【技术实现步骤摘要】
基于PCR和RPA检测紫云英矮缩病毒的引物组、试剂盒及方法
本专利技术涉及植物病毒生物检测
,具体涉及一种基于PCR和RPA检测紫云英矮缩病毒的引物组、试剂盒及方法。
技术介绍
紫云英矮缩病毒(Milkvetchdwarfvirus,MDV)是矮缩病毒属的一种病毒,是一种重要的单链DNA(Single-strandDNA,ssDNA)病毒。该病毒会引起豆类植物褪绿、矮缩、叶片卷曲。它的基因组由8个环状单链DNA组成,每个基因组份长度约1kb,仅包含一个潜在的开放阅读框。该病毒所有DNA组分均具有一个由29~34个碱基组成的区域,能够形成茎环结构,该结构与其他矮缩病毒属病毒,双生病毒属病毒和猪圆环病毒(Porcinecircovirus,PCV)的基因组组分具有的对应的茎环结构一致。1968年在日本从黄芪中首次发现并报道MDV。中国最早在云南蚕豆(ViciafabaL.)上发现了MDV。此后,2014~2017年间,安徽省、浙江省和上海等地发现该病毒可侵染豇豆(VignaunguiculataL.Walp)和蚕豆(V.f ...
【技术保护点】
1.一种同时适用于PCR和RPA扩增方式检测紫云英矮缩病毒的引物组,其特征在于,所述引物组由正向引物和反向引物组成,其中,/n所述正向引物MDV-CPF1的序列为:5′-GTGAAGCGAATCTGACGGAA-3′;/n所述反向引物MDV-CPR1的序列为:5′-CATAACCTTCTTCATCTTATA-3′。/n
【技术特征摘要】
1.一种同时适用于PCR和RPA扩增方式检测紫云英矮缩病毒的引物组,其特征在于,所述引物组由正向引物和反向引物组成,其中,
所述正向引物MDV-CPF1的序列为:5′-GTGAAGCGAATCTGACGGAA-3′;
所述反向引物MDV-CPR1的序列为:5′-CATAACCTTCTTCATCTTATA-3′。
2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述正向引物MDV-CPF1的5′端修饰有Biotin,所述反向引物MDV-CPR1的5′端修饰有FITC;或所述正向引物MDV-CPF1的5′端修饰有FITC,所述反向引物MDV-CPR1的5′端修饰有Biotin。
3.一种基于PCR或RPA扩增方式检测紫云英矮缩病毒的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1或2所述的引物组。
4.如权利要求1或2所述的引物组在用于检测待测生物样本中是否含有紫云英矮缩病毒,或制备用于检测待测生物样本中是否含有紫云英矮缩病毒的试剂盒中的应用。
5.如权利要求3所述的试剂盒在用于检测待测生物样本中是否含有紫云英矮缩病毒中的应用。
6.一种基于PCR或RPA扩增方式检测紫云英矮缩病毒的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)提取待测生物样本的总DNA,或对植物样本进行裂解处理;
2)以步骤1)提取的总DNA或植物裂解液为模板,采用权利要求1或2所述的引物组进行PCR或RPA扩增,若扩增产物中含有407bp的DNA片段,则待测生物样本中含有紫云英矮缩病毒,若扩增产物中不含有407bp的DNA片段,则...
【专利技术属性】
技术研发人员:宋雪梅,曹宇浩,郑红英,严丹侃,吴昕扬,燕飞,陈剑平,
申请(专利权)人:宁波大学,
类型:发明
国别省市:浙江;33
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