用于子宫内膜癌诊断的试剂盒以及应用制造技术

本发明专利技术公开了用于子宫内膜癌诊断的试剂盒以及应用，涉及基因检测技术领域。本发明专利技术公开的试剂盒含有用于检测第一靶基因甲基化的第一试剂；其中，第一靶基因为ZNF454基因。该试剂盒以ZNF454基因为靶点，通过检测其甲基化，对子宫内膜癌进行诊断，具有更高的灵敏度和特异性，为子宫内膜癌的临床诊断和用药提供更可靠的参考依据。

【技术实现步骤摘要】
用于子宫内膜癌诊断的试剂盒以及应用
本专利技术涉及基因检测
，具体而言，涉及用于子宫内膜癌诊断的试剂盒以及应用。
技术介绍
子宫内膜癌是发生于子宫内膜的一组上皮性恶性肿瘤，为女性生殖道三大恶性肿瘤之一，好发于围绝经期及绝经后的妇女，近年来呈年轻化趋势，早期(Ⅰ期、Ⅱ期)子宫内膜癌患者的五年生存率达70％以上，Ⅲ期患者的五年生存率约为40-50％，而Ⅳ期患者的五年生存率仅为15-20％。因此，实现子宫内膜癌的早期诊断是改善患者预后的重要举措。子宫内膜癌的早期诊断方法有诊断性刮宫、细胞学检查、经阴道超声和宫腔镜检查等，但这些诊断方法均存在一定的弊端。临床诊断主要依靠诊断性刮宫，该方法取样有创伤，哺乳期或浸润型子宫内膜癌人群子宫壁薄弱，刮宫时可能造成子宫穿孔，给患者造成伤害；细胞学检查最接近筛查策略，但当前缺乏统一的细胞学标准；经阴道超声无法确定子宫内膜病变时内膜厚度的界值；宫腔镜检查费用高昂，且单独运用诊断价值有限。因此，子宫内膜癌早期检测亟需一种准确度高、方便且侵入性小的检测方法。近年来，基因诊断成为体外诊断行业新的发展趋势。基因诊断，又称为DNA诊断或分子诊断，是应用分子生物学方法检测患者体内遗传物质结构或表达水平的变化，继而做出诊断的技术。鉴于目前子宫内膜癌诊断方法存在的以上缺陷，基因诊断可提供一种更为方便和准确的方法。目前临床上使用的肿瘤标志物主要为糖链抗原CA125和人附睾蛋白4，但其灵敏度较低，且在卵巢上皮性肿瘤、子宫内膜异位症、消化系统肿瘤等疾病中均可检测到CA125水平升高，此种检测方法的特异性也较低。DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰，在DNA甲基转移酶催化下，利用S-腺苷甲硫氨酸提供的甲基，将胞嘧啶的第五位碳原子甲基化，从而使胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶，其对基因的表达调控发挥至关重要的作用。DNA甲基化作为基因诊断的手段之一，与癌症的发生有着密切的关系，在多种癌症中均发现存在DNA甲基化异常的现象。DNA甲基化具有稳定性的特点，并且是癌症发生的早期事件。近年来许多研究表明，DNA甲基化异常可以作为一种癌症诊断的生物标志物。鉴于此，特提出本专利技术。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供用于子宫内膜癌诊断的试剂盒以及应用。本专利技术的试剂盒是以ZNF454基因为靶点，通过检测其甲基化，用于子宫内膜癌的诊断，具有更高的灵敏度和特异性，为子宫内膜癌的临床诊断和用药提供更可靠的参考依据。本专利技术是这样实现的：第一方面，本专利技术实施例提供一种用于子宫内膜癌诊断的试剂盒，其含有用于检测第一靶基因甲基化的第一试剂；其中，上述第一靶基因为ZNF454基因。ZNF454基因编码锌指蛋白，可作为转录因子调控靶基因的转录，ZNF454基因位于人类第5号染色体上，对应于人类基因组GRCh38/hg38版本的chr5:178941198-178966433区域，ZNF454蛋白包含可使靶基因沉默的KRAB结构域，该结构域的长度为71个氨基酸。本专利技术的研究发现，以ZNF454基因作为靶点，通过检测该基因的甲基化来对子宫内膜癌进行诊断，其灵敏度和特异性较现有技术均有提高。本专利技术提供的用于子宫内膜癌诊断的试剂盒，其含有用于检测第一靶基因甲基化的第一试剂；其中，第一靶基因为ZNF454基因。该试剂盒可以检测ZNF454基因的甲基化，检测结果可以用于子宫内膜癌的诊断，具有更高的灵敏度和特异性(如，灵敏性和特异性分别为97.87％和97.83％，ROC曲线下面积为0.976)，为子宫内膜癌的临床诊断和用药提供更可靠的参考依据。在可选的实施方式中，上述第一试剂所检测的第一靶区域选自ZNF454基因chr5:178940620-178941724的全长区域或其中的部分区域。本专利技术的研究还发现，甲基化的区域跟子宫内膜癌的发生有密切关系，以不同区域的甲基化作为检测的靶区域，均可以提高子宫内膜癌诊断的灵敏度和特异性。当以第一靶区域chr5:178940620-178941724的全长区域或部分区域为检测靶标时，灵敏度和特异性较现有技术均有提高。优选地，第一靶区域选自如下区域中的至少一种：chr5:178940652-178940721、chr5:178940714-178940969、chr5:178940947-178941083、chr5:178941052-178941201、chr5:178941184-178941317、chr5:178941298-178941426、chr5:178941411-178941541和chr5:178941524-178941676。以上述区域作为靶区域，对子宫内膜癌进行诊断，灵敏度和特异性较高。更优选地，第一靶区域为chr5:178940947-178941083。基于本专利技术的前述内容，本领域技术人员容易想到采用多种方法和相应的试剂检测靶区域的甲基化。本专利技术提供的第一靶区域的甲基化检测方法包括但不限于如下方法：甲基化特异性PCR(MSP)、定量甲基化特异性PCR(qMSP)、亚硫酸氢盐测序法、甲基化特异性微阵列法、全基因组甲基化测序法、焦磷酸测序法、甲基化特异性高效液相层析法、数字PCR法、甲基化特异性高分辨率溶解曲线法、甲基化敏感性限制性内切酶法或荧光定量法。优选地，本专利技术的第一试剂适用于采用MSP法检测ZNF454基因的甲基化。当然，需要说明的是，采用其他甲基化检测方法的相应试剂进行针对chr5:178940620-178941724的全长或部分区域的甲基化检测，也是属于本专利技术的保护范围。优选地，所述第一试剂包括：第一引物对和第一探针；所述第一引物对的碱基序列如SEQIDNO.7-8所示，所述第一探针的碱基序列如SEQIDNO.9所示。第一引物对和第一探针检测对应检测的第一靶区域为chr5:178940947-178941083。在可选的实施方式中，上述试剂盒还包括用于检测第二靶基因甲基化的第二试剂；其中，上述第二靶基因为CDO1基因。CDO1基因位于人类染色体GRCh38/hg38版本的chr5:115804733-115816708区域，编码半胱氨酸双加氧酶-1，在哺乳动物中高度保守，参与半胱氨酸水平的调节和牛磺酸的合成。本专利技术的研究还发现，相较于以单独ZNF454基因作为子宫内膜癌诊断的甲基化检测靶基因，以ZNF454基因与CDO1基因联合或组合作为甲基化检测的靶基因，即综合考虑ZNF454基因与CDO1基因的甲基化检测结果，可以进一步提高子宫内膜癌诊断的灵敏度和特异性(例如，灵敏性和特异性分别为98.18％和97.26％，ROC曲线下面积为0.992)。在可选的实施方式中，上述第二试剂所检测的第二靶区域选自CDO1基因的chr5:115815652-115817016的全长区域或其中的部分区域。当以第二靶区域chr5:115815652-115817016的全长区域或部分区域为检测靶标时，灵敏度和特异性较现有技术均有提高。优选地，第二靶区域选自如下区域中的至少一种：chr5:115815669-115815784、chr5:115815768-115815908、chr5:115815885-115816079、chr5:115816060-115816220、chr5:1本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于子宫内膜癌诊断的试剂盒，其特征在于，其含有用于检测第一靶基因甲基化的第一试剂；其中，所述第一靶基因为ZNF454基因。

【技术特征摘要】
1.一种用于子宫内膜癌诊断的试剂盒，其特征在于，其含有用于检测第一靶基因甲基化的第一试剂；其中，所述第一靶基因为ZNF454基因。2.根据权利要求1所述的用于子宫内膜癌诊断的试剂盒，其特征在于，所述第一试剂所检测的第一靶区域选自ZNF454基因的chr5:178940620-178941724的全长区域或其中的部分区域；优选地，所述第一靶区域选自如下区域中的至少一种：chr5:178940652-178940721、chr5:178940714-178940969、chr5:178940947-178941083、chr5:178941052-178941201、chr5:178941184-178941317、chr5:178941298-178941426、chr5:178941411-178941541和chr5:178941524-178941676；优选地，所述第一靶区域选自chr5:178940947-178941083；优选地，所述第一靶区域适用于采用如下方法中的任意一种进行甲基化检测：甲基化特异性PCR、定量甲基化特异性PCR、亚硫酸氢盐测序法、甲基化特异性微阵列法、全基因组甲基化测序法、焦磷酸测序法、甲基化特异性高效液相层析法、数字PCR法、甲基化特异性高分辨率溶解曲线法、甲基化敏感性限制性内切酶法或荧光定量法；优选地，所述第一试剂适用于采用甲基化特异性PCR检测ZNF454基因的甲基化；优选地，所述第一试剂包括：第一引物对和第一探针；所述第一引物对的碱基序列如SEQIDNO.7-8所示，所述第一探针的碱基序列如SEQIDNO.9所示。3.根据权利要求2所述的用于子宫内膜癌诊断的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括用于检测第二靶基因甲基化的第二试剂；其中，所述第二靶基因为CDO1基因。4.根据权利要求3所述的用于子宫内膜癌诊断的试剂盒，其特征在于，所述第二试剂所检测的第二靶区域选自CDO1基因的chr5:115815652-115817016的全长区域或其中的部分区域；优选地，所述第二靶区域选自如下区域中的至少一种：chr5:115815669-115815784、chr5:115815768-115815908、chr5:115815885-115816079、chr5:115816060-115816220、chr5:115816195-115816357、chr5:115816338-115816468、chr5:115816448-115816573、chr5:115816536-115816750、chr5:115816687-115816795和chr5:115816779-115816963；优选地，所述第二靶区域选自chr5:115816448-115816573。5.根据权利要求4所述的用于子宫内膜癌诊断的试剂盒，其特征在于，所述第二靶区域适用于采用如下方法进行甲基化检测：甲基化特异性PCR、定量甲基化特异性PCR、亚硫酸氢盐测序法、甲基化特异性微阵列法、全基因组甲基化测序法、焦磷酸测序法、甲基化特异性高效液相层析法、数字PCR法、甲基化特异性高分辨率溶解曲线法、甲基化敏感性限制性内切酶法或荧光定量法；优选地，所述第二试剂适用于采用甲基化特异性PCR法检测CDO1基因的甲基化；所述第二试剂包括：第二引物对和第二探针；所述第二引物对的碱基序列如SEQIDNO：43-44所示，所述第二探针的碱基序...

【专利技术属性】
技术研发人员：张良禄，董兰兰，李婷婷，吴志诚，徐俊，赵妍，
申请(专利权)人：武汉艾米森生命科技有限公司，
类型：发明
国别省市：湖北,42