本发明专利技术公开了一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法，属于植物种质资源评价技术领域。包括以下步骤：1)提取原始群体狗牙根样本基因组DNA，进行SSR‑PCR扩增，得到狗牙根SSR分子标记数据；2)在原始群体狗牙根样本分组的情况下，基于SSR分子标记数据，采用多次聚类优先取样法取样，总体取样比例20％，组内取样比例为平方根比例，遗传距离用Nei&Li遗传距离，聚类方法用重心法构建狗牙根核心种质。采用本发明专利技术所构建成的狗牙根核心种质能够有效地保留原始种质的遗传结构，而且有效去除了冗余材料，可以作为整体资源的代表性样本。
A method of constructing core germplasm of bermudagrass with SSR Markers
【技术实现步骤摘要】
一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法
本专利技术涉及植物种质资源评价
，更具体的说是涉及一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法。
技术介绍
狗牙根属于禾本科画眉草亚科虎尾草族的C4型多年生草本植物，是世界三大暖季型草坪草之一，也是一种优良牧草。国内外学者在狗牙根种质资源的收集、遗传多样性评价等方面已取得一定的进展，这些研究为狗牙根种源的核心种质的构建奠定了良好的基础。中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所近年来收集了大量的狗牙根种源，已从形态、分子、抗逆性、坪用价值、饲用价值等方面对所收集的代表性资源进行了研究，然而，现有研究一般停留在利用形态标记构建狗牙根核心种质资源。如何更快、更有效地研究，对于加快发掘优异的资源为育种服务显得尤为重要。因此，如何利用SSR标记构建狗牙根核心种质是本领域技术人员亟需解决的问题。
技术实现思路
有鉴于此，本专利技术提供了一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的引物，包括：引物对1：SC12-F：5’-GCAGCTGAAAACCTCCAGAT-3’；SEQIDNO.1；SC12-R：5’-GGCCACTTGATCACACACTC-3’；SEQIDNO.2；引物对2：SC14-F：5’-ATGAGAACGGAGACGGAGAC-3’；SEQIDNO.3；SC14-R：5’-GTACTGGACGAAGGATCGGT-3’；SEQIDNO.4；引物对3：SC17-F：5’-ATGGAAGGAGTCTTCGCTGT-3’；SEQIDNO.5；SC17-R：5’-GGAAACCATGGTGCTCTCTT-3’；SEQIDNO.6；引物对4：SC18-F：5’-ATGGTCAGGAGTGGAAGGAG-3’；SEQIDNO.7；SC18-R：5’-GACTGATGATCGCCTTGTTG-3’；SEQIDNO.8；引物对5：SC19-F：5’-GCTCCAGCAGATAGAAGGCT-3’；SEQIDNO.9；SC19-R：5’-CACGAGCATGGACTTGAACT-3’；SEQIDNO.10；引物对6：SC24-F：5’-TCACCAGACCACCAGCTTC-3’；SEQIDNO.11；SC24-R：5’-GAGAACGGGCCAAGGTACT-3’；SEQIDNO.12；引物对7：SC33-F：5’-GAGGGCGTACAGGAAGAACA-3’；SEQIDNO.13；SC33-R：5’-CCGAGAAGGACTTGGTGAAG-3’；SEQIDNO.14；引物对8:SC40-F：5’-CTGTATCTTATGCTGGTTTG-3’；SEQIDNO.15；SC40-R：5’-CGTGCTCTGCCTCTGCTA-3’；SEQIDNO.16；引物对9：SC42-F：5’-TACGACTCCGTCACCAAC-3’；SEQIDNO.17；SC42-R：5’-GGCCATCGCTAATCAATC-3’；SEQIDNO.18；引物对10：SC44-F：5’-GGGTAGTAGTAGCAGGTTGG-3’；SEQIDNO.19；SC44-R：5’-GTGCGTTTCATCGTTGTT-3’；SEQIDNO.20；引物对11：SC48-F：5’-GGACTCAAAAATGCTCAGAAA-3’；SEQIDNO.21；SC48-R：5’-TTTGCAGAGCCCGTAACTCT-3’；SEQIDNO.22；引物对12：SC49-F：5’-CAAGGACCACATCACCATCA-3’；SEQIDNO.23；SC49-R：5’-CGGCCATTGATTATCTGTGA-3’；SEQIDNO.24；引物对13：SC51-F：5’-TCCTGAGGGGTTCTCACTG-3’；SEQIDNO.25；SC51-R：5’-GGAGTAGGTGCTGCTGATT-3’；SEQIDNO.26；引物对14：SC53-F：5’-TGACGTCGTTGGTGTAGAGC-3’；SEQIDNO.27；SC53-R：5’-CGACTCCATCTGGTCCAACT-3’；SEQIDNO.28；引物对15：SC54-F：5’-AGATCGGGGTGGGGAAGA-3’；SEQIDNO.29；SC54-R：5’-GTACATCTCCAGCAGCGACA-3’；SEQIDNO.30；引物对16：SC55-F：5’-ATCCAATGAGTGGGACTCCA-3’；SEQIDNO.31；SC55-R：5’-CCAGCTTGCTTGGGATTAAA-3’；SEQIDNO.32；引物对17：SC56-F：5’-TGATGGTGATGCAATGGACT-3’；SEQIDNO.33；SC56-R：5’-GCTGTCTTGGGTTCAGCTTC-3’；SEQIDNO.34；引物对18：SC58-F：5’-GGCAGCTCCTCTCTCCTTAAA-3’；SEQIDNO.35；SC58-R：5’-ACCATGACCTTGTCCTCGTC-3’；SEQIDNO.36；引物对19：SC59-F：5’-ACATGTCTCCGTCCCATCA-3’；SEQIDNO.37；SC59-R：5’-ATGAGTCGGTCCTTCTTGG-3’；SEQIDNO.38；引物对20：SC61-F：5’-AGGGGAAGAAGGGTAAGCAG-3’；SEQIDNO.39；SC61-R：5’-CACCAAATCCACCAAAGGAG-3’；SEQIDNO.40；引物对21：SC62-F：5’-CATGCGCTTTGAGTTTGAG-3’；SEQIDNO.41；SC62-R：5’-AACACCACAACGACCTTCG-3’；SEQIDNO.42；引物对22：SC63-F：5’-TCCGTTGCCTATACGGTTG-3’；SEQIDNO.43；SC63-R：5’-GGAACCGATAATCACTCCA-3’；SEQIDNO.44；进一步的：一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的方法，包括以下步骤：1)提取原始群体狗牙根样本基因组DNA，用上述引物进行SSR-PCR扩增，得到狗牙根SSR分子标记数据；2)在所述原始群体狗牙根样本基于地域分组的情况下，基于所述SSR分子标记数据，采用多次聚类优先取样法取样，总体取样比例20％本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的引物，其特征在于，包括22对引物：/nSC12-F：5’-GCAGCTGAAAACCTCCAGAT-3’；SEQ ID NO.1；/nSC12-R：5’-GGCCACTTGATCACACACTC-3’；SEQ ID NO.2；/nSC14-F：5’-ATGAGAACGGAGACGGAGAC-3’；SEQ ID NO.3；/nSC14-R：5’-GTACTGGACGAAGGATCGGT-3’；SEQ ID NO.4；/nSC17-F：5’-ATGGAAGGAGTCTTCGCTGT-3’；SEQ ID NO.5；/nSC17-R：5’-GGAAACCATGGTGCTCTCTT-3’；SEQ ID NO.6；/nSC18-F：5’-ATGGTCAGGAGTGGAAGGAG-3’；SEQ ID NO.7；/nSC18-R：5’-GACTGATGATCGCCTTGTTG-3’；SEQ ID NO.8；/nSC19-F：5’-GCTCCAGCAGATAGAAGGCT-3’；SEQ ID NO.9；/nSC19-R：5’-CACGAGCATGGACTTGAACT-3’；SEQ ID NO.10；/nSC24-F：5’-TCACCAGACCACCAGCTTC-3’；SEQ ID NO.11；/nSC24-R：5’-GAGAACGGGCCAAGGTACT-3’；SEQ ID NO.12；/nSC33-F：5’-GAGGGCGTACAGGAAGAACA-3’；SEQ ID NO.13；/nSC33-R：5’-CCGAGAAGGACTTGGTGAAG-3’；SEQ ID NO.14；/nSC40-F：5’-CTGTATCTTATGCTGGTTTG-3’；SEQ ID NO.15；/nSC40-R：5’-CGTGCTCTGCCTCTGCTA-3’；SEQ ID NO.16；/nSC42-F：5’-TACGACTCCGTCACCAAC-3’；SEQ ID NO.17；/nSC42-R：5’-GGCCATCGCTAATCAATC-3’；SEQ ID NO.18；/nSC44-F：5’-GGGTAGTAGTAGCAGGTTGG-3’；SEQ ID NO.19；/nSC44-R：5’-GTGCGTTTCATCGTTGTT-3’；SEQ ID NO.20；/nSC48-F：5’-GGACTCAAAAATGCTCAGAAA-3’；SEQ ID NO.21；/nSC48-R：5’-TTTGCAGAGCCCGTAACTCT-3’；SEQ ID NO.22；/nSC49-F：5’-CAAGGACCACATCACCATCA-3’；SEQ ID NO.23；/nSC49-R：5’-CGGCCATTGATTATCTGTGA-3’；SEQ ID NO.24；/nSC51-F：5’-TCCTGAGGGGTTCTCACTG-3’；SEQ ID NO.25；/nSC51-R：5’-GGAGTAGGTGCTGCTGATT-3’；SEQ ID NO.26；/nSC53-F：5’-TGACGTCGTTGGTGTAGAGC-3’；SEQ ID NO.27；/nSC53-R：5’-CGACTCCATCTGGTCCAACT-3’；SEQ ID NO.28；/nSC54-F：5’-AGATCGGGGTGGGGAAGA-3’；SEQ ID NO.29；/nSC54-R：5’-GTACATCTCCAGCAGCGACA-3’；SEQ ID NO.30；/nSC55-F：5’-ATCCAATGAGTGGGACTCCA-3’；SEQ ID NO.31；/nSC55-R：5’-CCAGCTTGCTTGGGATTAAA-3’；SEQ ID NO.32；/nSC56-F：5’-TGATGGTGATGCAATGGACT-3’；SEQ ID NO.33；/nSC56-R：5’-GCTGTCTTGGGTTCAGCTTC-3’；SEQ ID NO.34；/nSC58-F：5’-GGCAGCTCCTCTCTCCTTAAA-3’；SEQ ID NO.35；/nSC58-R：5’-ACCATGACCTTGTCCTCGTC-3’；SEQ ID NO.36；/nSC59-F：5’-ACATGTCTCCGTCCCATCA-3’；SEQ ID NO.37；/nSC59-R：5’-ATGAGTCGGTCCTTCTTGG-3’；SEQ ID NO.38；/nSC61-F：5’-AGGGGAAGAAGGGTAAGCAG-3’；SEQ ID NO.39；/nSC61-R：5’-CACCAAATCCACCAAAGGAG-3’；SEQ ID NO.40；/nSC62-F：5’-CATGCGCTTTGAG...
【技术特征摘要】
1.一种利用SSR标记构建狗牙根核心种质的引物，其特征在于，包括22对引物：
SC12-F：5’-GCAGCTGAAAACCTCCAGAT-3’；SEQIDNO.1；
SC12-R：5’-GGCCACTTGATCACACACTC-3’；SEQIDNO.2；
SC14-F：5’-ATGAGAACGGAGACGGAGAC-3’；SEQIDNO.3；
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SC54-F：5’-...
【专利技术属性】
技术研发人员：黄春琼，龙萄，王文强，张瑜，刘国道，
申请(专利权)人：中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所，
类型：发明
国别省市：海南;46
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