用于诊断和治疗炎性肠病的方法技术

技术编号:23164645 阅读:33 留言:0更新日期:2020-01-21 22:34
本文描述了用于在患有炎性肠病(IBD)的受试者中测试生物标志物的方法和材料。这种检测可用于诊断和治疗溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩氏病(CD),它们是否则难以区分的两种形式的IBD。所述方法包括测量在UC和CD患者中差异表达的几种生物标志物(包括HD5或MMP‑7)中一种或多种的水平。治疗可基于受试者患有溃疡性结肠炎还是克罗恩氏病的确定。

Methods for diagnosis and treatment of inflammatory bowel disease

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于诊断和治疗炎性肠病的方法相关申请的交叉参考本申请引用了2017年3月23日提交的美国专利申请第62/475506号(目前待决)的优先权,其内容通过参考以其全部结合至本文中。关于联邦政府赞助的研究或开发的声明本专利技术在NationalInstituteofHealth授予的资助号R21DK095186、U54CA091408-09S1、U54CA091408-09S2、U54RR026140、U54MD007593、UL1RR024975、UL1TR000445、G12MD007586、U54CA163069、R24DA036420和S10RR0254970下,在政府支持下进行。政府拥有本专利技术的某些权利。在这种情况下,“政府”是指美利坚合众国政府。公开背景炎性肠病(“IBD”)为全部或部分消化道的慢性复发性炎症。IBD有两种类型,即溃疡性结肠炎(“UC”)和克罗恩氏病(“CD”)。仅涉及结肠的克罗恩氏病称为克罗恩结肠炎(“CC”)。当对UC或CC的标准已建立了非确定性评估时,将其标记为“未定型结肠炎(IC)”。UC导致结肠和直肠的粘膜和在较小程度上粘膜下层衬里的炎症和溃疡。CC与UC的不同之处在于,CC可能导致在所有4个结肠层内更深的炎症(透壁性炎症和跳跃性病变)。此外,CC还可能通过成瘘影响其他器官。UC和CD仅在美国就影响估计200万人,相关的年度健康护理费用超过68亿美元。尽管UC和CD两者均为IBD的类型,但UC或CD患者之间的差异具有重要意义。目前,临床医师为了诊断CD和UC而对IBD患者使用不准确的组合分类(包括临床、内窥镜检查、放射学和组织病理学)。尽管如此,在患有IBD的患者中区分UC或CD患者仍然具有挑战性,以至于难以归类为UC或CD的IBD患者的病例被归类为未定型结肠炎(“IC”)。尽管使用了应用临床、内窥镜检查、放射学和组织学工具的最先进分类系统,但仍有IBD患者的显著亚组被误诊或延迟了正确诊断。实际上,据估计30%患有IBD的患者目前无法准确诊断为CD或UC。另外,在经受回肠贮袋肛门吻合术的结肠IDB病例中有15%被诊断为UC,随后将基于其术后随访、临床和组织病理学改变以及回肠贮袋中新生CD的发展将其初始诊断改为CD。回肠贮袋肛门吻合术为一种通常适合于UC但不适合于CD的治疗,在手术切除结肠和直肠之后恢复胃肠道的连续性,并涉及创建小肠贮袋以重建切除的直肠。区分UC和CD病例的意义包括选择医学治疗、手术时机、预后、是否为患者提供回肠贮袋肛门吻合术以及生活方式期望。由于这些原因,需要改进患有IBD的受试者的诊断和随后治疗。概述已经发现潘氏细胞分泌的DEFA5(也称为HD5)用作用于确定患有IBD的患者是否患有UC或CD的生物标志物。在第一方面,公开了一种在患有IBD或处于其风险下的患者中测量DEFA5(HD5)的方法,所述方法包括:从患者获得样品;和测量样品中DEFA5(HD5)的表达和DEFA5(HD5)的浓度中的至少一种。在第二方面,公开了一种治疗患有IBD或处于其风险下的患者的方法,所述方法包括:从患者获得样品;测量样品中DEFA5(HD5)的表达和DEFA5(HD5)的浓度中的至少一种;和对患者进行干预以治疗克罗恩氏病和溃疡性结肠炎中的一种。在第三方面,公开了一种在患有IBD或处于其风险下的患者中测量MMP-7的方法,所述方法包括:从患者获得样品;和测量样品中MMP-7的表达和MMP-7的浓度中的至少一种。在第四方面,公开了一种治疗患有IBD或处于其风险下的患者的方法,所述方法包括:从患者获得样品;测量样品中MMP-7的表达和MMP-7的浓度中的至少一种;和对患者进行干预以治疗克罗恩氏病和溃疡性结肠炎中的一种。在第五方面,公开了一种在患有IBD或处于其风险下的患者中测量生物标志物的方法,所述方法包括:从患者获得样品;测量样品中DEFA5(HD5)的表达和DEFA5(HD5)的浓度中的至少一种;和测量样品中MMP-7的表达和MMP-7的浓度中的至少一种。在第六方面,公开了一种治疗患有IBD或处于其风险下的患者的方法,所述方法包括:从患者获得样品;测量样品中DEFA5(HD5)的表达和DEFA5(HD5)的浓度中的至少一种;测量样品中MMP-7的表达和MMP-7的浓度中的至少一种;和对患者进行干预以治疗克罗恩氏病和溃疡性结肠炎中的一种。在第七方面,公开了一种用于测量样品中的DEFA5(HD5)和MMP-7的试剂盒,试剂盒包含:用于测量样品中的人类DEFA5(HD5)的表达和人类DEFA5(HD5)的浓度中的至少一种的第一测定;和用于测量样品中的人类MMP-7的表达和人类MMP-7的浓度中的至少一种的第二测定。在第八方面,公开了一种在患有炎性肠病(IBD)或处于其风险下的患者中测量生物标志物的方法,所述方法包括:从患者获得样品;和测量其中的生物标志物的水平,生物标志物的水平选自:生物标志物的表达、生物标志物的活性和生物标志物的浓度;其中所述生物标志物选自表1。以上方法可包括:如果DEFA5(HD5)浓度或DEFA5(HD5)表达的水平大于给定的阈值水平,则将患者诊断为患有CD;如果DEFA5(HD5)浓度或DEFA5(HD5)表达的水平低于阈值水平,则将患者诊断为患有UC;或两者。以上方法可包括:如果MMP-7浓度或MMP-7表达的水平低于给定的阈值水平,则将患者诊断为患有CD;如果MMP-7浓度或MMP-7表达的水平高于阈值水平,则将患者诊断为患有UC;或两者。以上呈现简化的概述,以便提供所要求保护的主题的一些方面的基本理解。此概述不是广泛的综述。其并非旨在标识关键或重要的要素或者描绘所要求保护的主题的范围。其唯一目的是以简化的形式呈现概念,作为稍后呈现的更详细描述的序言。附图简述图1A和1B说明本专利技术测定方法的实施方案的新诊断与先前提供的身体诊断的比较。图2A-H显示CC和UC受试者的DEFA5(HD5)的差异表达和浓度。2A为显示与中度CC相比较,患有中度UC的受试者的DEFA5(HD5)的转录水平的条形图。2B为憩室炎、UC和CC受试者的DEFA5(HD5)水平的蛋白质印迹分析。2C为量化蛋白质印迹DEFA5(HD5)水平的散点图。2D-G为分别来自对照、憩室炎、UC和CC受试者的DEFA5(HD5)组织样品的组织学染色。2H为显示与对照相比较,量化UC和CC受试者的DEFA5(HD5)染色计数的条形图。图3为显示与CC受试者相比较,在UC受试者中差异表达的MMP-7的条形图。图4为憩室炎、UC和CC受试者的MMP-7水平的蛋白质印迹分析。图5为量化图4的蛋白质印迹MMP-7水平的绘图。图6A-G显示一系列量化和比较对照、憩室炎、UC和CC受试者的蛋白质印迹DEFA5(HD5)和MMP-7水平的绘图。6A=憩室炎,6B=轻度UC,6C=中度UC,6D=重度UC,6E=轻度CC,6F=中度CC,和6G=重度CC。图本文档来自技高网...

【技术保护点】
1. 一种在患有炎性肠病(IBD)或处于其风险下的患者中测量HD5的方法,所述方法包括:/n从所述患者获得样品;和/n测量所述样品中HD5的表达和HD5的浓度中的至少一种。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170323 US 62/4755061.一种在患有炎性肠病(IBD)或处于其风险下的患者中测量HD5的方法,所述方法包括:
从所述患者获得样品;和
测量所述样品中HD5的表达和HD5的浓度中的至少一种。


2.一种治疗患有炎性肠病(IBD)或处于其风险下的患者的方法,所述方法包括:
进行根据权利要求1在所述患者中测量HD5的方法;和
对所述患者进行干预以治疗克罗恩氏病。


3.权利要求1的方法,包括:将所述样品中HD5的表达或HD5的浓度与未患克罗恩氏病的受试者典型的基准值进行比较;和如果所述样品中HD5的表达或HD5的浓度明显超过基准值,则诊断为克罗恩氏病。


4.权利要求2的方法,包括:将所述样品中HD5的表达或HD5的浓度与未患克罗恩氏病的受试者典型的基准值进行比较;和如果所述样品中HD5的表达或HD5的浓度明显超过基准值,则诊断为克罗恩氏病。


5.权利要求1-4中任何一项的方法,其中所述样品中HD5的表达或HD5的浓度超过未患克罗恩氏病的受试者典型的基准值。


6.权利要求1-4中任何一项的方法,其中所述样品中HD5的表达被测量为来自未患克罗恩氏病的受试者的对照样品的至少约31倍。


7.权利要求1-4中任何一项的方法,其中所述样品中HD5的表达被测量为来自未患克罗恩氏病的受试者的对照样品的至少约118倍。


8.权利要求1-4中任何一项的方法,其中HD5的表达被测量为每10ngRNA大于约106个HD5mRNA转录物。


9.权利要求1-4中任何一项的方法,其中所述样品为肠组织,并且包括通过以下方法测量HD5的浓度:用抗HD5免疫染色剂对所述样品进行免疫染色;和测量所述样品中染色阳性的细胞百分比;其中所述样品中染色阳性的细胞百分比为至少20%。


10.权利要求2-4中任何一项的方法,其中所述干预对于治疗溃疡性结肠炎无效。


11.权利要求2-4中任何一项的方法,其中所述干预为给予药物,不包括手术。


12.权利要求2-4中任何一项的方法,其中所述干预为给予选自以下的药物:维生素补充剂、抗炎药、皮质类固醇、5-氨基水杨酸盐、免疫抑制剂、硫唑嘌呤、巯嘌呤、抗TNF-α抗体、英夫利昔单抗、阿达木单抗、聚乙二醇结合赛妥珠单抗、甲氨蝶呤、抗α4-整联蛋白抗体、那他珠单抗、维多珠单抗、抗白介素抗体、尤特克单抗、抗菌抗生素、环丙沙星和甲硝唑。


13.权利要求2-4中任何一项的方法,其中所述干预为给予选自以下的药物:维生素B12、维生素D、钙、聚乙二醇结合赛妥珠单抗、甲氨蝶呤和那他珠单抗。


14.权利要求2-4中任何一项的方法,其中所述干预为将所述受试者置于低脂饮食。


15.一种治疗患有炎性肠病(IBD)或处于其风险下的患者的方法,所述方法包括:
进行根据权利要求1在所述患者中测量HD5的方法;和
对所述患者进行干预以治疗溃疡性结肠炎。


16.权利要求15的方法,包括:将所述样品中HD5的表达或HD5的浓度与未患克罗恩氏病的受试者典型的基准值进行比较,并且如果所述样品中HD5的表达或HD5的浓度未明显超过基准值,则诊断为溃疡性结肠炎。


17.权利要求15-16中任何一项的方法,其中所述样品中HD5的表达或HD5的浓度低于患有克罗恩氏病的受试者典型的基准值。


18.权利要求15-16中任何一项的方法,其中所述样品中HD5的表达或浓度被测量为明显低于来自患有克罗恩氏病的受试者的对照样品。


19.权利要求15-16中任何一项的方法,其中所述样品中HD5的表达被测量为不高于来自未患克罗恩氏病的受试者的对照样品中测量的HD5表达的约1/31。


20.权利要求15-16中任何一项的方法,其中所述样品中HD5的表达被测量为不高于来自未患克罗恩氏病的受试者的对照样品中测量的HD5表达的约1/118。


21.权利要求15-16中任何一项的方法,其中HD5的表达被测量为每10ngRNA低于106个HD5mRNA转录物。


22.权利要求15-16中任何一项的方法,其中HD5的表达被测量为每10ngRNA低于107个HD5mRNA转录物。


23.权利要求15-16中任何一项的方法,其中所述样品为肠组织,并且包括通过以下方法测量HD5的浓度:用抗HD5免疫染色剂对所述样品进行免疫染色;和测量所述样品中染色阳性的细胞百分比;其中所述样品中染色阳性的细胞百分比为少于10%。


24.权利要求15-16中任何一项的方法,其中所述干预对于治疗克罗恩氏病无效。


25.权利要求15-16中任何一项的方法,其中所述干预为选自以下的手术:直肠结肠切除术和回肠贮袋肛门吻合术。


26.权利要求15-16中任何一项的方法,其中所述干预为给予选自以下的药物:铁补充剂、抗炎药、皮质类固醇、5-氨基水杨酸盐、免疫抑制剂、硫唑嘌呤、巯嘌呤、环孢菌素、抗TNF-α抗体、英夫利昔单抗、阿达木单抗、戈利木单抗、甲氨蝶呤、抗α4-整联蛋白抗体、维多珠单抗、抗菌抗生素、环丙沙星和甲硝唑。


27.权利要求15-16中任何一项的方法,其中所述干预为给予选自以下的药物:环孢菌素和戈利木单抗。


28.权利要求1-4和15-16中任何一项的方法,其中所述样品为肠组织。


29.权利要求1-4和15-16中任何一项的方法,其中离体测量所述样品中HD5的表达或HD5的浓度。


30.权利要求1-4和15-16中任何一项的方法,其中所述患者患有IBD。


31.权利要求1-4和15-16中任何一项的方法,其中所述患者表现出严重腹泻、腹痛、疲劳和体重减轻。


32.权利要求1-4和15-16中任何一项的方法,其进一步包括测量所述样品中MMP-7的表达和MMP-7的浓度中的至少一种。


33.一种在患有炎性肠病(IBD)或处于其风险下的患者中测量MMP-7的方法,所述方法包括:
从所述患者获得样品,和
测量所述样品中MMP-7的表达和MMP-7的浓度中的至少一种。


34.一种治疗患有炎性肠病(IBD)或处于其风险下的患者的方法,所述方法包括:
进行根据权利要求33在所述患者中测量MMP-7的方法;和
对所述患者进行干预以治疗克罗恩氏病。


35.权利要求33的方法,包括:将所述样品中MMP-7的表达或MMP-7的浓度与未患溃疡性结肠炎的受试者典型的基准值进行比较;和如果所述样品中MMP-7的表达或MM...

【专利技术属性】
技术研发人员:A姆科马
申请(专利权)人:梅哈里医学院
类型:发明
国别省市:美国;US

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