针；或
能够结合所述甲基化区域的甲基化特异性结合蛋白；或
甲基化敏感性限制酶；或
测序引物。


5.根据权利要求2-4任一项所述的试剂，其特征在于，所述样本为血液或血浆样本。


6.一种诊断早期乳腺癌的试剂盒或芯片，其特征在于，包括权利要求2-5任一项所述的试剂。


7.一种筛选癌症标志物的方法，其特征在于，包括以下步骤：
1)获取健康人和患者的组织样本和血液样本；
2)进行组织样本的全基因组甲基化测序和血液样本的cfDNA甲基化测序；
3)确定样本的全基因组甲基化状态，分析cfDNA的甲基化信息；
4)筛选健康人和患者中具有明显差异的甲基化区域作为标志物；
优选的，步骤4)包括：
a.组织差...

【专利技术属性】
技术研发人员：苏建忠，刘嘉琦，赵恒强，许守平，吴南，黄宇宽，
申请(专利权)人：中国科学院大学温州研究院温州生物材料与工程研究所，中国医学科学院肿瘤医院，中国医学科学院北京协和医院，黑龙江省肿瘤医院，
类型：发明
国别省市：浙江;33