一种比率型ctDNA定量检测方法技术

技术编号:24076271 阅读:44 留言:0更新日期:2020-05-09 02:49
本案涉及一种比率型ctDNA定量检测方法,其设计了一段与目标ctDNA互补的模板序列,其可与目标序列互补配对进而在聚合酶和内切酶的联合作用下发生链置换聚合反应,产生可以使荧光信号变化的辅助DNA序列;为了构建基于ctDNA的荧光比率传感器,特殊设计了三种具有不同修饰的颈环结构DNA序列,在辅助DNA序列的协助下,成功实现两种荧光信号强度的反向转变,通过对荧光光谱进行分析处理,得出比率信号,从而实现对ctDNA的超灵敏定量检测。本案的检测方法灵敏度高、特异性好、对人员和设备要求低,检测方便快捷。

A quantitative detection method of ratio ctDNA

【技术实现步骤摘要】
一种比率型ctDNA定量检测方法
本专利技术涉及循环肿瘤DNA(circulatingtumorDNA,ctDNA)定量检测领域,特别涉及一种比率型ctDNA定量检测方法。
技术介绍
循环肿瘤DNA是体液中全部游离循环DNA(cell-freeDNA,cfDNA)的一种,是由肿瘤细胞释放并且携带有肿瘤特征性遗传学改变的自由基因组片段,而这些遗传学的改变与肿瘤的发生发展以及复发转移等密切相关,是癌症散落在血液中的信息密码,对于肿瘤的诊断、治疗以及预后评估具有重要价值。传统的ctDNA检测手段包括Northern印迹杂交法、微阵列分析法、流式细胞术和聚合酶链式反应(PCR)等。尽管这些方法具有较好的准确性,但是在实际应该中还存在对待测样本需求量大、灵敏度低、特异性差、对人员和设备要求高等缺点,因此发展高灵敏度且方便快捷的ctDNA分析方法是非常迫切的。
技术实现思路
针对现有技术中的不足之处,本专利技术提供了一种比率型ctDNA定量检测方法。本专利技术的技术方案如下:一种比率型ctDNA定量检测方法,包括:...

【技术保护点】
1.一种用于非疾病诊断的比率型ctDNA定量检测方法,其特征在于,包括:/n1)设计一段与待测的目标ctDNA互补的模板序列,其中,该模板序列能够与目标ctDNA互补配对,并进而能够在聚合酶和内切酶的联合作用下发生链置换聚合反应,产生辅助DNA序列;/n2)设计三段颈环结构DNA序列:FWJ1、FWJ2和FWJ3;其中,FWJ1末端修饰有第一荧光基团,FWJ2末端修饰有第一淬灭基团,FWJ3末端同时修饰有第二荧光基团和第二淬灭基团;/n3)将三段颈环结构DNA序列与辅助DNA序列混合,在辅助DNA序列的协助下,能够实现两种荧光信号强度的反向转变,通过对荧光光谱进行分析处理,得出比率信号,从而实...

【技术特征摘要】
1.一种用于非疾病诊断的比率型ctDNA定量检测方法,其特征在于,包括:
1)设计一段与待测的目标ctDNA互补的模板序列,其中,该模板序列能够与目标ctDNA互补配对,并进而能够在聚合酶和内切酶的联合作用下发生链置换聚合反应,产生辅助DNA序列;
2)设计三段颈环结构DNA序列:FWJ1、FWJ2和FWJ3;其中,FWJ1末端修饰有第一荧光基团,FWJ2末端修饰有第一淬灭基团,FWJ3末端同时修饰有第二荧光基团和第二淬灭基团;
3)将三段颈环结构DNA序列与辅助DNA序列混合,在辅助DNA序列的协助下,能够实现两种荧光信号强度的反向转变,通过对荧光光谱进行分析处理,得出比率信号,从而实现对目标ctDNA的定量检测。


2.根据权利要求1所述的比率型ctDNA定量检测方法,其特征在于,所述目标ctDNA的序列为:GTTGGAGCTAGTGGCGTAG。


3...

【专利技术属性】
技术研发人员:缪鹏马筱一
申请(专利权)人:济南国科医工科技发展有限公司天津国科医工科技发展有限公司
类型:发明
国别省市:山东;37

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