具有光致发光的非常规和/或反向变化的数字扩增试验制造技术

技术编号:24949010 阅读:45 留言:0更新日期:2020-07-17 23:47
本发明专利技术提供了使用数字扩增试验进行分析的方法和组合物,具有在光致发光中的非常规/反向变化以指示一种或多种靶标的存在。在示例性方法中,可以形成独立样份,其仅一个子集包含靶标。每个样份可包括具有标记物的探针,具有猝灭剂并被配置为与探针杂交以猝灭标记物的接收物,以及被配置为与探针和/或接收物杂交以阻断接收物与探针杂交的分隔物。可以在样份中进行扩增反应以产生对应于靶标的扩增子。分隔物可以与扩增子杂交,并且可以通过扩增反应而延伸或降解。可以检测来自样份的标记物的光致发光,并且靶标阳性样份的光致发光可以小于靶标阴性样份的光致发光。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】具有光致发光的非常规和/或反向变化的数字扩增试验在先申请的交叉引用本申请基于2017年10月19日提交的美国临时专利申请序列号62/574,694并根据35U.S.C.§119(e)要求其权益,该申请通过引用全部纳入本文用于所有目的。对其他材料的交叉引用本申请通过引用整体方式并入以下材料用于所有目的:2006年5月9日授权的美国专利号7,041,481;2010年7月8日公开的美国专利申请公开号2010/0173394A1;2012年12月20日公开的美国专利申请公开号2012/0322058A1;2013年2月14日公开的美国专利申请公开号2013/0040841A1;2015年5月28日公开的美国专利申请公开号2015/0148250A1;以及JosephR.Lakowicz,《荧光光谱原理》(PrinciplesofFluorescenceSpectroscopy)(第2版,1999年)。导言数字扩增试验可以定量样品中的核酸靶标(靶序列)。在典型的数字试验中,在靶标被部分占据时,样品被分成一个集合的独立样份,例如液滴。靶标的拷贝随机本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种分析方法,所述方法包括:/n形成独立样份,每个样份包括相同样品的一部分,其中每个样份还包括(i)具有标记物的探针,(ii)具有猝灭剂并配置为与探针杂交以猝灭标记物的接收物,以及(iii)分隔物,所述分隔物被配置成与探针和/或接收物杂交以阻断接收物与探针的杂交,并且其中仅一个子集的样份包含来自样品的靶标的至少一个拷贝;/n在所述样份中进行扩增反应以产生对应于靶标的扩增子,其中所述分隔物与扩增子杂交,并且其中所述分隔物通过扩增反应在靶标阳性样份中延伸或降解;以及/n检测来自所述样份的标记物的光致发光,其中靶标阳性样份的光致发光小于靶标阴性样份的光致发光。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20171019 US 62/574,6941.一种分析方法,所述方法包括:
形成独立样份,每个样份包括相同样品的一部分,其中每个样份还包括(i)具有标记物的探针,(ii)具有猝灭剂并配置为与探针杂交以猝灭标记物的接收物,以及(iii)分隔物,所述分隔物被配置成与探针和/或接收物杂交以阻断接收物与探针的杂交,并且其中仅一个子集的样份包含来自样品的靶标的至少一个拷贝;
在所述样份中进行扩增反应以产生对应于靶标的扩增子,其中所述分隔物与扩增子杂交,并且其中所述分隔物通过扩增反应在靶标阳性样份中延伸或降解;以及
检测来自所述样份的标记物的光致发光,其中靶标阳性样份的光致发光小于靶标阴性样份的光致发光。


2.如权利要求1所述的方法,其中,所述分隔物与接收物杂交以阻断接收物与探针的杂交。


3.如权利要求1所述的方法,其中,所述分隔物与探针杂交以阻断接收物与探针的杂交。


4.如权利要求1所述的方法,其中,与探针和/或接收物杂交的分隔物比与探针杂交的接收物具有更多的碱基对。


5.如权利要求1所述的方法,其中,所述分隔物与扩增子形成比与探针和/或接收物更多的碱基对。


6.如权利要求1所述的方法,其中,与扩增子杂交的分隔物比与探针和/或接收物杂交的分隔物具有更高的解链温度。


7.如权利要求1所述的方法,其中,所述探针和所述接收物不彼此共价连接。


8.如权利要求1所述的方法,其中,所述探针和所述接收物在相同分子中提供。


9.如权利要求8所述的方法,其中,所述分隔物被配置为阻断接收物与探针的分子内杂交。


10.如权利要求9所述的方法,其中,所述分隔物与探针序列、接收物序列和/或与探针序列和接收物序列之间的间隔序列杂交。


11.如权利要求1所述的方法,其中,所述探针和/或所述接收物被配置为在进行扩增反应的步骤期间防止探针和/或接收物的3'延伸。


12.如权利要求11所述的方法,其中,所述探针和所述接收物中的至少一个包括3'-末端磷酸。


13.如权利要求1所述的方法,其中,所述分隔物在进行扩增反应的步骤中作为扩增引物延伸。


14.如权利要求1所述的方法,其中,所述分隔物通过扩增反应水解。


15.如权利要求14所述的方法,其中,所述分隔物被配置成在进行扩增反应的步骤期间防止所述分隔物的3'-延伸。


16.如权利要求1所述的方法,其中,所述分隔物具有不与靶标杂交的5'尾和与靶标杂交的3'序列,并且其中所述探针或所述接收物与所述分隔物的5'尾杂交但不与3'序列杂交。


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【专利技术属性】
技术研发人员:E·A·赫夫纳D·玛尔
申请(专利权)人:生物辐射实验室股份有限公司
类型:发明
国别省市:美国;US

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