诊断肌少症的肠道菌群及其应用制造技术

本发明专利技术公开了诊断肌少症的肠道菌群及其应用，所述肠道菌群为Eisenbergiella。本发明专利技术通过16S核糖体核糖核酸测序首次发现了Eisenbergiella在肌少症中呈现显著性上调，进一步发现了使用Eisenbergiella作为检测变量区分肌少症和健康群体具有较高的特异性和敏感性，基于此，可以将Eisenbergiella应用于肌少症的无创诊断。

【技术实现步骤摘要】
诊断肌少症的肠道菌群及其应用
本专利技术属于生物
，涉及诊断肌少症的肠道菌群及其应用。
技术介绍
肌肉衰减综合症(Sarcopenia)，简称肌少症，最早由EvansWJ和RosenbergIR于1991年提出，目前已受到越来越广泛的重视。2010年，欧洲肌少症工作组提出了这样的定义：肌少症是一种进行性的肌肉质量和力量的丢失，可能会导致肢体残疾、生活质量降低甚至死亡(Cruz-JentoftAJ,BaeyensJP,BauerJM,etal.Sarcopenia:Europeanconsensusondefinitionanddiagnosis:reportoftheEuropeanworkinggrouponsarcopeniainolderpeople[J].AgeAgeing,2010,39(4):412-423.)。有关肌少症的诊断，很多研究指出，可以通过握力、步数等的测量来诊断，但目前尚无统一标准(YuS,UmapathysivamK,VisvanathanR.Sarcopeniainolderpeople[J].IntJEvidBasedHealthc,2014,12(4):227-243)。随着人们对肌少症研究的不断深入，发现肌少症与跌倒、骨折、虚弱、死亡率等均有关(DennisonEM,SayerAA,CooperC.Epidemiologyofsarcopeniaandinsightintopossibletherapeutictargets[J].NatureReviewsRheumatology,2017,13(6):340-347.)，身体活动功能受损也是死亡率的预测指标(LandiF,CalvaniR,TosatoM,etal.Impactofphysicalfunctionimpairmentandmultimorbidityonmortalityamongcommunitylivingolderpersonswithsarcopaenia:resultsfromtheilSIRENTEprospectivecohortstudy[J].BMJOpen,2016,6(7):e008281.)。目前已知的微生物数目远超过人类细胞数目，人体内的大部分微生物都寄居在肠道，这些肠道微生物通过介导各种各样的宿主反应起着肠道屏障、免疫和内分泌功能(BindelsLB,DelzenneNM.Musclewasting:thegutmicrobiotaasanewtherapeutictarget？[J]IntJBiochemCellBiol,2013,45(10):2186-2190.)。肠道微生态的组成随着年龄的不同而有所改变(OdamakiT,KatoK,SugaharaH,etal.Age-relatedchangesingutmicrobiotacompositionfromnewborntocentenarian:acrosssectionalstudy[J].BMCMicrobiol,2016,16:90.)。已有动物实验发现，肠道微生物的变化与骨骼肌功能的生理衰退有关(SiddharthJ,ChakrabartiA,PannérecA,etal.Agingandsarcopeniaassociatewithspecificinteractionsbetweengutmicrobes,serumbiomarkersandhostphysiologyinrats[J].Aging(AlbanyNY),2017,9(7):1698-1720.)。可见肠道微生态在肌少症的发病过程中可能发挥着一定的作用。肌少症严重影响了老年人的生活质量，而且增加了社会负担，研究与肌少症相关的肠道菌群，探究其在肌少症发生发展过程中的作用，对于加深肌少症的认知以及实现肌少症的诊断和治疗具有重要的意义。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供与肌少症发生发展相关的肠道菌群及其在诊断和治疗肌少症中的应用。为了实现上述目的，本专利技术采用了如下技术方案：本专利技术提供了用于检测肠道菌群丰度的一种或多种试剂在制备用于预测肌少症的产品中的用途，所述肠道菌群至少包括肠道菌属Eisenbergiella。进一步，所述试剂包括与来自Eisenbergiella的靶核苷酸序列能够特异性杂交的一种或多种寡核苷酸。进一步，所述产品还包括从样本中分离核酸的试剂。进一步，所述寡核苷酸被可检测地标记。进一步，Eisenbergiella的靶核苷酸序列是16S核糖体核糖核酸基因的片段。本专利技术提供了一种预测肌少症的试剂盒，所述试剂盒包括检测肠道菌群Eisenbergiella丰度的试剂。进一步，所述试剂包括与来自Eisenbergiella的靶核苷酸序列能够特异性杂交的一种或多种寡核苷酸。进一步，所述寡核苷酸包括特异性识别Eisenbergiella的靶核苷酸序列的探针或特异性扩增Eisenbergiella的靶核苷酸序列的引物。进一步，所述扩增是PCR或RT-PCR，优选的，所述扩增利用可检测的被标记的引物。本专利技术提供了一种组合物及其在制备治疗肌少症的药物中的应用，所述组合物包括降低Eisenbergiella丰度的试剂。进一步，所述药物组合物还包括药学上可接受的载体。附图说明图1是Rank-Abundance曲线图；图2是Eisenbergiella的差异情况图；图3是以Eisenbergiella作为检测变量的ROC曲线图。具体实施方式为了评估肠道共生菌群组成能否作为肌少症的预测因子，本专利技术通过收集肌少症患者和健康人的样本，进行16SrRNA测序以及使用生物信息学进行测序数据的统计，从中筛选出与肌少症相关的肠道菌群，将肠道菌群与疾病信息整合，最大程度预测肌少症患者。本专利技术通过16SrRNA测序，首次发现了Eisenbergiella在肌少症患者和健康人中呈现显著性差异，说明Eisenbergiella可作为肌少症的预测因子。在本专利技术的实施方式中，本专利技术通过以下步骤来诊断肌少症：在来自个体的核酸样本中，检测与肌少症的诊断相关的菌种所对应的一个或多个核酸片段。在特定的实施方式中，检测对应于Eisenbergiella的核酸片段。在实施本文描述的方法中，使用分子生物学、蛋白质生物化学、细胞生物学、免疫学、微生物学和重组DNA方面的很多传统技术，这些技术是公知的。下文提供了本说明书中使用的一些术语的定义。除非另有说明，本文中使用的所有技术和科学用语通常具有和本专利技术所属领域的普通技术人员通常理解的意思相同的意思。本文中使用的术语“诊断”指的是区分或确定疾病、综合征或病症，或者指的是区分或确定患有特定的疾病、综合征或病症的人。在本专利技术的说明性实施方式中，基于分析样本中的菌群标志物来诊断对象中的肌少症。本文中使用的术语“片段”表示长度至少为约15、20、25、30、35、40、45、本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于检测肠道菌群丰度的一种或多种试剂在制备用于预测肌少症的产品中的用途，其特征在于，所述肠道菌群至少包括肠道菌属Eisenbergiella。/n

【技术特征摘要】
1.用于检测肠道菌群丰度的一种或多种试剂在制备用于预测肌少症的产品中的用途，其特征在于，所述肠道菌群至少包括肠道菌属Eisenbergiella。


2.根据权利要求1所述的用途，其特征在于，所述试剂包括与来自Eisenbergiella的靶核苷酸序列能够特异性杂交的一种或多种寡核苷酸。


3.根据权利要求1所述的用途，其特征在于，所述产品还包括从样本中分离核酸的试剂。


4.根据权利要求2所述的用途，其特征在于，所述寡核苷酸被可检测地标记。


5.根据权利要求2所述的用途，其特征在于，Eisenbergiella的靶核苷酸序列是16S核糖体核糖核酸基因的片段。


6.一种预测肌少症的试剂盒，其特征在于，所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：康琳，
申请(专利权)人：中国医学科学院北京协和医院，
类型：发明
国别省市：北京;11