一种提取基质附着微生物总DNA的装置和方法制造方法及图纸

本发明专利技术公开了一种提取基质附着微生物总DNA的装置和方法，属于分子生物学技术领域，该装置包括控压冲洗装置、负压装置和收集装置，通过控压冲洗装置控制冲洗出水水压，通过负压管路将冲洗管路冲洗基质产生的混悬液收集至收集装置，本发明专利技术同时公开了DNA的提取方法，在加压下冲洗基质，配合负压装置收集样品，克服了现有技术针对附着在基质上的微生物样品存在取样困难、取样不完整的难题，显著改善了基质附着微生物基因组DNA的代表性、提取效率和质量，条带明亮清晰、基本无降解，对难提取微生物，如真菌等均有较好的提取效率。

A device and method for extracting total DNA of substrate attached microorganism

【技术实现步骤摘要】
一种提取基质附着微生物总DNA的装置和方法
本专利技术涉及分子生物学
，具体涉及一种提取基质附着微生物总DNA的装置和方法。
技术介绍
近年来，随着测序技术的发展，基于环境样品总脱氧核糖核酸(DNA)，对微生物多样性和功能进行分析的分子生物学方法不断完善，其中包括对某一特定基因的荧光定量核酸扩增检测(qPCR)法，对环境中微生物的总DNA进行测序的宏基因组技术等，逐步得到了广泛地应用。宏基因组技术被公认为是目前研究环境微生物群落结构和功能基因最全面、准确的方法，因为它没有特殊的选择性(例如纯培养/富集)，同时也减小了测序技术的偏好性(例如16SrRNA或iTS基因的PCR扩增步骤)。但是，以上这些技术的成功应用都需基于完善的DNA提取和纯化等预处理技术。在自然环境当中，各类微生物(细菌、真菌、放线菌等)往往附着于泥沙、岩石等固体表面上，形成一层致密而薄的细胞层，微生物在其基础上不断生长和繁殖，包埋在由浓稠的胞外化合物所组成的基质中，构成一个功能和结构的整体，称之为生物膜，并依托生物膜进行生长、发育和增殖等生命活动。生物膜并不是均一本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种提取基质附着微生物总DNA的装置，其特征在于：包括控压冲洗装置(2)、负压装置和收集装置(8)，所述控压冲洗装置(2)的出液端口处设有冲洗管路(3)，所述的负压装置包括负压管路和负压泵(9)，所述收集装置(8)分别与负压管路和负压泵(9)相连通，所述的控压冲洗装置(2)用于控制冲洗管路(3)出水水压，所述的负压管路通过负压泵(9)将冲洗管路(3)冲洗微生物附着基质(4)产生的液体抽吸至收集装置(8)。/n

【技术特征摘要】
1.一种提取基质附着微生物总DNA的装置，其特征在于：包括控压冲洗装置(2)、负压装置和收集装置(8)，所述控压冲洗装置(2)的出液端口处设有冲洗管路(3)，所述的负压装置包括负压管路和负压泵(9)，所述收集装置(8)分别与负压管路和负压泵(9)相连通，所述的控压冲洗装置(2)用于控制冲洗管路(3)出水水压，所述的负压管路通过负压泵(9)将冲洗管路(3)冲洗微生物附着基质(4)产生的液体抽吸至收集装置(8)。


2.根据权利要求1所述的提取基质附着微生物总DNA的装置，其特征在于：所述负压泵(9)为防水泵，所述负压管路包括第一负压管路(5)和第二负压管路(6)，所述第一负压管路(5)的一端与控压冲洗装置(2)密封连接，其另一端设置为开放端；所述冲洗管路(3)嵌套在第一负压管路(5)内部，且所述冲洗管路(3)的出水端位于第一负压管路(5)开放端的上部；所述第一负压管路(5)上设置开口并通过所述开口与第二负压管路(6)相连通，所述的第二负压管路(6)与收集装置(8)相连通。


3.根据权利要求2所述的提取基质附着微生物总DNA的装置，其特征在于：所述装置还包括杂质脱除装置(7)，所述的杂质脱除装置(7)分别与第二负压管路(6)和收集装置(8)相连通，所述杂质脱除装置(7)用于去除较大的固体颗粒。


4.根据权利要求3所述的提取基质附着微生物总DNA的装置，其特征在于：所述开放端可连接不同形状的端口以适应不同实际情况的采样需要，所述的冲洗管路(3)可控制冲洗液散射直径为(1～3)±0.3mm。


5.一种提取基质附着微生物总DNA的方法，其特征在于：所述方法利用权利要求1～4任意一项所述的提取基质附着微生物总DNA的装置进行DNA提取...

【专利技术属性】
技术研发人员：李侃，任鑫坤，张徐祥，许柯，王庆，张志超，
申请(专利权)人：南京大学，南京大学宜兴环保研究院，
类型：发明
国别省市：江苏;32