产生复数候选探针和鉴定哺乳动物中细胞类型的方法技术

本发明专利技术提供了一种产生复数候选探针的方法和其使用方法。具体而言，候选探针可以与特定基因结合，并且进一步鉴定组织中细胞的类型。简而言之，上述方法包含以下步骤：(a)使用芯片侦测具有已知器官来源的正常样本中的基因表现；(b)使用处理模块比较正常样本中的基因表现；以及(c)依据前述步骤的比较结果产生候选探针。而使用方法为鉴定哺乳动物中细胞类型的方法，其包含以下步骤：(a’)使用前述候选探针以侦测具有未知细胞类型的测试样本中相对应的基因表现；(b’)使用处理模块分析测试样本以产生代表测试样本分数；以及(c’)进一步预测测试样本的细胞类型。此外，本揭露还提供一个系统用以执行前述的方法，并且该系统包含一个具有候选探针的矩阵的侦测芯片和一个处理模块。

Production of multiple candidate probes and identification of cell types in mammals

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】产生复数候选探针和鉴定哺乳动物中细胞类型的方法
本专利技术涉及一种产生复数候选探针的方法和鉴定哺乳动物中细胞类型的方法。更具体地说，一种用来鉴定细胞类型是属于正常/良性瘤细胞、原位癌细胞或是转移癌细胞的方法。
技术介绍
癌症逐渐已成为全球主要的死亡原因，并且在过去的数十年间平均每年夺走数了百万人的生命。(FerlayJetal2015)。癌症的治疗过程通常是昂贵、漫长和痛苦的。当癌症药物开发仍受到许多国家政府的严格监管的状态下，许多新的治疗方法正在积极的被推广，例如：标靶治疗和免疫疗法。病理解剖诊断是一项主观且传统的过程，其涉及利用显微镜检查活检切片。病理学家对活组织检查的形态学的解释是基于其对于特定类型癌症的知识和经验。(ConnollyJLetal,2003)而此过程被认为是癌症诊断的黄金标准，因为自从大约一个世纪前首次被引入后，没有任何其他更佳的技术被使用。由于上述过程具有主观的性质，在某些情况下不同病理学家检验活组织而产生差异结果的状况并不令人惊讶。通过解剖病理学对癌症诊断的准确性的系统研究揭示了全世界各种医学机构中存在显著的差本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种产生复数候选探针的方法，用于辨识哺乳动物中细胞类型的方法，其特征在于，其包含：/n步骤(a)通过侦测芯片从所述哺乳动物的标准样本中产生复数基因表现；/n步骤(b)通过处理模块比较所述复数基因表现以产生比较结果；以及/n步骤(c)根据所述比较结果转化出包含所述复数候选探针的矩阵，其中所述复数候选探针可以结合至任一复数多核苷酸序列选自SEQ ID No：1～652或SEQ ID No：1～652的任一片段，/n其中，所述侦测芯片与所述处理模块彼此电讯连接。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170717 US 62/533,1451.一种产生复数候选探针的方法，用于辨识哺乳动物中细胞类型的方法，其特征在于，其包含：
步骤(a)通过侦测芯片从所述哺乳动物的标准样本中产生复数基因表现；
步骤(b)通过处理模块比较所述复数基因表现以产生比较结果；以及
步骤(c)根据所述比较结果转化出包含所述复数候选探针的矩阵，其中所述复数候选探针可以结合至任一复数多核苷酸序列选自SEQIDNo：1～652或SEQIDNo：1～652的任一片段，
其中，所述侦测芯片与所述处理模块彼此电讯连接。


2.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，所述复数候选探针的数量为200个。


3.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，所述复数候选探针的数量为100个。


4.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，所述复数候选探针的数量为50～60个。


5.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，所述复数候选探针的数量为25～35个。


6.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，所述复数探针的长度为至少15个核苷酸。


7.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，所述标准样本是一个被诊断为不患有特定疾病、失调、基因症状或上述任意的组合。


8.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，所述标准样本是一个被诊断为患有特定疾病、失调、基因症状或上述任意的组合。


9.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，所述标准样本包含血液、血浆、血清、尿液、组织、细胞、器官、体液或上述任意的组合。


10.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，所述步骤(b)不包含将所述标准样本中的所述复数基因表现与一个被诊断为患有特定疾病、失调、基因症状或上述任意的组合的受试者异常样本中的复数基因表现进行比较。


11.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，在所述步骤(c)中产生所述矩阵的方法包含：皮尔生相关系数、斯皮尔曼等级相关系数、肯德尔等级相关系数、K平均、马哈兰距离、汉明距离、莱文斯坦距离、欧几里得距离或上述任意的组合。


12.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法，其特征在于：其中，所述步骤(c)还包含：
步骤(c1)分析所述复数候选探针的特定序列与所述任一复数多核苷酸序列选自SEQIDNo：1～652或SEQIDNo：1～652的任一片段的表现量之间的相关性因子。


13.如权利要求12所述的产生复数候选探针的方法，其...

【专利技术属性】
技术研发人员：黄培瑛，
申请(专利权)人：茂英基因科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：中国台湾;71