一种欧山羊草特异分子标记获取方法及其应用技术

本发明专利技术公开了一种欧山羊草特异分子标记获取方法及其应用，包括提取待测欧山羊草的基因组DNA后简化基因组文库构建及高通量测序，序列分析以及特定基因的SLAF标签的筛选后测序获得的SLAF标签与已知小麦的参考基因组序列进行比对后，筛选同源性小于50％的序列进行引物设计，筛选欧山羊草特异分子标记，筛选得到的欧山羊草引物进一步利用同源性山羊草中具有特定基因的山羊草基因组供体进一步定位到欧山羊草中特定基因上，对设计的引物进行PCR扩增后获得的欧山羊草特异分子标记。本发明专利技术可用于小麦背景下欧山羊草染色体、染色体片段等遗传成分的检测，通过简化基因组测序技术，可大规模快速地对小麦‑欧山羊草衍生系材料进行检测，且省时省力，花费少。

A method for obtaining specific molecular markers of Leymus chinensis and its application

【技术实现步骤摘要】
一种欧山羊草特异分子标记获取方法及其应用
本专利技术属于分子标记筛选
，具体涉及一种欧山羊草特异分子标记获取方法及其应用。
技术介绍
山羊草属(AegilopsL.)是小麦近缘植物中与小麦亲缘关系最为密切的属，在小麦进化中起着重要作用，并为小麦改良提供了一批优良基因。山羊草属由11个二倍体，10个四倍体和2个六倍体组成(VanSlageren,1994)，包括C、D、N、M、S和U基因组(MirzaghaderiandMason2019)。欧山羊草(Ae.biuncialis，2n＝4x＝28,UUMM)携带有抗旱、耐盐、抗病等优异基因，但目前，关于欧山羊草特异分子标记开发与检测进展较少。从108个小麦SSR标记中筛选到2个分子标记(GWM44和GDM61)可用于欧山羊草2Mb和3Mb染色体的检测；筛选到少数U和M基因组特异的COS(conservedorthologousset)标记；从48个PLUG标记当中筛选到5个欧山羊草1Ub特异的分子标记，以上报导均是利用已有的小麦分子标记信息开发而来，且开发效率低。同时，这些标记远远无法满足小本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种欧山羊草特异分子标记获取方法，其特征在于：/n包括以下步骤/nA提取待测欧山羊草的基因组DNA后简化基因组文库构建及高通量测序；/nB序列分析以及特定基因的SLAF标签的筛选；/nC测序获得的SLAF标签与已知小麦的参考基因组序列进行比对后，筛选同源性小于50％的序列进行引物设计，筛选欧山羊草特异分子标记；筛选得到的欧山羊草(U和M基因组)引物进一步利用同源性山羊草中具有特定基因的山羊草基因组供体进一步定位到欧山羊草中特定基因上。/nD以小麦属植物基因组DNA为阴性对照，欧山羊草基因组DNA为阳性对照，对设计的引物进行PCR扩增后获得的欧山羊草特异分子标记。/n

【技术特征摘要】
1.一种欧山羊草特异分子标记获取方法，其特征在于：
包括以下步骤
A提取待测欧山羊草的基因组DNA后简化基因组文库构建及高通量测序；
B序列分析以及特定基因的SLAF标签的筛选；
C测序获得的SLAF标签与已知小麦的参考基因组序列进行比对后，筛选同源性小于50％的序列进行引物设计，筛选欧山羊草特异分子标记；筛选得到的欧山羊草(U和M基因组)引物进一步利用同源性山羊草中具有特定基因的山羊草基因组供体进一步定位到欧山羊草中特定基因上。
D以小麦属植物基因组DNA为阴性对照，欧山羊草基因组DNA为阳性对照，对设计的引物进行PCR扩增后获得的欧山羊草特异分子标记。


2.根据权利要求1所述的欧山羊草特异分子标记获取方法，其特征在于，所述扩增体系为10μl，包括：1μl的DNA模板，1μl的上游引物，1μl的下游引物，5μl的TaqPCRMix，2μl的ddH2O。


3...

【专利技术属性】
技术研发人员：宋利强，李俊明，纪军，张玮，张娜，
申请(专利权)人：中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心，
类型：发明
国别省市：河北;13