特定凝集素组合构建基于唾液糖蛋白糖链鉴别小细胞肺癌测试工具的应用制造技术

技术编号:23894814 阅读:17 留言:0更新日期:2020-04-22 08:00
本申请提供了一种特定凝集素组合构建基于唾液糖蛋白糖链鉴别小细胞肺癌(SCLC)测试工具的应用。所述特定凝集素组合选自WGA、HHL这两种凝集素;小细胞肺癌(SCLC)样本与肺腺癌(ADC)、肺鳞癌(SCC)样本相比,该特定凝集素组合呈显著差异性表达。并且,建立了模型:

【技术实现步骤摘要】
特定凝集素组合构建基于唾液糖蛋白糖链鉴别小细胞肺癌测试工具的应用
本专利技术涉及一种特定凝集素组合构建基于唾液糖蛋白糖链鉴别小细胞肺癌测试工具的应用。
技术介绍
根据国际癌症研究中心(IARC)的《2018全球癌症统计数据》,全世界有五分之一的男性和六分之一的女性在其一生中会罹患癌症,且八分之一的男性和十一分之一的女性死于这种疾病。这份报告对全球185个国家36种癌症的发病率和死亡率进行了估算。报告显示,今年新发病例将达到1810万,死亡人数将达到960万。四年前新增病例与死亡人数分别为1410万和820万。肺癌是造成男性和女性死亡的主要原因之一,其中北美、北欧和西欧等地区以及中国、澳大利亚和新西兰等国家女性肺癌发病率最高。原发性支气管肺癌,简称肺癌,是起源于支气管粘膜或腺体的恶性肿瘤。目前在全世界范围内因恶性肿瘤引起的死亡中,肺癌最为常见。而且,它的发生率正在以约5%的速度逐年增加,预计到2020年,因肺癌而死亡的人数将达到恶性肿瘤引起的总死亡人数的50%。肺癌已经成为全世界各个国家亟待解决的重大健康问题和社会问题,在发展中国家尤甚。在2010年进行的全国性抽样调查显示,肺癌的死亡率已升高为30.83/10万,其中,男性为41.34/10万,女性为19.84/10万,肺癌死亡人数占肿瘤相关的总死亡人数已达到22.70%,居第1位,值得指出的是,在我国城市人口中,肺癌的死亡率为40.98/10万,居首位,且明显高于农村地区(26.93/10万)。根据肺癌的分化程度、形态特征和生物学特点,目前将大多数肺癌分成两大类:非小细胞肺癌(non-small-celllungcancer,NSCLC)和小细胞肺癌(small-celllungcancer,SCLC)。前者主要包括腺癌(ADC)和鳞状细胞癌(简称鳞癌,SCC)。其中,ADC发病率最高,约占肺癌的50%;SCC为曾经最为常见的肺癌类型,现约占肺癌的1/3,而小细胞肺癌仅占肺癌的15%。虽然,近年来肺癌的治疗方面已取得了长足的进步,但从总体上来说,肺癌的预后情况仍旧很不理想,非小细胞肺癌和小细胞肺癌的5年生存率仅分别为14%和4%。引起这一情况的主要原因是由于肺癌起病隐匿,早期通常无明显症状,大多数肺癌患者在确诊时已处于进展期,失去了手术治愈的机会。因此,肺癌的早期筛查和诊断对于提高肺癌患者的生存率、延长患者的生存期,都是至关重要的。糖基化是最普遍的蛋白质翻译后修饰之一,研究发现约一半以上的哺乳动物蛋白质都发生了糖基化。糖基化作为一种重要的翻译后修饰,可以影响蛋白质的溶解度、折叠、定位及构象的维持,调节蛋白质的功能和降解;还可以介导分子与分子之间、分子与细胞之间、细胞与细胞之间的相互作用。大量研究表明,蛋白质糖基化,作为重要的翻译后修饰,在肿瘤发生、浸润、转移的过程中会发生改变并有相应的功能性作用。糖基化修饰的改变主要包括两个方面:1)多肽链上糖基化结合位点的改变;2)寡糖链结构的改变。因此,差异性表达的蛋白质糖基化亚型可以成为新型肿瘤标记物,用于肿瘤的早期诊断,还可以成为肿瘤生物靶向治疗的新靶点。随着现今科学技术的发展,检测技术的多样性和灵敏度不断提高,近些年来,唾液作为临床样本已被广泛应用于多种疾病诸如艾滋病、自身免疫性疾病、酒精性肝硬变、囊性纤维病、糖尿病、心血管病、龋病等疾病的药物水平监测、病情监控和疗效评价当中。文献和申请人以往的研究工作表明唾液中含有丰富的N-连接糖蛋白和O-连接糖蛋白,而唾液蛋白糖基化的改变与疾病的发生发展具有较高的关联性。从变化的唾液糖蛋白糖链中可以找到与疾病相关的生物标志物以用于检测,而基于唾液检测的新技术和新方法也会逐渐成为今后非侵袭性临床诊断发展的一个方向。有必要指出的是,虽然已有研究基于血清样本糖蛋白糖链鉴别肺癌及其分型和分期的方案,血液中的一些因子能够随体液循环到达唾液腺,或随唾液分泌进入口腔或导致唾液中的基因转录谱发生改变,引起某些蛋白质的丰度或种类改变,从而反映出血液中部分蛋白质水平的变化。但目前研究发现,人唾液中有1939种蛋白质,人血浆中有3020种蛋白质,仅有27%的唾液蛋白质组与血浆蛋白质组重合。血浆蛋白质组学发现的177个与心血管疾病相关的潜在生物标志物的蛋白质中,也仅有40%的蛋白质出现在唾液蛋白质组中;在已列出的1058个潜在癌症相关生物标志物的蛋白质中,仅有34%的蛋白质出现在唾液蛋白质组中。这表明许多血液循环中的生物标志物并非能够在唾液中得到鉴定。另外,即使是同一种蛋白,较之于血清,其在唾液中的含量通常明显较低。所以在实践中,两者没有必然的联系,往往需要研究人员经过大量的实验和分析,才能判断是否有蛋白质组重合的可能性。凝集素芯片是通过固定于芯片上的凝集素探针与样品中糖蛋白糖链特异性结合,可以高通量地检测出样品中糖蛋白糖链结构和连接方式的变化,是研究糖蛋白糖链结构变化最有效的分析工具之一,其有助于发展新的诊断和监测疾病方法。二元Logistic逐步回归分析及ROC曲线分析(receiveroperatingcharacteristiccurve)早先多见于农业统计分析和财务管理等方面,目前也有见于疾病诊断方向。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种无损伤取样的快速、准确鉴别小细胞肺癌的方案。本申请通过大量的实验和分析,最终确立了针对唾液样本的特定凝集素组合能够用来确定受试的肺癌患者具体类型是否为小细胞肺癌(SCLC);并且,构建了小细胞肺癌(SCLC)的诊断模型,通过ROC曲线分析评估其诊断能力。总结应用方案如下:第一方面,特定凝集素组合构建基于唾液糖蛋白糖链鉴别小细胞肺癌(SCLC)测试工具的应用。所述特定凝集素组合选自WGA、HHL这两种凝集素;小细胞肺癌(SCLC)样本与肺腺癌(ADC)、肺鳞癌(SCC)样本相比,该特定凝集素组合呈显著差异性表达。具体可以参考表2-表4。上述测试工具可以是凝集素芯片、试剂盒或凝集素检测智能终端。第二方面,一种用于基于唾液糖蛋白糖链鉴别小细胞肺癌的智能终端。其包括处理器和程序存储器,所述程序存储器存储的程序被处理器加载时执行以下步骤:获取唾液样本的凝集素测试结果,所述凝集素测试结果体现凝集素WGA和HHL对应的糖蛋白糖链的表达水平;根据所述凝集素测试结果,计算以下模型SCLC(ModelSCLC)的检测值;将计算得到的检测值输出显示,并提示鉴别结论;若检测值≤0.784,则表明唾液样本所属主体为SCLC患者,反之检测值>0.784,则为其它肺部疾病患者(ADC、SCC或COPD患者)。这里所说的“提示鉴别结论”,可以是直接输出是否患小细胞肺癌的结论,也可以仅给出检测值、参考值和鉴别依据,或者二者兼有。上述智能终端的具体形式可以是专门的自助终端设备,也可以是普通用户常用的手机、平板电脑等。第三方面,一种人机交互设备,包括显示屏,所述人机交互设备运行时显示屏依次显示以下界面:唾液样本的凝集素测试结果的输入界面;所述凝集素测本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.特定凝集素组合构建基于唾液糖蛋白糖链鉴别小细胞肺癌(SCLC)测试工具的应用,其特征在于:所述特定凝集素组合选自WGA、HHL这两种凝集素;小细胞肺癌(SCLC)样本与肺腺癌(ADC)、肺鳞癌(SCC)样本相比,该特定凝集素组合呈显著差异性表达。/n

【技术特征摘要】
1.特定凝集素组合构建基于唾液糖蛋白糖链鉴别小细胞肺癌(SCLC)测试工具的应用,其特征在于:所述特定凝集素组合选自WGA、HHL这两种凝集素;小细胞肺癌(SCLC)样本与肺腺癌(ADC)、肺鳞癌(SCC)样本相比,该特定凝集素组合呈显著差异性表达。


2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述测试工具为凝集素芯片、试剂盒或凝集素检测智能终端。


3.一种用于基于唾液糖蛋白糖链鉴别小细胞肺癌的智能终端,包括处理器和程序存储器,其特征在于:所述程序存储器存储的程序被处理器加载时执行以下步骤:
获取唾液样本的凝集素测试结果,所述凝集素测试结果体现凝集素WGA和HHL对应的糖蛋白糖链的表达水平;
根据所述凝集素测试结果,计算以下模型SCLC(ModelSCLC)的检测值;



将计算得到的检测值输出显示,并提示鉴别结论;若检测值≤0.784,则表明唾液样本所属主体为SCLC患者,反之检测值>0.784,则为其它肺部疾病患者。


4.一种人机交互设备,包括显示屏,其特征在于:所述人机交互...

【专利技术属性】
技术研发人员:李铮张帆于汉杰唐振舒健
申请(专利权)人:深圳格道糖生物技术有限公司
类型:发明
国别省市:广东;44

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