冠心病患者死亡风险相关的DNA甲基化组合物及其筛选方法和用途技术

本发明专利技术提供了一组评估冠心病生存预后风险的DNA甲基化标志物，所述的标志物包括以下基因所对应的甲基化位点：chr3:101901234、SEMA3B、CORO2B、SLC39A8、chr7:27235733、chr10:3086002、chr2:164594200、RNASEH1、chr10:134897731、ABCA3、ZNF444、UBE2E2、DAZAP1、NAT10、DDAH1和FKBP5。通过监测这16个位点甲基化水平的改变可预测冠心病患者的预后和死亡风险。本发明专利技术还基于这16个甲基化位点构建了评估冠心病生存预后风险的模型，通过该模型可以提高冠心病患者血液诊断和预后预测的准确性。本发明专利技术使用了Lasso Cox回归模型对重要变量进行筛选，使模型维度大幅降低，有助于降低检测成本并有利于在临床应用中的推广。

【技术实现步骤摘要】
冠心病患者死亡风险相关的DNA甲基化组合物及其筛选方法和用途
本专利技术属于表观遗传学
，涉及冠心病患者死亡风险相关的DNA甲基化组合物及其筛选方法和用途。
技术介绍
冠心病，又称冠状动脉粥样硬化(AS)性心脏病，是一种冠状动脉血管发生动脉粥样硬化病变而引起血管腔狭窄或阻塞，造成心肌缺血、缺氧或坏死而导致的心脏病。冠心病是目前世界范围内高发病率及致死率的疾病之一，其发病率呈逐渐升高趋势。柳叶刀公开数据显示，缺血性心脏病是过去十年间中国人群的第二大死因，其病理过程具有进展性、不可逆性等特征，其在发病率、入院率和医药治疗方面给社会带来负担。目前，冠心病死亡风险预测手段仍十分欠缺。因此，发现冠心病死亡风险相关的生物学标志物，进而对冠心病进展的病理生理学深入研究，具有重要意义。冠心病的发生发展是环境因素与遗传因素相互作用的复杂过程，而异常的表观遗传学修饰是连接环境与遗传因素的桥梁。研究发现，多种分子和细胞生物学机制在冠心病的发生和发展过程中均有参与。其中，表观遗传修饰机制在心血管疾病的基因表达方面起到了重要的作用。DNA甲基化是表本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一组评估冠心病生存预后风险的DNA甲基化标志物，其特征在于：所述标志物包括以下基因所对应的甲基化位点：chr3:101901234、SEMA3B、CORO2B、SLC39A8、chr7:27235733、chr10:3086002、chr2:164594200、RNASEH1、chr10:134897731、ABCA3、ZNF444、UBE2E2、DAZAP1、NAT10、DDAH1和FKBP5。/n

【技术特征摘要】
1.一组评估冠心病生存预后风险的DNA甲基化标志物，其特征在于：所述标志物包括以下基因所对应的甲基化位点：chr3:101901234、SEMA3B、CORO2B、SLC39A8、chr7:27235733、chr10:3086002、chr2:164594200、RNASEH1、chr10:134897731、ABCA3、ZNF444、UBE2E2、DAZAP1、NAT10、DDAH1和FKBP5。


2.如权利要求1所述的DNA甲基化标志物，其特征在于：所述chr3:101901234所对应的甲基化位点为cg12992827；所述基因SEMA3B所对应的甲基化位点为cg12999941；所述基因CORO2B所对应的甲基化位点为cg03714754；所述基因SLC39A8所对应的甲基化位点为cg24524837；所述chr7:27235733所对应的甲基化位点为cg10643049；所述chr10:3086002所对应的甲基化位点为cg04833391；所述chr2:164594200所对应的甲基化位点为cg08280341；所述基因RNASEH1所对应的甲基化位点为cg12263535；所述chr10:134897731所对应的甲基化位点为cg06355908；所述基因ABCA3所对应的甲基化位点为cg21484914；所述基因ZNF444所对应的甲基化位点为cg09782621；所述基因UBE2E2所对应的甲基化位点为cg20015729；所述基因DAZAP1所对应的甲基化位点为cg00013733；所述基因NAT10所对应的甲基化位点为cg19045191；所述基因DDAH1所对应的甲基化位点为cg22211198；所述基因FKBP5所对应的甲基化位点为cg03546163。


3.如权利要求1所述的基因DNA甲基化标志物在制备用于评估冠心病生存预后风险的试剂盒中的应用，其中所述甲基化标志物包括以下基因所对应的甲基化位点：chr3:101901234、SEMA3B、CORO2B、SLC39A8、chr7:27235733、chr10:3086002、chr2:164594200、RNASEH1、chr10:134897731、ABCA3、ZNF444、UBE2E2、DAZAP1、NAT10、DDAH1和FKBP5。


4.如权利要求3所述的用途，其特征在于：所述试剂盒包括检测chr3:101901234、SEMA3B、CORO2B、SLC39A8、chr7:27235733、chr10:3086002、chr2:164594200、RNASEH1、chr10:134897731、ABCA3、ZNF444、UBE2E2、DAZAP1、NAT10、DDAH1和FKBP5基因甲基化水平的试剂。


5.一种评估冠心病生存预后风险的模型，其特征在于：所述模型为以下计算公式：
MRS＝∑(甲基化水平×LASSO相关系数)(公式3)
其中MRS为甲基化风险评分，根据所述模型获得甲基化风险评分的中位数，根据所述中位数评估冠心病患者生存预后风险；公式3中所述甲基化水平为以下基因所在位点的甲基化水平：chr3:101901234、SEMA3B、CORO2B、SLC39A8、chr7:27235733、chr10:3086002、chr2:164594200、RNASEH1、chr10:134897731、ABCA3、ZNF444、UBE2E2、DAZAP1、NAT10、DDAH1和FKBP5。


6.如权利要求5所述模型，其特征在于：所述chr3:101901234所对应的甲基化位点为cg12992827；所述基因SEMA3B所对应的甲基化位点为cg12999941；所述基因CORO2B所对应的甲基化位点为cg03714754；所述基因SLC39A8所对应的甲基化位点为cg24524837；所述chr7:27235733所对应的甲基化位点为cg10643049；所述chr10:3086002所对应的甲基化位点为cg04833391；所述chr2:164594200所对应的甲基化位点为cg08280341；所述基因RNASEH1所对应的甲基化位点为cg12263535；所述chr10:134897731所对应的甲基化位点为cg06355908；所述基因ABCA3所对应的甲基化位点为cg21484914；所述基因ZNF444所对应的甲基化位点为...

【专利技术属性】
技术研发人员：钟诗龙，陈慧，秦敏，
申请(专利权)人：广东省人民医院，
类型：发明
国别省市：广东;44