一种多物种GC-MS内源性代谢物数据库及其建立方法技术

本发明专利技术公开了一种多物种GC‑MS内源性代谢物数据库的建立方法，包括：1)将多物种样本衍生化后的GCMS数据基于NIST库搜库，保留打分在700以上的物质作为筛选出的高分物质；2)提取步骤1)筛选出的高分物质的质谱信息，建立高分NIST库；3)将高分NIST库中带衍生化基团的名称翻译并替换成衍生化之前的名称，得到高分库；4)将高分库与扩增后的背景噪音库和扩增后的标准品数据库合并，得到多物种GC‑MS内源性代谢物数据库。本发明专利技术提供的数据库既可以满足植物、动物及微生物等多类型生物样本的检索需求，又能更加准确的定性到更多的代谢物。

【技术实现步骤摘要】
一种多物种GC-MS内源性代谢物数据库及其建立方法
本专利技术属于生物数据库领域，尤其涉及一种多物种GC-MS内源性代谢物数据库及其建立方法。
技术介绍
GCMS技术作为目前在代谢组学研究中最常用的分析手段之一，通常用来分析一些挥发性强的小分子代谢物，对于一些像氨基酸、糖醇类、有机酸、生物胺及有机磷酸盐等分子量较小、极性较大的代谢物则需要通过衍生化(硅烷化或者酯化等)的方式降低其沸点、增加其热稳定性才能通过GCMS分析。而在GCMS分析过程中，最重要的一步则是对代谢物进行定性分析，定性的准确性和数量取决于数据库。目前，GCMS常用的数据库有NIST库、Fiehn库等。NIST标准质谱数据库是由美国国家标准技术研究院(NIST)(NationalInstituteofStandardsandTechnology)出版，现在，基于EI源的NIST库已经更新到NISTv17，搜库软件(NISTMSSearch)的版本也更新到2.3。其中，主库mainlab中已经包含了267376种化合物的质谱图信息，因此NIST库是一个非常大的数据库，正因为本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种多物种GC-MS内源性代谢物数据库的建立方法，包括：/n1)将多物种样本衍生化后的GCMS数据基于NIST库搜库，保留打分在700以上的物质作为筛选出的高分物质；/n2)提取步骤1)筛选出的高分物质的质谱信息，建立高分NIST库；/n3)将高分NIST库中带衍生化基团的名称翻译并替换成衍生化之前的名称，得到高分库；/n4)将高分库与扩增后的背景噪音库和扩增后的标准品数据库合并，得到多物种GC-MS内源性代谢物数据库。/n

【技术特征摘要】
20200228 CN 20201012902191.一种多物种GC-MS内源性代谢物数据库的建立方法，包括：
1)将多物种样本衍生化后的GCMS数据基于NIST库搜库，保留打分在700以上的物质作为筛选出的高分物质；
2)提取步骤1)筛选出的高分物质的质谱信息，建立高分NIST库；
3)将高分NIST库中带衍生化基团的名称翻译并替换成衍生化之前的名称，得到高分库；
4)将高分库与扩增后的背景噪音库和扩增后的标准品数据库合并，得到多物种GC-MS内源性代谢物数据库。


2.根据权利要求1所述的一种多物种GC-MS内源性代谢物数据库的建立方法，其特征在于，步骤2)中，采用基于Python编写的筛选脚本匹配筛选出的高分物质并提取质谱信息。


3.根据权利要求1所述的一种多物种GC-MS内源性代谢物数据库的建立方法，其特征在于，步骤3)中带衍生化基团的名称及翻译的形式包括：
形式①：Name，nTMS(derivative)/n(trimethylsilyl)ether，其中Name为物质衍生化前的名称，n为表征衍生化基团个数的数字或者文字，TMSderivative/(trimethylsilyl)ether为衍生化基团，翻译时去掉“，nTMSderivative/(trimethylsilyl)ether”保留Name即为翻译后名称；
形式②：Name，ntrimethylsilylether,(O)-methyloxime()，其中Name为物质衍生化前的名称，n为衍生化基团的个数，trimethylsilylether为衍生化基团三甲基硅烷酯，methyloxime()为发生肟...

【专利技术属性】
技术研发人员：胡哲，尹小羚，彭章哓，陆嘉伟，胡绪俊，舒烈波，
申请(专利权)人：上海鹿明生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：上海;31