用于检测食道癌的组合物及其用途制造技术

本发明专利技术提供了一种用于检测食管癌的组合物及其用途，所述组合物包括：用于检测目标基因甲基化状态的核酸，其中，所述目标基因为MT1A基因、EPO基因和Septin9基因中的一种或两种以上。本发明专利技术还提供了包括所述组合物的试剂盒。以及所述组合物在制备用于体外检测食管癌的试剂盒中的用途。

【技术实现步骤摘要】
用于检测食道癌的组合物及其用途
本专利技术属于生物
，涉及一种组合物及其在疾病检测中的用途，具体地涉及一种用于检测食管癌的组合物及其相应的试剂盒和用途。
技术介绍
食管癌是一种常见的消化道肿瘤，全世界每年约有30万人死于食管癌。中国是世界上食管癌高发地区之一，全球死于食管癌的患者中的一半来自中国。全国肿瘤防治办公室数据显示：2015年，我国食管癌发病率为478例/10万人，死亡率为375例/万人，分别位居我国常见癌症中的第四位和第三位。食管癌的病死率接近80％，是一种恶性程度很高的癌症。导致食管癌高死亡率的重要因素是早期食管癌的确诊率低。早期食管癌的治愈率远高于中晚期，但是由于早期食管癌缺乏明显和特异的症状，绝大部分患者确诊时已经发展进入中晚期。临床研究发现，癌症从病灶开始形成到患者出现临床症状的过程平均需要数年时间；这为发现早期食管癌、提高早期食管癌的确诊率提供了一个有效的窗口期。充分利用这个窗口期，有望提高食管癌治疗效果、降低食道癌死亡率。目前临床上应用于食管癌诊断的技术在早期食道癌的检测和筛查方面的应用有限，主要因为：1)组织活检侵入性强，不适于早癌筛查；2)影像学检测技术(如：食管造影检查和内镜检查)在设备成本、操作技术、和侵入性等方面上的限制，也难以作为癌症筛查技术而大范围推广；3)传统血清肿瘤标识物(如：AFP、CEA、CA125、和CA199等)对食管癌检测的灵敏度较低，无法充分满足早癌筛查的要求。近年的研究显示表观遗传学在癌症的发生、发展中起着重要作用。作为表观遗传学的一种重要机制，多种癌症的DNA甲基化调控得到了深入研究。研究数据显示：基因甲基化的调控与染色质结构和基因表达调控等生物学机制相关；细胞基因甲基化的变化发生在肿瘤形成的早期，并贯穿癌症的发生和发展过程；抑癌基因的甲基化是癌前病变组织转化为恶性肿瘤细胞的重要分子机制。但是目前缺乏针对食管癌甲基化基因检测的检测技术、方法和产品。因此，当前对用于食管癌检测的敏感性高和特异性高的甲基化基因标记物存在需求。
技术实现思路
基于此，针对现有食管癌检测技术存在的检测不便、灵敏度低、和成本高的问题，本专利技术提供了一种用于检测食道癌的组合物，本专利技术提供的组合物能够灵敏和特异地检测食管癌，本专利技术还提供了包含所述组合物的试剂盒以及其在检测食管癌中的用途。本专利技术提供的试剂盒具有良好的食管癌检测灵敏性和特异性，能够方便、快捷、有效地检测食管癌。本专利技术提供了一种用于体外检测食管癌的组合物、试剂盒及其用途，以及基于该试剂盒来执行检测的方法，以及用于检测食管癌。具体来说，本专利技术涉及以下内容：1.一种用于体外检测食管癌的组合物，所述组合物包括：用于检测目标基因甲基化状态的核酸，其中，所述目标基因甲基化状态由所述目标基因靶序列的甲基化来表征，其中，所述目标基因为MT1A基因、EPO基因和Septin9基因中的一种或两种以上。2.根据项1所述的组合物，其中，所述MT1A基因的靶序列如SEQIDNO:1所示。3.根据项1所述的组合物，其中，所述EPO基因的靶序列如SEQIDNO:3所示。4.根据项1所述的组合物，其中，所述Septin9基因的靶序列如SEQIDNO:5所示。5.根据项1～4中任一项所述的组合物，其中，所述用于检测目标基因甲基化状态的核酸包括：引物，所述引物为所述目标基因的靶序列中的至少9个核苷酸的片段，所述片段包含至少一个CpG二核苷酸序列。6.根据项1～5中任一项所述的组合物，其中，所述用于检测目标基因甲基化状态的核酸包括：探针，所述探针为在中等严紧或严紧条件下杂交于所述目标基因靶序列中的至少15个核苷酸的片段，所述片段包含至少一个CpG二核苷酸序列。7.根据项1～6中任一项所述的组合物，其还包括：将目标基因靶序列的5位未甲基化胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶的试剂。8.根据项1～7中任一项所述的组合物，其中，所述用于检测目标基因甲基化状态的核酸还包括：优先与处于非甲基化状态的靶序列结合的阻断剂。9.根据项8所述的组合物，其中，所述至少9个核苷酸的片段，其为SEQIDNO:7和SEQIDNO:8的序列，或者其为SEQIDNO:11和SEQIDNO:12的序列，或者其为SEQIDNO:15和SEQIDNO:16的序列，所述至少15个核苷酸的片段，其为SEQIDNO:9的序列，或SEQIDNO:13的序列，或SEQIDNO:17的序列，阻断剂，其为SEQIDNO:10的序列，或SEQIDNO:14的序列，或SEQIDNO:18的序列。10.一种用于体外检测食管癌的寡核苷酸，其包括：所述SEQIDNO:1或其互补序列中的至少9个核苷酸且包含至少一个CpG二核苷酸序列的片段；和/或所述SEQIDNO:3或其互补序列中的至少9个核苷酸且包含至少一个CpG二核苷酸序列的片段；和/或所述SEQIDNO:5或其互补序列中的至少9个核苷酸且包含至少一个CpG二核苷酸序列的片段。11.根据项10所述的寡核苷酸，其还包括：在中等严紧或严紧条件下杂交于所述SEQIDNO:1或其互补序列中的至少15个核苷酸且包含至少一个CpG二核苷酸序列的片段；和/或在中等严紧或严紧条件下杂交于所述SEQIDNO:3或其互补序列中的至少15个核苷酸且包含至少一个CpG二核苷酸序列的片段；和/或在中等严紧或严紧条件下杂交于所述SEQIDNO:5或其互补序列中的至少15个核苷酸且包含至少一个CpG二核苷酸序列的片段。12.根据项11所述的寡核苷酸，其还包括：优先与处于非甲基化状态的靶序列结合的阻断剂。13.一种用于体外检测食管癌的寡核苷酸，其包括：SEQIDNO:7和SEQIDNO:8的序列。14.根据项13所述的寡核苷酸，其还包括：SEQIDNO:9的序列。15.根据项14所述的寡核苷酸，其还包括：SEQIDNO:10的序列。16.一种用于体外检测食管癌的寡核苷酸，其包括：SEQIDNO:11和SEQIDNO:12的序列。17.根据项16所述的寡核苷酸，其还包括：SEQIDNO:13的序列。18.根据项17所述的寡核苷酸，其还包括：SEQIDNO:14的序列。19.一种用于体外检测食管癌的寡核苷酸，其包括：SEQIDNO:15和SEQIDNO:16的序列。20.根据项19所述的寡核苷酸，其还包括：SEQIDNO:17的序列。21.根据项20所述的寡核苷酸，其还包括：SEQIDNO:18的序列。22.MT1A基因在制备用于体外检测食管癌的试剂盒中的用途。23.EPO基因在制备用于体外检测食管癌的试剂盒中的用途。24.Septin9基因在制备用于体外检测食管癌的试剂盒中的用途。25.一种试本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于体外检测食管癌的组合物，所述组合物包括：/n用于检测目标基因甲基化状态的核酸，/n其中，所述目标基因甲基化状态由所述目标基因靶序列的甲基化来表征，/n其中，所述目标基因为MT1A基因、EPO基因和Septin9基因中的一种或两种以上。/n

【技术特征摘要】
20190423 CN 20191032994121.一种用于体外检测食管癌的组合物，所述组合物包括：
用于检测目标基因甲基化状态的核酸，
其中，所述目标基因甲基化状态由所述目标基因靶序列的甲基化来表征，
其中，所述目标基因为MT1A基因、EPO基因和Septin9基因中的一种或两种以上。


2.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述MT1A基因的靶序列如SEQIDNO:1所示。


3.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述EPO基因的靶序列如SEQIDNO:3所示。


4.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述Septin9基因的靶序列如SEQIDNO:5所示。


5.根据权利要求1～4中任一项所述的组合物，其中，所述用于检测目标基因甲基化状态的核酸包括：
引物，所述引物为所述目标基因的靶序列中的至少9个核苷酸的片段，
所述片段包含至少一个CpG二核苷酸序列。


6.根据权利要求1～5中任一项所述的组合物，其中，所述用于检测目标基因甲基化状态的核酸包括：
探针...

【专利技术属性】
技术研发人员：周光朋，吴振，韩晓亮，王建铭，
申请(专利权)人：博尔诚北京科技有限公司，
类型：发明
国别省市：北京;11