一组辅助诊断食管鳞癌的miRNA标志物及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一组辅助诊断食管鳞癌的miRNA标志物及其应用，所述miRNA标志物包括hsa‑miR‑493，并且还包括hsa‑miR‑93、hsa‑miR‑503、hsa‑miR‑375或hsa‑miR‑195中任意一种或两种以上的组合。通过本发明专利技术的辅助诊断食管鳞癌的miRNA标志物构建的食管鳞癌辅助诊断模型特异性好、准确率高，可为早期筛查食管鳞癌提供实验依据。

【技术实现步骤摘要】
一组辅助诊断食管鳞癌的miRNA标志物及其应用
本专利技术属于肿瘤
，涉及一组辅助诊断食管鳞癌的miRNA标志物及其应用。
技术介绍
食管癌是常见的消化道恶性肿瘤。全世界每年约有30万人死于食管癌。每年平均病死约15万人。男多于女，发病年龄多在40岁以上。食管癌典型的症状为进行性咽下困难。食管癌有两种主要的病理亚型，其中食管鳞状细胞癌(以下称食管鳞癌)约占90％。microRNAs(miRNAs)是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA，其大小长约20～25个核苷酸。成熟的miRNAs是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的，随后组装进RNA诱导的沉默复合体，通过碱基互补配对的方式识别靶mRNA，并根据互补程度的不同指导沉默复合体降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻译。最近的研究表明miRNA参与各种各样的调节途径，包括发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细胞增殖和凋亡、脂肪代谢等等。许多研究表明，miRNA可作为肿瘤标志物进行早期筛查。CN103173449A公开了与食管癌术后早期复发和预后相关的miRNA标志物及其应用，筛选得到的has-miR-382可辅助判断食管癌患者的预后或死亡风险，推动了食管癌诊治方面的发展。CN103160509A公开了与食管癌术后早期复发和预后相关的miRNA标志物及其应用，筛选得到的has-miR-212可辅助判断食管癌患者的预后或死亡风险，推动了食管癌诊治方面的发展。CN103173450A公开了与食管癌术后早期复发和预后相关的miRNA标志物及其应用，筛选得到的has-miR-198可辅助判断食管癌患者的预后或死亡风险，推动了食管癌诊治方面的发展。CN103114092A公开了与食管癌术后早期复发和预后相关的miRNA标志物及其应用，筛选得到的has-miR-197可辅助判断食管癌患者的预后或死亡风险，推动了食管癌诊治方面的发展。目前临床上通常所用的食管癌检测方法有纤维内窥镜检查、食管脱落细胞检查、X射线钡餐。纤维内窥镜检查虽然能够达到85％的检测准确率，但是由于内窥镜检过程可造成患者明显不适或需麻醉，病人的依从性差，且对医师的技术操作要求高，难以作为常规方法大范围推广应用。脱落细胞检查阳性率虽也能达到80％以上，但涂片操作的误差较大。而X射线钡餐显影则因敏感度差，且对身体有辐射伤害等缺陷，并不适用于食管癌的早期普查。因此，为食管癌早期筛查提供一种新的、高效、准确、灵敏、特异的分子标志物具有十分重要的意义。
技术实现思路
针对现有技术的不足及实际的需求，本专利技术提供一组辅助诊断食管鳞癌的miRNA标志物及其应用，通过对miRNA标志物的表达量进行检测可以辅助诊断食管鳞癌的发病与发展过程，为其早期筛查、治疗与预后判断提供实验依据。为达此目的，本专利技术采用以下技术方案：第一方面，本专利技术提供一组辅助诊断食管鳞癌的miRNA标志物，所述miRNA标志物包括hsa-miR-493，并且还包括hsa-miR-93、hsa-miR-503、hsa-miR-375或hsa-miR-195中任意一种或两种以上的组合。例如，可以是hsa-miR-493和hsa-miR-93的组合，hsa-miR-493和hsa-miR-503的组合，hsa-miR-493和hsa-miR-375的组合，hsa-miR-493、hsa-miR-93和hsa-miR-503的组合，hsa-miR-493、hsa-miR-93、hsa-miR-503和hsa-miR-375的组合，hsa-miR-493、hsa-miR-93、hsa-miR-503和hsa-miR-195的组合，或hsa-miR-493、hsa-miR-93、hsa-miR-503、hsa-miR-375和hsa-miR-195的组合。本专利技术中，首次发现hsa-miR-493与食管鳞癌相关，并通过该miRNA与hsa-miR-93、hsa-miR-503、hsa-miR-375或hsa-miR-195中的至少一种的组合实现对食管鳞癌的辅助诊断。优选地，所述miRNA标志物包括hsa-miR-493、hsa-miR-93、hsa-miR-503、hsa-miR-375和hsa-miR-195的组合。本专利技术中，通过对五种miRNA的表达量进行检测，可以辅助诊断食管鳞癌，且准确度、灵敏性和特异性均显著，具有重要的临床意义。优选地，所述hsa-miR-493、hsa-miR-93、hsa-miR-503、hsa-miR-375和hsa-miR-195的核苷酸序列分别如SEQIDNO.1、SEQIDNO.2、SEQIDNO.3、SEQIDNO.4和SEQIDNO.5所示。hsa-miR-493的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示：5’-UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU-3’.hsa-miR-93的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示：5’-CAAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG-3’.hsa-miR-503的核苷酸序列如SEQIDNO.3所示：5’-UAGCAGCGGGAACAGUUCUGCAG-3’.hsa-miR-375的核苷酸序列如SEQIDNO.4所示：5’-UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA-3’.hsa-miR-195的核苷酸序列如SEQIDNO.5所示：5’-UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC-3’.第二方面，本专利技术提供一种如第一方面所述的miRNA标志物在构建食管鳞癌辅助诊断模型、食管鳞癌检测试剂盒、食管鳞癌检测芯片、制备诊断食管鳞癌的试剂或制备治疗食管鳞癌的药物中的应用。第三方面，本专利技术提供一种食管鳞癌辅助诊断模型，所述模型的输入对象为第一方面所述miRNA标志物的表达量。本专利技术中通过检测如第一方面所述miRNA标志物的表达量，结合模型运算即可得到食管鳞癌的患病风险预测值，该数值可辅助诊断食管鳞癌的发病和发展过程，为早期筛查食管鳞癌和疾病转归提供实验依据，以早发现早治疗，提高对预后的有效干预。优选地，所述模型的表达公式为LogitP＝(0.102*hsa-miR-93的表达值)+(0.742*hsa-miR-503的表达值)-(0.278*hsa-miR-375的表达值)-(0.384*hsa-miR-195的表达值)+(0.3*hsa-miR-493的表达值)。本专利技术中，所述miRNA标志物的表达值可通过多种相对定量检测手段进行检测，典型非限定的如：实时荧光定量PCR或基因组测序等。第四方面，本专利技术提供一种构建如第三方面所述食管鳞癌辅助诊断模型的方法，包括以下步骤：(1)选择在食管鳞癌组织和正常组织中差异表达的miRNA；(2)将步骤(1)所得miRNA集合切分为训练集和测试集；(3)通过机器学习算法构建食管鳞癌辅助诊断模型；(4)本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一组辅助诊断食管鳞癌的miRNA标志物，其特征在于，所述miRNA标志物包括hsa-miR-493，并且还包括hsa-miR-93、hsa-miR-503、hsa-miR-375或hsa-miR-195中任意一种或两种以上的组合。/n

【技术特征摘要】
1.一组辅助诊断食管鳞癌的miRNA标志物，其特征在于，所述miRNA标志物包括hsa-miR-493，并且还包括hsa-miR-93、hsa-miR-503、hsa-miR-375或hsa-miR-195中任意一种或两种以上的组合。


2.根据权利要求1所述的miRNA标志物，其特征在于，所述miRNA标志物包括hsa-miR-493、hsa-miR-93、hsa-miR-503、hsa-miR-375和hsa-miR-195的组合；
优选地，所述hsa-miR-493、hsa-miR-93、hsa-miR-503、hsa-miR-375和hsa-miR-195的核苷酸序列分别如SEQIDNO.1、SEQIDNO.2、SEQIDNO.3、SEQIDNO.4和SEQIDNO.5所示。


3.一种如权利要求1或2所述的miRNA标志物在构建食管鳞癌辅助诊断模型、食管鳞癌检测试剂盒、食管鳞癌检测芯片、制备诊断食管鳞癌的试剂或制备治疗食管鳞癌的药物中的应用。


4.一种食管鳞癌辅助诊断模型，其特征在于，所述模型的输入对象为权利要求2所述miRNA标志物的表达量；
优选地，所述模型的表达公式为LogitP＝(0.102*hsa-miR-93的表达值)+(0.742*hsa-miR-503的表达值)-(0.278*hsa-miR-375的表达值)-(0.384*hsa-miR-195的表达值)+(0.3*hsa-miR-493的表达值)。


5.一种构建如...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘乃嘉，盛司潼，王筠，胡章立，钟姗，
申请(专利权)人：深圳大学，深圳华因康基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：广东;44