【技术实现步骤摘要】
一种单细胞DNA表观遗传修饰空间定位与邻近分布的可视化区分方法
本专利技术属于分析化学领域，涉及一种单细胞DNA表观遗传修饰空间定位与邻近分布的可视化区分方法。
技术介绍
哺乳动物基因组中存在着不同的DNA表观遗传标记。这些表观遗传标记对基因表达和染色质结构都有着深远的影响，并与很多疾病(如癌症等)的病理有关。在基因的表观遗传标记中，研究较多的是5-甲基胞嘧啶(5-mC)及其氧化衍生物5-hmC和5-fC，经过研究发现，它们不仅是5-mC去甲基化通路的中间产物，而且也具有很好的稳定性。这两种DNA表观遗传标记都是由双加氧酶的10-11易位家族产生的。表观遗传标记在单细胞中的空间定位也是理解其功能的基础，不同的表观遗传标记如果在空间上呈临近分布状态，则它们可能会有相互干扰作用或者它们所表达的蛋白质之间会有相互作用。针对这些修饰碱基，当前已经有几种用于全基因组分析的深度测序策略，可以揭示它们在正常生物过程和疾病发生过程中的重要功能。但是这些深度测序的方法都是针对细胞群体平均进行分析，并且不能实现修饰碱基在亚细胞分...
【技术保护点】
1.一种单细胞DNA表观遗传修饰空间定位与邻近分布的可视化区分方法，其特征在于，包括以下步骤：/n1)利用特异性标记方法，标记单细胞内DNA表观遗传修饰位点；/n2)通过点击化学将标记为点共价连接上对应的引物，成对的临近修饰位点的引物能够对有缺口的环模板实现原位临近连接，得到完整环模板Pad1；/n3)对于剩余不成对的修饰位点，引物通过链置换反应被释放，接着利用特异性环模板Pad2和Pad3分别对修饰位点进行杂交，实现修饰位点的空间定位与邻近分布特征编码；/n4)编码完成后，通过核酸扩增、荧光探针杂交，实现单细胞DNA表观遗传修饰空间定位与邻近分布的单分子可视化区分。/n
【技术特征摘要】
1.一种单细胞DNA表观遗传修饰空间定位与邻近分布的可视化区分方法，其特征在于，包括以下步骤：
1)利用特异性标记方法，标记单细胞内DNA表观遗传修饰位点；
2)通过点击化学将标记为点共价连接上对应的引物，成对的临近修饰位点的引物能够对有缺口的环模板实现原位临近连接，得到完整环模板Pad1；
3)对于剩余不成对的修饰位点，引物通过链置换反应被释放，接着利用特异性环模板Pad2和Pad3分别对修饰位点进行杂交，实现修饰位点的空间定位与邻近分布特征编码；
4)编码完成后，通过核酸扩增、荧光探针杂交，实现单细胞DNA表观遗传修饰空间定位与邻近分布的单分子可视化区分。
2.根据权利要求1所述的一种单细胞DNA表观遗传修饰空间定位与邻近分布的可视化区分方法，其特征在...
【专利技术属性】
技术研发人员：赵永席，陈锋，薛静，张进，
申请(专利权)人：西安交通大学，
类型：发明
国别省市：陕西;61
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