【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】溶质运载体家族14成员1(SLC14A1)变体及其用途序列表的引用本申请包括以文本文件形式电子提交的序列表，所述文本文件名为18923800902SEQ，于2018年9月6日创建，大小是101千字节。所述序列表以引用的方式并入本文。
本公开总体上涉及遗传学领域。更特别地，本公开涉及溶质运载体家族14成员1(SoluteCarrierFamily14Member1，SLC14A1)中的与例如针对冠状动脉疾病(CAD)的保护相关的基因改变和多肽变体。
技术介绍
在整篇说明书中引用各种参考资料，包括专利、专利申请、登录号、技术文章和学术文章。每个参考资料都以引用的方式整体以及出于所有目的并入本文。冠状动脉疾病(CAD)在对心脏提供血液、氧和营养物的冠状动脉变得受损害或患病时显现。CAD的常见病因是含胆固醇沉积物(斑块)和炎症。斑块积累导致冠状动脉狭窄，由此导致向心脏的血流降低。在一些情况下，血流降低可导致胸痛(绞痛)、呼吸短促或其他冠状动脉疾病征象和症状。完全堵塞可导致心肌梗塞。静脉血栓栓塞(VTE...
【技术保护点】
1.一种编码人溶质运载体家族14成员1(SLC14A1)蛋白的cDNA，所述cDNA包含与SEQ IDNO:9至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％同一的核酸序列，条件是所述核酸序列编码在对应于根据SEQ ID NO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的氨基酸序列；或所述核酸序列的互补序列。/n
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170907 US 62/555,4401.一种编码人溶质运载体家族14成员1(SLC14A1)蛋白的cDNA，所述cDNA包含与SEQIDNO:9至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％同一的核酸序列，条件是所述核酸序列编码在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的氨基酸序列；或所述核酸序列的互补序列。
2.根据权利要求1所述的cDNA，其中所述核酸序列包含SEQIDNO:9。
3.一种编码人溶质运载体家族14成员1(SLC14A1)蛋白的cDNA，所述cDNA包含与SEQIDNO:10至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％同一的核酸序列，条件是所述核酸序列编码在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸的氨基酸序列；或所述核酸序列的互补序列。
4.根据权利要求3所述的cDNA，其中所述核酸序列包含SEQIDNO:10。
5.一种载体，所述载体包含根据权利要求1至4中任一项所述的cDNA。
6.根据权利要求5所述的载体，所述载体还包含外源性供体序列。
7.根据权利要求5或6所述的载体，其中所述载体包括质粒。
8.根据权利要求5或权利要求6所述的载体，其中所述载体包括病毒。
9.一种组合物，所述组合物包含根据权利要求1至4中任一项所述的cDNA以及载剂。
10.一种组合物，所述组合物包含根据权利要求5至8中任一项所述的载体以及载剂。
11.一种宿主细胞，所述宿主细胞包含根据权利要求1至4中任一项所述的cDNA。
12.一种宿主细胞，所述宿主细胞包含根据权利要求5至8中任一项所述的载体。
13.根据权利要求11或权利要求12所述的宿主细胞，其中所述cDNA可操作地连接于在所述宿主细胞中具有活性的启动子。
14.根据权利要求13所述的宿主细胞，其中所述启动子是诱导型启动子。
15.根据权利要求11至14中任一项所述的宿主细胞，其中所述宿主细胞是细菌细胞、酵母细胞或昆虫细胞。
16.根据权利要求11至14中任一项所述的宿主细胞，其中所述宿主细胞是哺乳动物细胞。
17.一种包含至少约15个核苷酸，并且杂交于编码SLC14A1蛋白的核酸序列的经分离的改变特异性探针或引物，其中所述改变特异性探针或引物包含互补于所述SLC14A1编码核酸序列的编码在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处的异亮氨酸的部分或其互补序列的核酸序列。
18.一种包含至少约15个核苷酸，并且杂交于编码SLC14A1蛋白的核酸序列的经分离的改变特异性探针或引物，其中所述改变特异性探针或引物包含互补于所述SLC14A1编码核酸序列的编码在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处的异亮氨酸的部分或其互补序列的核酸序列。
19.一种经分离的改变特异性探针或引物，所述经分离的改变特异性探针或引物包含互补于编码在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处具有异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列和/或互补于编码在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处具有异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列的核酸序列，其中所述改变特异性探针或引物包含互补于以下的核酸序列：所述核酸序列的包含对应于根据SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置的部分或其互补序列；所述核酸序列的包含对应于根据SEQIDNO:5的位置226至228的位置的部分或其互补序列；所述核酸序列的包含对应于根据SEQIDNO:6的位置394至396的位置的部分或其互补序列；所述核酸序列的包含对应于根据SEQIDNO:9的位置226至228的位置的部分或其互补序列；所述核酸序列的包含对应于根据SEQIDNO:10的位置394至396的位置的部分或其互补序列。
20.一种在人受试者中确定人受试者是否携带SLC14A1变体核酸分子的方法，所述方法包括测定从所述受试者获得的样品以确定所述样品中的核酸分子是否包含编码在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列，和/或所述样品中的核酸分子是否包含编码在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列。
21.根据权利要求20所述的方法，其中如果在所述样品中鉴定到包含编码在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列的核酸分子，和/或如果在所述样品中鉴定到包含编码在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列的核酸分子，那么将所述人受试者分类为处于降低的显现凝血疾患或冠状动脉疾病(CAD)的风险下。
22.根据权利要求20或权利要求21所述的方法，其中如果在所述样品中鉴定到包含编码不在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列的核酸分子，和/或如果在所述样品中鉴定到包含编码不在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列的核酸分子，那么将所述人受试者分类为处于增加的显现凝血疾患或CAD的风险下。
23.根据权利要求21或权利要求22所述的方法，其中所述凝血疾患选自血栓形成、肺栓塞、心肌梗塞(MI)、静脉血栓栓塞(VTE)、深静脉血栓形成(DVT)、脑动脉瘤和中风。
24.根据权利要求20至23中任一项所述的方法，其中所述测定包括：
对所述样品中的SLC14A1基因组核酸序列的一部分测序，其中测序的所述部分包括对应于根据SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置；
对所述样品中的SLC14A1mRNA核酸序列的一部分测序，其中测序的所述部分包括对应于根据SEQIDNO:5的位置226至228的位置；
对所述样品中的SLC14A1mRNA核酸序列的一部分测序，其中测序的所述部分包括对应于根据SEQIDNO:6的位置394至396的位置；
对从所述样品中的mRNA核酸分子获得的SLC14A1cDNA核酸序列的一部分测序，其中测序的所述部分包括对应于根据SEQIDNO:9的位置226至228的位置；和/或
对从所述样品中的mRNA核酸分子获得的SLC14A1cDNA核酸序列的一部分测序，其中测序的所述部分包括对应于根据SEQIDNO:10的位置394至396的位置。
25.根据权利要求20至23中任一项所述的方法，其中所述测定包括：
a)使所述样品与引物接触，所述引物杂交于：i)SLC14A1基因组核酸序列的邻近于所述SLC14A1基因组序列的对应于根据SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置的部分；ii)SLC14A1mRNA核酸序列的邻近于所述SLC14A1mRNA的对应于根据SEQIDNO:5的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:6的位置394至396的位置的部分；或iii)从mRNA获得的SLC14A1cDNA核酸序列的邻近于所述SLC14A1cDNA的对应于根据SEQIDNO:9的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:10的位置394至396的位置的部分；
b)使所述引物延伸至少穿过：i)所述SLC14A1基因组核酸序列的对应于根据SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置；ii)所述SLC14A1mRNA核酸序列的对应于根据SEQIDNO:5的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:6的位置394至396的位置；或iii)所述SLC14A1cDNA核酸序列的对应于根据SEQIDNO:9的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:10的位置394至396的位置；和
c)确定所述引物的延伸产物是否在i)对应于根据SEQIDNO:2的SLC14A1基因组核酸序列的位置6963至6965的位置；ii)对应于根据SEQIDNO:5的SLC14A1mRNA核酸序列的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:6的SLC14A1mRNA核酸序列的位置394至396的位置；或iii)对应于根据SEQIDNO:9的SLC14A1cDNA核酸序列的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:10的SLC14A1cDNA核酸序列的位置394至396的位置处包含以下核苷酸：
所述核苷酸编码在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处的异亮氨酸，或编码在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处的异亮氨酸。
26.根据权利要求20至23中任一项所述的方法，其中所述测定包括使所述样品与在严格条件下特异性杂交于SLC14A1变体基因组核酸序列、SLC14A1变体mRNA核酸序列或SLC14A1变体cDNA核酸序列而非相应野生型SLC14A1核酸序列的引物或探针接触，其中所述SLC14A1变体基因组核酸序列、SLC14A1变体mRNA核酸序列或SLC14A1变体cDNA核酸编码在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的氨基酸序列，或编码在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸的氨基酸序列，
以及确定杂交是否已发生。
27.根据权利要求20至26中任一项所述的方法，其中所述方法是体外方法。
28.一种确定人受试者是否携带SLC14A1Val76Ile蛋白和/或SLC14A1Val132Ile蛋白的方法，所述方法包括对从所述人受试者获得的样品进行测定以确定所述样品中的SLC14A1蛋白是否在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸，和/或所述样品中的SLC14A1蛋白是否在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸。
29.根据权利要求28所述的方法，其中如果在所述样品中鉴定到在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白，和/或如果在所述样品中鉴定到在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白，那么将所述人受试者分类为处于降低的显现凝血疾患或冠状动脉疾病(CAD)的风险下。
30.根据权利要求28或权利要求29所述的方法，其中如果在所述样品中鉴定到不在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白，和/或如果在所述样品中鉴定到不在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白，那么将所述人受试者分类为处于增加的显现凝血疾患或CAD的风险下。
31.根据权利要求29或权利要求30所述的方法，其中所述凝血疾患选自血栓形成、肺栓塞、心肌梗塞(MI)、静脉血栓栓塞(VTE)、深静脉血栓形成(DVT)、脑动脉瘤和中风。
32.根据权利要求28至31中任一项所述的方法，其中酶联免疫吸附测定(ELISA)用于确定所述样品中的SLC14A1蛋白是否在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸，和/或所述样品中的SLC14A1蛋白是否在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸。
33.根据权利要求28至32中任一项所述的方法，其中所述方法是体外方法。
34.一种确定人受试者对显现凝血疾患或冠状动脉疾病(CAD)的易感性的方法，所述方法包括：
a)测定从所述人受试者获得的样品以确定所述样品中的核酸分子是否包含编码在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列，和/或所述样品中的核酸分子是否包含编码在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列；和
b)如果所述样品中的核酸分子包含编码在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列，和/或如果所述样品中的核酸分子包含编码在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白的核酸序列，那么将所述人受试者分类为处于降低的显现所述凝血疾患或CAD的风险下，或
如果所述样品中的核酸分子编码不在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白，和/或如果所述样品中的核酸分子编码不在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处包含异亮氨酸的SLC14A1蛋白，那么将所述人受试者分类为处于增加的显现所述凝血疾患或CAD的风险下。
35.根据权利要求34所述的方法，其中所述测定包括：
对所述样品中的SLC14A1基因组核酸序列的一部分测序，其中测序的所述部分包括对应于根据SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置；
对所述样品中的SLC14A1mRNA核酸序列的一部分测序，其中测序的所述部分包括对应于根据SEQIDNO:5的位置226至228的位置；
对所述样品中的SLC14A1mRNA核酸序列的一部分测序，其中测序的所述部分包括对应于根据SEQIDNO:6的位置394至396的位置；
对从所述样品中的mRNA核酸分子获得的SLC14A1cDNA核酸序列的一部分测序，其中测序的所述部分包括对应于根据SEQIDNO:9的位置226至228的位置；和/或
对从所述样品中的mRNA核酸分子获得的SLC14A1cDNA核酸序列的一部分测序，其中测序的所述部分包括对应于根据SEQIDNO:10的位置394至396的位置。
36.根据权利要求34所述的方法，其中所述测定包括：
a)使所述样品与引物接触，所述引物杂交于：i)SLC14A1基因组核酸序列的邻近于所述SLC14A1基因组序列的对应于根据SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置的部分；ii)SLC14A1mRNA核酸序列的邻近于所述SLC14A1mRNA核酸的对应于根据SEQIDNO:5的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:6的位置394至396的位置的部分；或iii)从mRNA获得的SLC14A1cDNA核酸序列的邻近于所述SLC14A1cDNA的对应于根据SEQIDNO:9的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:10的位置394至396的位置的部分；
b)使所述引物延伸至少穿过：i)所述SLC14A1基因组核酸序列的对应于根据SEQIDNO:2的位置6963至6965的位置；ii)所述SLC14A1mRNA核酸序列的对应于根据SEQIDNO:5的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:6的位置394至396的位置；或iii)所述SLC14A1cDNA核酸序列的对应于根据SEQIDNO:9的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:10的位置394至396的位置；和
c)确定所述引物的延伸产物是否在i)对应于根据SEQIDNO:2的SLC14A1基因组核酸序列的位置6963至6965的位置；ii)对应于根据SEQIDNO:5的SLC14A1mRNA核酸序列的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:6的SLC14A1mRNA核酸序列的位置394至396的位置；或iii)对应于根据SEQIDNO:9的SLC14A1cDNA核酸序列的位置226至228或对应于根据SEQIDNO:10的SLC14A1cDNA核酸序列的位置394至396的位置处包含以下核苷酸：
所述核苷酸编码在对应于根据SEQIDNO:13的位置76的位置处的异亮氨酸，或编码在对应于根据SEQIDNO:14的位置132的位置处的异亮氨酸。
37.根据权利要求34所述的方法，其中所述测定包括使所述样品与在严格条件下特异性杂交于SLC14A1变体基因组核酸序列、SLC14A1变体mRNA核酸序列或SLC14A1变体cDNA核酸序列而非相应野生型SLC14A1核酸序列的引物或探针接触，其中所述SLC14A1变体基因组核酸序列、SLC14A1变...
【专利技术属性】
技术研发人员：T·特斯洛维奇·多斯塔尔，J·巴克曼，
申请(专利权)人：雷杰纳荣制药公司，
类型：发明
国别省市：美国;US
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