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一种个性化药物不良反应预测方法、系统、设备及介质技术方案

技术编号:26175532 阅读:56 留言:0更新日期:2020-10-31 14:09
本发明专利技术提供一种个性化药物不良反应预测方法、系统、设备及介质,属于生物医学技术领域。本发明专利技术提出了基于多核函数学习的多任务学习模型(KEMULA),以替代传统的“一刀切”和“完全个性化”的学习方法。更具体地说,该模型通过假设该模型的共享函数来学习一个受约束的个性化ADR排序函数来计算和排序每个患者的ADR发展风险。该函数称为个性化ADR排序函数,其是计算患者发生相关ADR风险的几个评分函数的线性组合。该模型还结合了拉普拉斯正则化,以确保相似患者的personADRank函数所训练的变量信息接近,这可以提升该模型对给定患者与相应ADR之间关联的因果关系(真阳性),因此本发明专利技术具有良好的实际应用之价值。

【技术实现步骤摘要】
一种个性化药物不良反应预测方法、系统、设备及介质
本专利技术属于生物医学
,具体涉及一种个性化药物不良反应预测方法、系统、设备及介质。
技术介绍
公开该
技术介绍
部分的信息仅仅旨在增加对本专利技术的总体背景的理解,而不必被视为承认或以任何形式暗示该信息构成已经成为本领域一般技术人员所公知的现有技术。世界卫生组织将药物不良反应(ADRs)描述为“对有毒和意外的药物反应,这种反应通常发生在人类正常使用的剂量范围内”。ADRs对公共卫生安全构成严重挑战。仅在美国,2004年就有超过21,000例ADRs报告,据估计,每年大概有6-7%的住院患者出现药物不良反应。此外,与药物相关的发病率和死亡率每年造成1,170亿美元的损失。在英国,国民健康服务(NHS)每年的由于药物不良反应造成的财务成本为4.66亿GB。ADRs每年可能导致大约10万人死亡,使其成为美国国内第四大死因。因此,有必要和迫切地研究ADRs,特别是研究那些未报告和罕见的药物不良反应。药物警戒(PhV)的主要目的是监测药物不良反应(ADRs)信号(即,识别潜在的药物和不本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种个性化药物不良反应预测方法,其特征在于,所述预测方法包括:/n获取受试者的临床数据;/n将临床数据导入已建立的KEMULA预测模型中,得到受试者的个性化药物不良反应结果;/n所述受试者的临床数据至少包括受试者服用小分子药物、生物技术药物和受试者医疗状况的信息;/n所述KEMULA预测模型包括一种个性化ADRs排序函数,其具体为计算患者发生相关ADRs风险的多项评分函数的线性组合。/n

【技术特征摘要】
1.一种个性化药物不良反应预测方法,其特征在于,所述预测方法包括:
获取受试者的临床数据;
将临床数据导入已建立的KEMULA预测模型中,得到受试者的个性化药物不良反应结果;
所述受试者的临床数据至少包括受试者服用小分子药物、生物技术药物和受试者医疗状况的信息;
所述KEMULA预测模型包括一种个性化ADRs排序函数,其具体为计算患者发生相关ADRs风险的多项评分函数的线性组合。


2.如权利要求1所述的个性化药物不良反应预测方法,其特征在于,所述评分函数至少包括小分子药物函数、生物技术药物函数和所患疾病特征函数;
优选的,所述函数为核函数。


3.如权利要求1所述的个性化药物不良反应预测方法,其特征在于,所述KEMULA模型从在不同验证集及其组合上获得的一组核函数池中进行选择;每个患者均由nF维特征向量表示,该向量由小分子药物特征,生物技术药物特征和所患疾病特征组成;
优选的,KEMULA预测模型构建过程中,定义用于组合一组满足凸优化性质的的核函数池。


4.如权利要求3所述的个性化药物不良反应预测方法,其特征在于,所述KEMULA预测模型是:



其中是优化参数的集合;Dtri是所有成对风险的集合,
优选的,对上述函数进行拉普拉斯正则化处理;
所述拉普拉斯正则化处理具体方法为:
采用拉格朗日优化模型Θ=[M,W]:



其中Reg(Θ)是一个正则化函数项,它控制模型的复杂度并引发涉及向量{md}和{wd}的任务相关性;
通过使用二次惩罚函数将等式(10)中的约束条件合并到正则项Reg(Θ)中,对其进行软正则化约束;因此,正则化函数变为



其中,μreg和μorth是权重向量上的惩罚参数,用于控制泛化误差与M和W的方差之间的权衡;隶属度受参数γ的限制,项是弗罗贝尼乌斯范数,用来控制M的复杂性;和通过BPR损失函数惩罚ωs|s∈{m,b,i}拟合的方差;通过定义矩阵和权重矩阵集合W,等式12等价地写为



其中,ΛM是具有γmuu.项的对角矩阵;是一个对角矩阵,其具有用于拉普拉斯学习任务的μreg,ΛW是包含的对角矩阵;是含有μorth空心矩阵用于拉普拉斯学习任务,是包含的空心矩阵。


5.一种个性化药物不良反应预测系统,其特征在于,所述预测系统包括:
临床数据获取模块:获取受试者临床数据;
预测模型构建模块:基于KEMULA预测模型对受试者进行预测,得到受试者的个性化药...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨帆薛付忠江冰薛浩
申请(专利权)人:山东大学
类型:发明
国别省市:山东;37

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