一种鉴定枫香属植物的分子标记引物、其应用及鉴定方法技术

技术编号:24669956 阅读:34 留言:0更新日期:2020-06-27 04:56
本发明专利技术公开了一种鉴定枫香属植物的分子标记引物、其应用及鉴定方法。本发明专利技术通过高通量测序所得的转录组序列为基础进行了枫香EST‑SSR标记的开发,从NCBI数据库下载转录组序列读段,拼接组装Unigenes。用MISA软件寻找SSR位点,用Primer3来设计引物。筛选多态性SSR引物,得到多态性引物信息。最终得到多态性SSR引物32对。本发明专利技术提供的引物可以辅助鉴定枫香属品种的鉴定并作为种质资源评价,遗传图谱构建,分子辅助选择育种,遗传多样性分析等方面有力的研究工具,为进一步的枫香属植物遗传育种研究奠定基础。

A molecular marker primer for identification of Liquidambar, its application and identification method

【技术实现步骤摘要】
一种鉴定枫香属植物的分子标记引物、其应用及鉴定方法
本专利技术涉及一种鉴定植物的分子标记引物、其应用以及植物鉴定方法,特别涉及一种鉴定枫香植物的EST-SSR分子标记引物、其应用以及植物鉴定方法,本专利技术属于植物品种的分子生物学鉴定方法

技术介绍
枫香属(Liquidambarspp.)树种生长速度快、材性好并且适于上山造林,特别是北美枫香(L.styraciflua)和枫香(L.formosana)。另外,随着我国的国民经济水平日益提高,对具有较高观赏价值的树种需求也与日俱增。枫香和北美枫香是著名观赏树种,具有较高的开发价值。枫香属树种是虎耳草亚目金缕梅科的落叶乔木,共有5个种及1个变种,我国有枫香树(中国枫香树),缺萼枫香树以及山枫香树,主要分布于我国东部黄河以南地区及台湾省,生长速度快,在天然野生状态下也表现出很强的适应性。其材质优良,用途广泛,而且对二氧化硫,氯化物有较强的抗性,枫香树属共有5个种及1个变种,我国有枫香树(中国枫香树),缺萼枫香树以及山枫香树,近年来,北美枫香树及苏合枫香树在我国也得到了培养及种植。枫香树属植本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种鉴定枫香属植物的分子标记引物,其特征在于,所述分子标记引物为SSR引物。/n

【技术特征摘要】
1.一种鉴定枫香属植物的分子标记引物,其特征在于,所述分子标记引物为SSR引物。


2.如权利要求1所述的分子标记引物,其特征在于,所述分子标记引物包括如下32对,分子标记引物的碱基氨酸序列为SEQIDNO.1-64。


3.如权利要求2所述的分子标记引物,其特征是,所述32对分子标记引物对的上游引物和下游引物的碱基核苷酸序列如下:
(1)C2引物对:下游引物序列为SEQIDNO.1,上游引物序列为SEQIDNO.2;
(2)C4引物对:下游引物序列为SEQIDNO.3,上游引物序列为SEQIDNO.4;
(3)C7引物对:下游引物序列为SEQIDNO.5,上游引物序列为SEQIDNO.6;
(4)C10引物对:下游引物序列为SEQIDNO.7,上游引物序列为SEQIDNO.8;
(5)C16引物对:下游引物序列为SEQIDNO.9,上游引物序列为SEQIDNO.10;
(6)C17引物对:下游引物序列为SEQIDNO.11,上游引物序列为SEQIDNO.12;
(7)C25引物对:下游引物序列为SEQIDNO.13,上游引物序列为SEQIDNO.14;
(8)C28引物对:下游引物序列为SEQIDNO.15,上游引物序列为SEQIDNO.16;
(9)C30引物对:下游引物序列为SEQIDNO.17,上游引物序列为SEQIDNO.18;
(10)C33引物对:下游引物序列为SEQIDNO.19,上游引物序列为SEQIDNO.20;
(11)C34引物对:下游引物序列为SEQIDNO.21,上游引物序列为SEQIDNO.22;
(12)C35引物对:下游引物序列为SEQIDNO.23,上游引物序列为SEQIDNO.24;
(13)C43引物对:下游引物序列为SEQIDNO.25,上游引物序列为SEQIDNO.26;
(14)C44引物对:下游引物序列为SEQIDNO.27,上游引物序列为SEQIDNO.28;
(15)C51引物对:下游引物序列为SEQIDNO.29,上游引物序列为SEQIDNO.30;
(16)C55引物对:上游引物序列为SEQIDNO.31,上游引物序列为SEQIDNO.32;
(17)C59引物对:下游引物序列为SEQIDNO.33,上游引物序列为SEQIDNO.34;
(18)C60引物对:下游引物序列为SEQIDNO.35,上游引物序列为SEQIDNO.36;
(19)C62引物对:上游引物序列为SEQIDNO.37,上游引物序列为SEQIDNO.38;
(20)C64引物对:下游引物序列为SEQIDNO.39,上游引物序列为SEQIDNO.40;
(21)C67引物对:下游引物序列为SEQIDNO.41,上游引物序列为SEQIDNO.42;
(22)C70引物对:下游引物序列为SEQIDNO.43,上游引物序列为SEQIDNO.44;
(23)C86引物对:下游引物序列为SEQIDNO.45,下游引物序列为SEQIDNO.46;
(24)C89引物对:下游引物序列为SEQIDNO.47,上游引物序列为SEQIDNO.48;
(25)C90引物对:下游引物序列为SEQIDNO.49,上游引物序列为SEQIDNO.50;
(26)C92引物对:下游引物序列为SEQIDNO.51,上游引物序列为SEQIDNO.52;
(27)C98引物对:下游引物序列为SEQIDNO.53,上游引物序列为SEQIDNO.54;
(28)C13引物对:下游引物序列为SEQIDNO.55,上游引物序列为SEQIDNO.56;
(29)C16引物对:下游引物序列为SEQIDNO.57,上游引物序列为SEQIDNO.58;
(30)C46引物对:下游引物序列为SEQIDNO.59,上游引物序列为SEQIDNO.60;
(31)C42引物对:下游引物序列为SEQIDNO.61,上游引物序列为SEQIDNO.62;
(32)C48引物对:下游引物序列为SEQIDNO.63,上游引物序列为SEQIDNO.64。


4.如权利要求1-3任一所述的分子标记引物,其特征是,所述枫香属植物选择为枫香(L.formosana)、北美枫香(L.styraciflua)或杂交枫香(Hybridsweetgum)。


5.一种鉴定枫香属植物的试剂盒,其特征是,包括如权利要求1-3任一所述的分子标记引物。


6.如权利要求1-3任一所述的分子标记引物在如下任意一种中的应用,
1)在鉴定枫香属植物中的应用;
2)在枫香属植物中遗传多样性分析中的应用;
3)在枫香属植物遗传图谱的构建中的应用;
4)在枫香...

【专利技术属性】
技术研发人员:张金凤陈思源董明亮赵健范英明孔立生
申请(专利权)人:北京林业大学
类型:发明
国别省市:北京;11

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