一种用于肝癌诊断的lncRNA生物标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于肝癌诊断的lncRNA生物标志物及其应用，属于生物医药技术领域。所述lncRNA生物标志物为ENST00000508572.1基因，所述ENST00000508572.1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明专利技术还公开了一种诊断肝癌的产品、一种预防或治疗肝癌的药物组合物。本发明专利技术首次发现了ENST00000508572.1基因的差异表达与肝癌的发生发展相关，可以作为lncRNA生物标志物用于肝癌的检测，该lncRNA生物标志物对于人肝癌具有较高的灵敏度和特异性，可以用来预防或治疗肝癌。

An lncrna biomarker for diagnosis of hepatocellular carcinoma and its application

【技术实现步骤摘要】
一种用于肝癌诊断的lncRNA生物标志物及其应用
本专利技术涉及一种用于肝癌诊断的lncRNA生物标志物及其应用，属于生物医药

技术介绍
肝癌是全球高发的恶性肿瘤之一。在世界范围内，每年新发病例超过100万。我国是肝癌的高发地区，肝癌病因复杂，涉及饮食、环境、病毒感染等多种因素。近年来，尽管不断有与肝癌相关的癌基因、抑癌基因以及相关肿瘤信号通路等被发现和证实，但其发病机制尚未完全清楚。目前，对肝癌相关分子及其调控、干预机制的研究是肝癌研究的热点。肝癌早期症状多缺乏特异性，早期病例仅占肝癌手术病例的10％-20％，大约2/3的患者在确诊时已处于中晚期或出现转移，限制了其作为肝癌筛查的临床应用。CT和磁共振等影像学检查已广泛应用于肝癌诊断，但早期肝癌和癌前病变的影像学表现常缺乏特异性，故影像学检查在发现早期肝癌及微小病灶方面有一定的局限性因此，寻找新的生物学靶标用于肝癌的癌变监测和干预，成为肝癌防治迫切需要解决的问题。人类基因组DNA转录生成大量的RNA分子，除蛋白编码基因转录所生成的mRNA外，大多数为不具备蛋白质编码能力的非编码RNA分子，约占65％。lncRNA是一类内源性、片段长度大于200个核苷酸、缺少完整特异的开放阅读框而无编码蛋白质能力的RNA分子，多数由RNA聚合酶II转录并经可变剪切生成，其表达具有组织特异性和时空特异性。lncRNA最初被认为是基因组转录的“噪声”，是RNA聚合酶II作用的副产物，不具有生物学功能。但随后的证据显示，lncRNA参与了基因组印记、染色质修饰、X染色体沉默、核浆运输、转录调控等多种重要的生理过程，能够在染色质水平、转录及转录后水平等多个层面调节基因表达，作用范围非常广泛。近年来通过对肿瘤组织和正常组织的对比研究，发现lncRNA在包括结直肠癌、乳腺癌、前列腺癌、膀肤癌、肝癌、肝癌在内的多种恶性肿瘤中均存在表达异常。肝癌作为一种常见的消化道肿瘤，其发生发展过程中lncRNA的作用越来越受到人们的重视。寻找肝癌早期lncRNA分子标志物、进一步了解lncRNA在肝癌病变早期的生物学功能具有重要的意义。
技术实现思路
本专利技术的目的之一，是提供一种用于肝癌诊断的lncRNA生物标志物。本专利技术首次发现了ENST00000508572.1基因的差异表达与肝癌的发生发展相关，可以作为lncRNA生物标志物用于肝癌的检测，该lncRNA生物标志物对于人肝癌具有较高的灵敏度和特异性，可以用来预防或治疗肝癌。本专利技术解决上述问题的技术方案如下：一种用于肝癌诊断的lncRNA生物标志物，所述lncRNA生物标志物为ENST00000508572.1基因，所述ENST00000508572.1基因的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。ENST00000508572.1基因的介绍：本专利技术的长链非编码RNA的命名为lnc-COX7C-5，位于第5号染色体上，EnsemblGeneID为ENSG00000248195，lnc-COX7C-5的转录本序列是具有785bp的长度，相应的DNA序列如SEQIDNO.1所示。本专利技术的用于肝癌诊断的lncRNA生物标志物的有益效果是：本专利技术首次发现了ENST00000508572.1基因的差异表达与肝癌的发生发展相关，可以作为lncRNA生物标志物用于肝癌的检测，该lncRNA生物标志物对于人肝癌具有较高的灵敏度和特异性，可以用来预防或治疗肝癌。术语“生物标志物”是其在组织或细胞中的表达水平与正常或健康细胞或组织的表达水平相比发生改变的任何基因。本领域技术人员将认识到，本专利技术的实用性并不局限于对本专利技术的标志物基因的任何特定变体的基因表达进行定量。作为非限制性的实例，标志物基因可具有SEQIDNO.1指定的核苷酸序列。在一些实施方案中，其具有与所列的序列至少85％相同或相似的cDNA序列，诸如上述所列的序列至少90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或至少99％相同或相似的cDNA序列。本专利技术可以利用本领域内已知的任何方法测定基因表达。本领域技术人员应当理解，测定基因表达的手段不是本专利技术的重要方面。可以在转录水平上检测生物标志物的表达水平。在一些实施方案中，在转录水平上检测生物标志物的表达水平。利用核酸杂交技术进行具体DNA和RNA测量的多种方法是本领域技术人员已知的。一些方法涉及电泳分离(例如用于检测DNA的Southern印迹和用于检测RNA的Northern印迹)，但是也可以在不利用电泳分离的情况下进行DNA和RNA的测量(例如通过斑点印迹)。基因组DNA(例如来自人)的Southern印迹可用于筛选限制性片段长度多态性(RFLP)，以检测影响本专利技术多肽的遗传病症的存在。可以检测所有形式的RNA。本专利技术的目的之二，是提供一种诊断肝癌的产品。本专利技术的诊断肝癌的产品，能够通过检测样本中ENST00000508572.1基因的表达水平来诊断患者是否患有肝癌，ENST00000508572.1基因在肝癌患者中表达上调。本专利技术解决上述问题的技术方案如下：一种诊断肝癌的产品，所述产品为芯片、制剂和试剂盒中的任意一种，所述产品能够测定样本中上述的ENST00000508572.1基因的表达水平。本专利技术的诊断肝癌的产品的有益效果是：本专利技术的诊断肝癌的产品，能够通过检测样本中ENST00000508572.1基因的表达水平来诊断患者是否患有肝癌，ENST00000508572.1基因在肝癌患者中表达上调。术语“诊断”，是指通过疾病的体征和症状或遗传分析、病理分析、组织学分析等识别疾病。术语“样本”以其最广泛的含义使用。在一种含义中，意在包括从任何来源获得的标本或培养物，以及生物和环境样本。生物样本可获自动物(包括人)并涵盖液体、固体、组织和气体。生物样本包括血液制品，诸如血浆、血清等。然而，此类样本不应解释为限制适用于本专利技术的样本类型。在上述技术方案的基础上，本专利技术还可以做如下改进。进一步，所述芯片包括固相载体以及有序固定在所述固相载体上的寡核苷酸探针，所述寡核苷酸探针特异性地对应于ENST00000508572.1基因的部分或全部序列。采用上述进一步的有益效果是：可根据本专利技术所述的ENST00000508572.1基因，设计出适合的探针，固定在固相载体上，形成“寡核苷酸阵列”。所述“寡核苷酸阵列”是指具有可寻址位置(即以区别性的，可访问的地址为特征的位置)的可将阵列，每个可寻址位置均含有一个与其相连的特征性寡核苷酸。根据需要，寡核苷酸阵列分成多个亚阵。术语“探针”指能与另一分子的特定序列或亚序列或其它部分结合的分子。除非另有指出，术语“探针”通常指能通过互补碱基配对与另一多核苷酸(往往称为“靶多核苷酸”)结合的多核苷酸探针。根据杂交条件的严格性，探针能和与该探针缺乏完全序列互补性的靶多核苷酸结合。探针可作直接或间接的标记，其范围包括引物。杂交方式，包括但不限于溶液相、固相、混合相本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于肝癌诊断的lncRNA生物标志物，其特征在于，所述lncRNA生物标志物为ENST00000508572.1基因，所述ENST00000508572.1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。/n

【技术特征摘要】
1.一种用于肝癌诊断的lncRNA生物标志物，其特征在于，所述lncRNA生物标志物为ENST00000508572.1基因，所述ENST00000508572.1基因的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。


2.一种诊断肝癌的产品，所述产品为芯片、制剂和试剂盒中的任意一种，其特征在于，所述产品能够测定样本中如权利要求1所述的ENST00000508572.1基因的表达水平。


3.根据权利要求2所述的诊断肝癌的产品，其特征在于，所述芯片包括固相载体以及有序固定在所述固相载体上的寡核苷酸探针，所述寡核苷酸探针特异性地对应于ENST00000508572.1基因的部分或全部序列。


4.根据权利要求2所述的诊断肝癌的产品，其特征在于，所述制剂或所述试剂盒包括ENST00000508572.1基因的特异性引物和探针。


5.根据权利要求4所述的诊断肝癌的产品，其特征在于，所述ENST00000508572.1基因的特异性引物包括如SEQIDNO.2所示的正向引物和如SEQIDNO.3所...

【专利技术属性】
技术研发人员：唐博，张易，苏辉昭，王焱，舒格格，
申请(专利权)人：广西医科大学，
类型：发明
国别省市：广西;45