用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点、KASP标记及其应用制造技术

本发明专利技术属于分子生物学领域，提供了一种用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点、KASP标记及其应用。本发明专利技术提供的用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点为西瓜基因组2号染色体上第29421971位核苷酸T→G；所述KASP标记具有序列表中序列1或序列2所示的核苷酸序列组成；用于检测西瓜白粉病抗性的KASP标记的引物序列组合包括序列表中的序列3、4和5；本发明专利技术还提供了含有上述引物序列组合的试剂盒，及上述引物组合和试剂盒的应用。本发明专利技术提供的SNP位点和KASP标记具有快速、直接、特异性高和高通量等特点，可在较短时间内完成大批量材料中抗白粉病基因的筛选和表型预测工作，可有效服务于西瓜白粉病抗病育种工作。

SNP loci, kasp markers and their application in the detection of powdery mildew resistance in Watermelon

【技术实现步骤摘要】
用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点、KASP标记及其应用
本专利技术属于分子生物学领域，特别涉及一种用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点、KASP标记及其应用。
技术介绍
白粉病是危害葫芦科瓜类作物的重要病害之一，严重影响瓜类的产量和品质。近年来，随着保护地栽培面积的不断扩大，西瓜白粉病发病有日益严重的趋势，已经成为西瓜绿色无公害生产的重要障碍。因此，防控西瓜白粉病对改善西瓜品质、提高西瓜产量具有重要意义。利用西瓜白粉病抗病基因进行抗病品种的选育无疑是最为安全、经济的白粉病防治措施。而进行西瓜白粉病表型鉴定时，易受温度、湿度等环境的影响，给抗病性鉴定带来了很大的阻碍。近年来广泛应用的分子标记则不受基因表达及环境的影响。因此，开发与西瓜白粉病抗性基因紧密连锁的分子标记，以辅助西瓜白粉病抗性改良，可避免繁杂耗时的抗性筛选过程、缩短育种年限，提高西瓜抗白粉病分子聚合育种的效率。北京地区葫芦科作物白粉病菌Podosphaeraxanthii(P.xanthii)的优势生理小种是2France(2F)，开展P.xanthii2F对应的抗病基本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点，其特征在于，所述SNP位点为西瓜基因组2号染色体上第29421971位核苷酸T→G。/n

【技术特征摘要】
1.一种用于检测西瓜白粉病抗性的SNP位点，其特征在于，所述SNP位点为西瓜基因组2号染色体上第29421971位核苷酸T→G。


2.一种用于检测西瓜白粉病抗性的KASP标记，其特征在于，所述KASP标记具有序列表中序列1或序列2所示的核苷酸序列组成。


3.一种用于检测权利要求2所述的用于检测西瓜白粉病抗性的KASP标记的引物序列组合，其特征在于，所述引物序列组合包括序列表中的序列3、4和5。


4.根据权利要求3所述的引物序列组合，其特征在于，
所述序列3的引物序列的5’端还包括荧光探针序列A，所述荧光探针序列A的序列组成为：5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’；即，所述序列3的引物序列的5’端包括荧光探针序列A时为序列表中的序列6所示的序列；
所述序列4的引物序列的5’端还包括荧光探针序列B，所述荧光探针序列B的序列组成为：5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’；即，所述序列4的引物序列的5’端包括荧光探针序列B时为序列表中的序列7所示的序列。


5.一种用于检测西瓜白粉病抗性的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求3或4所述的用于检测西瓜白粉病抗性的KASP标记的引物序列组合。


6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于，所述用于检测西瓜白粉病抗性的试剂盒还包括荧光探针A、荧光探针B、淬灭探针A、淬灭探针B、高保真Taq酶和dNTP；
所述荧光探针A的序列为5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’，5’末端连接1个荧光基团HEX；
所述荧光探针B的序列为5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’，5’末端连接1个荧光基团FAM；
所述淬灭探针A的序列为5’-AATCCGTTGACTCCGACCTTC-3’，3’末端连接淬灭基团BHQ；
所述淬灭探针B的序列为5’-AGCATGAACTTGGTCACCTTC-3’，3’末端连接淬灭基团BHQ。


7.权利要求3或4所述的用于检测西瓜白粉病抗性的KASP标记的引物序列组合，或者权利要求5或6所述的用于检测西瓜白粉病...

【专利技术属性】
技术研发人员：许勇，李茂营，宫国义，张海英，郭绍贵，张洁，任毅，
申请(专利权)人：北京市农林科学院，
类型：发明
国别省市：北京;11