本发明专利技术涉及生物标志物在癌症诊断中的应用，本发明专利技术公开了CTD‑2540F13.2作为生物标志物的用途，尤其涉及一种制备诊断胃腺癌的产品的用途，其通过在体外测量样本中CTD‑2540F13.2来进行。本发明专利技术还公开了CTD‑2540F13.2作为生物标志物的另一种用途，尤其涉及一种制备治疗胃腺癌的药物组合物的用途。
【技术实现步骤摘要】
生物标志物在癌症诊断中的应用
本专利技术属于生物医药领域，涉及生物标志物在癌症诊断中的应用，具体的涉及CTD-2540F13.2在胃癌诊断中的应用。
技术介绍
胃癌是常见恶性肿瘤之一，在全球范围内，胃癌发病率和死亡率分别位居第四位和第二位(TomeLA,BrayF,SiegelRL,FerlayJ,Lortet-TieulentJandJemalA.Globalcancerstatistics,2012.CACancerJClin2015；65:87-108)。在我国，胃癌发病率占恶性肿瘤的第二位，死亡率占恶性肿瘤的14.33％，位居第三位。胃癌早期症状不典型，许多病人一经发现即为晚期，失去手术机会，并且将近一半的病人术后出现复发，缺乏有效的治疗手段(PasechnikovV,ChukovS,FedorovE,KikusteIandLejaM.Gastriccancer:prevention,screeningandearlydiagnosis.WorldJGastroenterol2014；20:13842-13862.)。尽管采用多学科综合治疗手段和靶向药物等新药研究取得了一定的进展，但胃癌的早期发现、早期诊断率及手术根治率较低，导致胃癌5年存活率仍很低(OrdituraM,GaliziaG,SforzaVeta1.Treatmentofgastriccancer.WorldJGastroenterol2014；20:1635-1649.)。因此，胃癌的诊治仍面临着很大的挑战，进一步理解胃癌的发生发展的分子机制，寻找新的生物标志物和治疗靶点迫在眉睫。随着基因测序技术如高通量测序或全基因组高密度芯片的发展，研究者发现，蛋白质编码基因只占人类基因组的不到2％，其余98％为不具有蛋白编码功能的RNA，被称为非编码RNA(noncodingRNA,ncRNA)，最初这些ncRNA被认为是转录“噪声”、“垃圾”，但最近的研究表明，这些“垃圾”可能在细胞的发育、代谢及肿瘤等多种疾病的发生、发展方面发挥着重要的生物学作用(WangJ,SunJ,WangJ,SongY,GaoP,ShiJ,ChenP,WangZ.LongnoncodingRNAsingastriccancer:functionsandclinicalapplications.OncoTargetsTher2016；9:681-697.)。长链非编码RNA(longnon-codingRNA，LncRNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA，与miRNAs相比，LncRNA是mRNA类转录体，长度在200nt-100kb之间，缺乏明显的开放性阅读框架，外显子少，表达水平比蛋白质编码基因低，但是，78％的LncRNA呈现出组织特异性表达方式，一些LncRNA只在特定的组织中优先表达，这是LncRNA的一个重要特征。根据LncRNA在基因组中的位置及特征，可以将其分为5个亚类：正义LncRNA(senseLncRNA)、反义LncRNA(antisenseLncRNA)、双向LncRNA(bidirectionalLncRNA)、内含子LncRNA(intronicLncRNA)、基因间LncRNA(intergenicLncRNA)。LncRNA在胃癌中的研究较少，研究与胃腺癌发生发展相关的lncRNA，对于进一步解释胃腺癌的发病机理，实现胃腺癌的更精细的基因分型、以及达成胃腺癌患者的个性化精准治疗具有重要的意义。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术提供了一种与胃癌相关的基因，为胃癌的早期诊断提供了一种产品和手段，相比传统的胃癌的诊断方法，使用标志物来诊断胃腺癌具有及时性、灵敏性，从而使患者在疾病早期就能知晓疾病风险，从而采取相应的预防和治疗措施。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术提供了一种CTD-2540F13.2的用途，用于制备诊断胃腺癌的产品。进一步，所述产品通过测定样本中CTD-2540F13.2的表达水平与参考水平相比上调而确定。进一步，所述产品通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术的方法检测CTD-2540F13.2基因的表达水平。进一步，所述核酸扩增技术选自聚合酶链式反应(PCR)、逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)、转录介导的扩增(TMA)、连接酶链式反应(LCR)、链置换扩增(SDA)和基于核酸序列的扩增(NASBA)。本专利技术提供了一种体外检测样本中CTD-2540F13.2表达水平的产品，所述产品包括制剂、芯片或试剂盒。其中，所述芯片包括固相载体；以及固定在固相载体上的寡核苷酸探针。所述试剂盒包括基因芯片或聚合酶链式反应体系。进一步，所述体外检测样本中CTD-2540F13.2表达水平的产品包括：特异性识别CTD-2540F13.2的探针；或特异性扩增CTD-2540F13.2的引物。进一步，所述特异性扩增CTD-2540F13.2的引物序列如SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示。本专利技术提供了体外检测样本中CTD-2540F13.2表达水平的产品在制备诊断胃腺癌工具中的用途。本专利技术提供了一种诊断胃腺癌的试剂盒，包括：检测CTD-2540F13.2的一种或多种试剂；和选自下组的一种或多种物质：容器、使用说明书、阳性对照物、阴性对照物、缓冲剂、助剂或溶剂。进一步，所述试剂盒用于通过下组的方法检测CTD-2540F13.2的表达水平：qRT-PCR、生物芯片检测法、DNA印迹法、或RNA印迹法原位杂交法。本专利技术提供了CTD-2540F13.2在构建预测胃癌的计算模型中的用途。本专利技术提供了CTD-2540F13.2在制备治疗胃腺癌的药物组合物中的应用。进一步，所述药物组合物包括CTD-2540F13.2的抑制剂。进一步，所述抑制剂降低CTD-2540F13.2的表达水平。优选的，所述抑制剂选自核酸抑制物，所述核酸抑制物以CTD-2540F13.2或其转录本为靶序列、且能够抑制CTD-2540F13.2基因表达或基因转录的干扰分子，包括：shRNA(小发夹RNA)、小干扰RNA(siRNA)、dsRNA、微小RNA、反义核酸，或能表达或形成所述shRNA、小干扰RNA、dsRNA、微小RNA、反义核酸的构建物。进一步，所述抑制剂为干扰RNA或其构建物。进一步，所述干扰RNA的序列如SEQIDNO.5和SEQIDNO.6所示。本专利技术提供了一种治疗药物组合物，所述药物组合物包括CTD-2540F13.2的抑制剂。进一步，所述抑制剂降低CTD-2540F13.2的表达水平。优选的，所述抑制剂选自核酸抑制物，所述核酸抑制物以CTD-2540F13.2或其转录本为靶序列、且能够抑制CTD-2540F13.2基因表达或基因转录的干扰分子，包括：shRNA(小发夹RNA)、小干扰RNA(siRNA)、dsRNA、微小RNA、反义核酸，或能表达或形成所述shRN本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.CTD-2540F13.2的用途，其特征在于，用于制备诊断胃癌的产品。/n
【技术特征摘要】
20190606 CN 20191049007741.CTD-2540F13.2的用途，其特征在于，用于制备诊断胃癌的产品。
2.根据权利要求1所述的用途，其特征在于，所述产品通过测定样本中CTD-2540F13.2的表达水平与参考水平相比上调而确定。
3.根据权利要求2所述的用途，其特征在于，所述产品通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术的方法检测CTD-2540F13.2基因的表达水平。
4.一种体外检测样本中CTD-2540F13.2表达水平的产品，其特征在于，所述产品包括制剂、芯片或试剂盒；优选的，所述产品包括：特异性识别CTD-2540F13.2的探针；或特异性扩增CTD-2540F13.2的引物；优选的，所述特异性扩增CTD-2540F13.2的引物序列如SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示。
5.权利要求4-6任一项所述的产品在制备诊断胃癌工具中的用途。
【专利技术属性】
技术研发人员：董东，郑骏年，宁倩倩，
申请(专利权)人：徐州医科大学，
类型：发明
国别省市：江苏;32
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