RASD1在作为评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后风险标记物中的应用制造技术

本发明专利技术公开了RASD1在作为评估成人Ph染色体阴性B‑ALL患者预后风险标记物中的应用。本发明专利技术保护用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物的应用：制备用于成人B‑ALL患者预后风险评估的产品、评估成人B‑ALL患者预后风险、制备用于成人B‑ALL患者预后复发率评估的产品、评估成人B‑ALL患者预后复发率、制备用于成人B‑ALL患者预后无复发生存率评估的产品、评估成人B‑ALL患者预后无复发生存率。所述成人B‑ALL患者为成人Ph染色体阴性B‑ALL患者。实验证明，RASD1低表达是成人Ph染色体阴性B‑ALL患者CIR和RFS的独立危险因素。本发明专利技术具有重要的应用价值。

Application of RASD1 as a prognostic risk marker for adult Ph chromosome negative B-ALL patients

【技术实现步骤摘要】
RASD1在作为评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后风险标记物中的应用
本专利技术属于生物医药领域，具体涉及RASD1在作为评估成人Ph染色体阴性B细胞急性淋巴细胞白血病(B-cellacutelymphoblasticleukemia，B-ALL)患者预后风险标记物中的应用。
技术介绍
B-ALL是成人最常见的ALL类型，危险分层和治疗方式的进步显著改善了患者的预后，但成人B-ALL复发率高，总体预后仍较差，长期生存仅为30％-40％。目前的危险度分层根据年龄、初诊白细胞计数、染色体核型、中枢神经系统受累以及对初始治疗的反应等将患者分为标危和高危。标危患者中仍有部分患者复发，提示目前的危险度分层仍有待精准化，因此新的预后相关分子标记物的发现和验证对于更精确的危险度分层十分必要，且可能提供治疗靶点。Ph染色体阴性的B-ALL遗传学背景复杂，包含多个遗传学亚型，既包括超二倍体核型、TEL-AML1融合基因等预后良好亚型，也包括亚二倍体、MLL重排等预后不良亚型。这类患者预后存在较大的异质性，多方面因素可能影响其预后。Rasrelateddexamethasoneinduced1(RASD1)又名AGS1或DEXRAS1，是位于染色体17p11.2的小G蛋白酶Ras超家族成员之一，可激活G蛋白信号通路。目前尚无RASD1与白血病预后相关的研究报道。
技术实现思路
本专利技术的目的是评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者经过治疗(如经过实施例1中治疗)后的预后风险。本专利技术首先保护用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物在如下(A)或(B)或(C)或(D)或(E)或(F)中的应用：(A)制备用于成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后风险评估的产品；(B)评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后风险；(C)制备用于成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后复发率评估的产品；(D)评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后复发率；(E)制备用于成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后无复发生存率评估的产品；(F)评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后无复发生存率。本专利技术还保护一种用于评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后风险的产品，可含有用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物。本专利技术还保护一种用于评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后复发率的产品，可含有用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物。本专利技术还保护一种用于评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后无复发生存率的产品，可含有用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物。上述任一所述的产品还可包含数据处理装置；所述数据处理装置内设模块；所述模块具有如下(a1)和(a2)所示的功能：(a1)以由若干名未采取任何治疗措施的成人Ph染色体阴性B-ALL患者组成的待测群体的离体骨髓为标本，测定每份标本中所述mRNA的表达量，然后按照所述mRNA的表达量由低到高的顺序将所述待测群体进行排列并二等分，将表达量低的1/2所述待测群体作为RASD1低表达组，将其余1/2所述待测群体作为RASD1高表达组；(a2)按照如下标准确定来自于所述待测群体的待测者的预后风险和/或预后复发率和/或预后无复发生存率：“来自于所述RASD1低表达组中的待测者”的预后风险和/或预后复发率高于或候选高于“来自于所述RASD1高表达组中的待测者”；“来自于所述RASD1低表达组中的待测者”的预后无复发生存率低于或候选低于“来自于所述RASD1高表达组中的待测者”。本专利技术还保护一种成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后风险评估方法，可包括如下步骤：检测待测患者单个核细胞DNA中RASD1基因的转录水平，“单个核细胞DNA中RASD1基因的转录水平高”的待测患者预后风险低于“单个核细胞DNA中RASD1基因的转录水平低”的待测患者。本专利技术还保护一种成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后复发率评估方法，可包括如下步骤：检测待测患者单个核细胞DNA中RASD1基因的转录水平，“单个核细胞DNA中RASD1基因的转录水平高”的待测患者预后复发率低于“单核细胞DNA中RASD1基因的转录水平低”的待测患者。本专利技术还保护一种成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后无复发生存率评估方法，包括如下步骤：检测待测患者单个核细胞DNA中RASD1基因的转录水平，“单个核细胞DNA中RASD1基因的转录水平高”的待测患者预后无复发生存率高于“单个核细胞DNA中RASD1基因的转录水平低”的待测患者。上述任一所述的方法中，所述“检测待测患者单个核细胞DNA中RASD1基因的转录水平”可采用所述用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物进行。在本专利技术中，所述检测物可为任何能够实现对所述mRNA进行定量检测的试剂和/或仪器。具体可选自如下中任一种：用于检测所述mRNA的特异性扩增引物和/或探针。对所述mRNA进行定量检测包括但不限于：设计RASD1的PCR引物使用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测RASD1的mRNA。上述任一所述“用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物”可为用于检测RASD1基因表达水平的检测物。所述RASD1基因的核苷酸序列如序列表中序列6所示。在本专利技术中，所述检测物具体可为由序列表中序列1和序列2所示的两条单链核苷酸组成的引物对，和/或，由序列表中序列3所示的单链探针。所述单链探针的5’端可标记有荧光报告基团(如FAM)。所述单链探针的3’端可标记有荧光猝灭基团(如BHQ)。上述任一所述检测物还可包括用于检测内参基因mRNA的特异性扩增引物和/或探针。所述内参基因具体可为ABL1基因(GenBank：NM_005157)。检测ABL1基因mRNA的特异性扩增引物为ABL1-FP：5’-TGGAGATAACACTCTAAGCATAACTAAAGGT-3’和ABL1-RP：5’-GATGTAGTTGCTTGGGACCCA-3’。检测ABL1基因mRNA的探针为5’-FAM-CCATTTTTGGTTTGGGCTTCACACCATT-BHQ-3’。在本专利技术中，所述预后风险可为经过治疗(如经过实施例1的相应治疗)后的预后风险。所述预后风险的高低具体可体现为如下指标中的全部或部分：累积复发率(CIR)和无复发生存率(RFS)。累积复发率(CIR)越低和/或无复发生存率(RFS)越高，则预后风险越低。累积复发率(CIR)越高和/或无复发生存率(RFS)越低，则预后风险越高。从第1次完全缓解至第1次复发或死亡的日期确定累积复发期。从第1次完全缓解至首次复发日期确定无复发生存期。本专利技术中，所述RASD1蛋白的氨基酸序列如序列表中序列4所示。所述编码RASD1蛋白的mRNA的序列如序列表中序列5所示。RASD1的NCBI基因库序列号为：NM_001199989.1。上述任一所述成人B-ALL患者具体可为成人Ph染色体阴性B-ALL患者。上述任一所述成人可为14岁以上。本研究首次研究RASD1基因对成人(14岁以上)Ph染色体阴性B-ALL预后的影响，并发现RASD1低表达是成人(14岁以上)Ph染色体阴性B-ALL患者CIR和RFS的独立危险因素。本专利技术在Ph染色体阴性B-ALL的分层诊断和预后评估中具有重本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物在如下(A)或(B)或(C)或(D)或(E)或(F)中的应用：(A)制备用于成人Ph染色体阴性B‑ALL患者预后风险评估的产品；(B)评估成人Ph染色体阴性B‑ALL患者预后风险；(C)制备用于成人Ph染色体阴性B‑ALL患者预后复发率评估的产品；(D)评估成人Ph染色体阴性B‑ALL患者预后复发率；(E)制备用于成人Ph染色体阴性B‑ALL患者预后无复发生存率评估的产品；(F)评估成人Ph染色体阴性B‑ALL患者预后无复发生存率。

【技术特征摘要】
1.用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物在如下(A)或(B)或(C)或(D)或(E)或(F)中的应用：(A)制备用于成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后风险评估的产品；(B)评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后风险；(C)制备用于成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后复发率评估的产品；(D)评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后复发率；(E)制备用于成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后无复发生存率评估的产品；(F)评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后无复发生存率。2.用于评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后风险的产品，含有用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物。3.用于评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后复发率的产品，含有用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物。4.用于评估成人Ph染色体阴性B-ALL患者预后无复发生存率的产品，含有用于检测编码RASD1蛋白的mRNA的检测物。5.如权利要求2、3或4所述的产品，其特征在于：所述产品还包含数据处理装置；所述数据处理装置内设模块；所述模块具有如下(a1)和(a2)所示的功能：(a1)以由若干名未采取任何治疗措施的成人Ph染色体阴性B-ALL患者组成的待测群体的离体骨髓为标本，测定每份标本中所述mRNA的表达量，然后按照所述mRNA的表达量由低到高的顺序将所述待测群体进行排列并二等分，将表达量低的1/2所述待测群体作为RASD1低表达组，将其余1/2所述待测群体作为RASD1高表达组；(a2)按照如下标准确定来自于所述待测群体的待测者的预后风险和/或预后复发率和/或预...

【专利技术属性】
技术研发人员：黄晓军，阮国瑞，卢润青，
申请(专利权)人：北京大学人民医院北京大学第二临床医学院，
类型：发明
国别省市：北京,11