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基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组及其应用制造技术

技术编号:25472226 阅读:60 留言:0更新日期:2020-09-01 22:51
本发明专利技术涉及分子标记技术领域,特别涉及基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组及其应用,本发明专利技术的引物是针对白骨壤转录组hAT转座子设计的,hAT转座子碱基对虽然较短,但在数量丰富,能够覆盖整个基因组,设计出来的引物对具有良好的多态性,能对白骨壤品种进行区分,本申请印证了利用白骨壤开发hAT转座子标记的可行性,并对不同地域品种的白骨壤进行遗传多样性分析,不仅能为白骨壤提供新颖优质的分子标记,也为白骨壤的分子改良奠定良好基础可为今后开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新引物。

【技术实现步骤摘要】
基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组及其应用
本专利技术涉及分子标记
,特别涉及基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组及其应用。
技术介绍
红树植物中数量最多的植物就是白骨壤(Avicenniamarina),它在适应陆地与海洋过渡区域方面有优良表现,一般分布在热带及亚热带地区河口或海岸潮间。其生长环境具有不适合大多数生物生长的特点:周期性潮汐、具有高温度、高盐、低氧及强风的湿地,白骨壤就是滨海湿地的天然保护屏障,可以保护沿海人类的生命安全和使财产免受洪水、风暴及海岸的侵蚀,同时给动物提供了栖息地和食物,对维持生态系统完整性和生物多样性起到重要作用。转座元件(TransposableElement,TE),也称为转座子,它的是一种特殊的DNA序列。在相同染色体中转座子可以从某一个位点移动到另一个位点,从某条染色体移动到另外一条染色体上。随着转录组测序技术的发展,已经有越来越多的物种转录组被用到检测基因组序列技术中,但是关于白骨壤的hAT转座子遗传标记研究还鲜有报道。为了促进白骨壤遗传资源的研发,验证h本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组,其特征在于,所述分子标记引物组为下述引物中的任意1对:/nAmhAT3上游引物:5’-TAGCCGAGTGGTGGTCTTCT-3’;下游引物:5’-TGATGAGGTGCATCTAACTTGG-3’;/nAmhAT7上游引物:5’-AAACCAGTTGGAACAATCACG-3’;下游引物:5’-TCTTCTGCCACATCATCATCA-3’;/nAmhAT8上游引物:5’-TCTCTGGAGTGCATGGTGTT-3’;下游引物:5’-TGGTCACTTCCCATGACTTG-3’;/nAmhAT12上游引物:5’-TGCAAAGTGCA...

【技术特征摘要】
1.基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组,其特征在于,所述分子标记引物组为下述引物中的任意1对:
AmhAT3上游引物:5’-TAGCCGAGTGGTGGTCTTCT-3’;下游引物:5’-TGATGAGGTGCATCTAACTTGG-3’;
AmhAT7上游引物:5’-AAACCAGTTGGAACAATCACG-3’;下游引物:5’-TCTTCTGCCACATCATCATCA-3’;
AmhAT8上游引物:5’-TCTCTGGAGTGCATGGTGTT-3’;下游引物:5’-TGGTCACTTCCCATGACTTG-3’;
AmhAT12上游引物:5’-TGCAAAGTGCATTTGTGTACG-3’;下游引物:5’-AGATGGCGCTTGTCAAGACT-3’;
AmhAT14上游引物:5’-GCCACGCTGTTTGTATGTTC-3’;下游引物:5’-AAAGCCACATCTTGCTCCTC-3’;
AmhAT33上游引物:5’-TTGGTTCGAAAATACATGAACG-3’;下游引物:5’-AAACTCGGGCTCATTTTCCT-3’;
AmhAT59上游引物:5’-GTTGGCACCATCCAACTTTT-3’;下游引物:5’-CCCAAACTACGACCTGCACT-3’;
AmhAT60上游引物:5’-TGATTTTGCATGATCGAGACA-3’;下游引物:5’-CCCCAGCACAAATCACTTTT-3’。


2.根据权利要求1所述基于白骨壤转录组hAT转座子的分子标记引物组,其特征在于,所述引物组能对不同地域...

【专利技术属性】
技术研发人员:王鹏良杨利平陶玉华吴双成李艺邓洁梅
申请(专利权)人:北部湾大学
类型:发明
国别省市:广西;45

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