生物标志物的用途制造技术

技术编号:24165781 阅读:18 留言:0更新日期:2020-05-16 01:25
生物标志物的用途,本发明专利技术涉及一种生物标志物,具体来说,是一种痛风肠道微生物标志物,本发明专利技术提供一种如下的技术方案:一种能够结合或者特异性识别生物标志物的配体在制备试剂盒中的用途,所述的生物标志物为:Species层面的:另枝菌属Alistipes Onderdonkii、另枝菌属Alistipes Shahii、单形拟杆菌、死亡梭杆菌;和strain层面的:单形拟杆菌、GCF000210555、GCF000210575和GCF000374505。本发明专利技术的有益效果在于:该发明专利技术提供早期非侵入性诊断痛风疾病状态的方法及生物标志物。根据受检者肠道菌群的不同,可应用于制备痛风治疗药品及平衡肠道菌群微环境稳态。

Use of biomarkers

【技术实现步骤摘要】
生物标志物的用途
本专利技术涉及一种生物标志物,具体来说,是一种痛风肠道微生物标志物,属于生物

技术介绍
痛风是一种体内嘌呤代谢紊乱导致单钠尿酸盐沉积在关节或结缔组织的代谢风湿性疾病,表现为关节的红肿疼痛,严重者可导致痛风石的出现、关节的活动障碍甚至肾脏的损伤。其不仅可造成关节的变形及肾脏的损伤,甚至与高血压、高血脂、冠心病等疾病紧密关联。因此,把握体内嘌呤的代谢显得尤为重要。体内嘌呤有2个来源:1)外源性的,主要是食物;2)内源性的,主要是体内合成。因为外源嘌呤的可控制性,所以在临床中痛风患者预防痛风发作的一个重要手段是饮食的控制。食物的消化吸收器官主要是肠道,其过程是肠道内的微生物将食物分解为单糖,后者被小肠上皮细胞吸收入血。因此,肠道菌群在嘌呤代谢中发挥重要的作用。健康人尿酸的排泄方式主要有两种:70%的尿酸通过肾脏排泄,剩下的30%通过肠道排泄或由肠道菌群分解,因此,原发性痛风可能与肠道菌群密切相关。从痛风的发病机制以及肠道菌群在代谢紊乱中的作用来看,肠道的不平衡可能在痛风的发病过程中起着重要作用。由于对痛风与肠道菌群关系的研究很少,因此分析肠道菌群与痛风发生发展的关系具有重要意义。
技术实现思路
为决绝上述提到的问题本专利技术提供一种如下的技术方案:一种能够结合或者特异性识别生物标志物的配体在制备试剂盒中的用途,所述的生物标志物为:Species层面的:另枝菌属AlistipesOnderdonkii、另枝菌属AlistipesShahii、单形拟杆菌、死亡梭杆菌;和strain层面的:单形拟杆菌、GCF000210555、GCF000210575和GCF000374505。进一步的,所述的试剂盒于根据标志物的丰度变化对个体患痛风概率进行诊断和/或监测。进一步的,对标志物的丰度变化检测通过如下方法实现:(1)提取待检测个体的样本中的标志物;(2)对标志物的丰度和正常对照组的丰度进行比较,根据比较结果确定个体的状态。进一步的,所述的样本是指粪便。本专利技术还提供一种生物标志物或者特异性结合该生物标志物的抗体或者抗体片段在准备1)用于治疗痛风的药物;2)用于预防或者缓解痛风的功能性食品的用途;所述的生物标志物为:Species层面的:另枝菌属AlistipesOnderdonkii、另枝菌属AlistipesShahii、单形拟杆菌、死亡梭杆菌;和strain层面的:单形拟杆菌、GCF000210555、GCF000210575和GCF000374505。本专利技术还提供一种能结合或者特异性识别生物标志物的配体在制备试剂盒的用途,所述的试剂盒用于监测治疗痛风过程中使用的药物或者治疗方法的有效性,包括有检测和/或量化来自患者样本中所述的标志物,所述的标志物是Species层面的:另枝菌属AlistipesOnderdonkii、另枝菌属AlistipesShahii、单形拟杆菌、死亡梭杆菌;和strain层面的:单形拟杆菌、GCF000210555、GCF000210575和GCF000374505。本专利技术还在于一种益生菌微囊,所述的益生菌微囊用于调节痛风患者体内如下的标志物:Species层面的:另枝菌属AlistipesOnderdonkii、另枝菌属AlistipesShahii、单形拟杆菌、死亡梭杆菌;和strain层面的:单形拟杆菌、GCF000210555、GCF000210575和GCF000374505。本专利技术的有益效果在于:该专利技术提供早期非侵入性诊断痛风疾病状态的方法及生物标志物。根据受检者肠道菌群的不同,可应用于制备痛风治疗药品及平衡肠道菌群微环境稳态。附图说明图1为各样本中AlistipesOnderdonkii的丰度;图2为Gout和HC组中AlistipesOnderdonkii的差异比较;图3为各样本中AlistipesShahii的丰度;图4为Gout组和HC组中AlistipesShahii的差异比较;图5为各样本中Bacteroidesuniformis的丰度;图6为Gout组和HC组中Bacteroidesuniformis的差异比较;图7为各样本中Fusobacteriummortiferum的丰度;图8为Gout组和HC组中Fusobacteriummortiferum的差异比;图9为各样本中Bacteroidesuniformis的丰度;图10为Gout组和HC组中Bacteroidesuniformis的差异比较;图11为各样本中GCF000210555的丰度;图12为Gout组和HC组中GCF000210555的差异比较;图13为各样本中GCF000210575的丰度;图14为Gout组和HC组中GCF000210575的差异比较图15为各样本中GCF000210505的丰度;图16为Gout组和HC组中GCF000210505的差异比较。具体实施方式实施例1痛风患者和健康对照者肠道菌群差异物种分析采用的分析方法如下:1.测序数据的获取1.1样本收集和DNA提取样本收集需要器械包括:坐便器、粪便样本采集器;收集痛风患者的新鲜粪便样品,置于4℃冰盒中2小时内输送至实验室分装到EP管中,每份200mg/份,共5份,立即-80℃冰箱冷冻保存。利用市面在售粪便微生物DNA提取试剂盒,按照说明书步骤提取微生物DNA,-80℃保存。1.2构建文库及测序DNA建库按仪器制造商(Illuminate)的16SrRNA基因扩增子测序操作指南进行。利用琼脂糖凝胶电泳检测DNA的纯度和浓,取适量的样品于离心管中,使用无菌水稀释样品至1ng/μl,以稀释后的基因组DNA为模板,选取带有Barcode的细菌16SrRNA基因高可变区V4区特异性引物(515F,5’-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3’,and806R,5’-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3’),NewEnglandBiolabs公司的High-FidelityPCRMasterMixwithGCBuffer,和高效高保真酶进行PCR;PCR产物使用2%浓度的琼脂糖凝胶进行电泳检测;根据PCR产物浓度进行等量混样,充分混匀后使用2%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物,对目的条带使用qiagen公司提供的胶回收试剂盒回收产物。使用DNAPCR-FreeSamplePreparationKit建库试剂盒进行文库构建,构建好的文库经过Qubit和Q-PCR定量,文库合格后,使用HiSeq2500PE250进行上机测序。2.生物标志物的鉴定2.1测序数据的基本处理利用扩增子测序技术进行测序,得到高质量读段(reads)根据本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种能够结合或者特异性识别生物标志物的配体在制备试剂盒中的用途,其特征在于,所述的生物标志物为:/nSpecies层面的:另枝菌属Alistipes Onderdonkii、另枝菌属Alistipes Shahii、单形拟杆菌、死亡梭杆菌;和/nstrain层面的:单形拟杆菌、GCF000210555、GCF000210575和GCF000374505。/n

【技术特征摘要】
20191125 CN 20191116512101.一种能够结合或者特异性识别生物标志物的配体在制备试剂盒中的用途,其特征在于,所述的生物标志物为:
Species层面的:另枝菌属AlistipesOnderdonkii、另枝菌属AlistipesShahii、单形拟杆菌、死亡梭杆菌;和
strain层面的:单形拟杆菌、GCF000210555、GCF000210575和GCF000374505。


2.如权利要求1所述的能够结合或者特异性识别生物标志物的配体在制备试剂盒中的用途,其特征在于,所述的试剂盒于根据标志物的丰度变化对个体患痛风概率进行诊断和/或监测。


3.如权利要求2所述的能够结合或者特异性识别生物标志物的配体在制备试剂盒中的用途,其特征在于,对标志物的丰度变化检测通过如下方法实现:
(1)提取待检测个体的样本中的标志物;
(2)对标志物的丰度和正常对照组的丰度进行比较,根据比较结果确定个体的状态。


4.如权利要求3所述的能够结合或者特异性识别生物标志物的配体在制备试剂盒中的用途,其特征在于,所述的样本是指粪便。


5.一种生物标志物或者特异性结合该生物标志物的抗体或者抗体片段在准备1)用于治疗痛风的...

【专利技术属性】
技术研发人员:杜予和
申请(专利权)人:广州丹晨医疗科技有限公司
类型:发明
国别省市:广东;44

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