用于诊断肺癌的方法技术

本发明专利技术涉及用于诊断肺癌的方法。具体地，本发明专利技术涉及用于通过分析源自受试者的生物样品鉴定所述受试者的肺癌的方法。更具体地，本发明专利技术涉及通过分析来自血浆样品的DNA鉴定肺癌。该方法是基于正常和肺癌DNA之间DNA甲基化的差异。提供了用于基于在选择的基因组基因座处DNA甲基化的改变鉴定受试者的肺癌的方法和试剂盒。

Diagnostic methods for lung cancer

【技术实现步骤摘要】
用于诊断肺癌的方法专利
本专利技术涉及用于通过分析源自受试者的生物样品鉴定所述受试者的肺癌的方法。更具体地，本专利技术涉及通过分析来自血浆样品的DNA鉴定肺癌。该方法是基于正常和肺癌DNA之间DNA甲基化的差异。专利技术背景肺癌是起因于肺细胞的癌症，是最常见和最严重的癌症类型之一。肺癌有两种主要类型，即非小细胞肺癌(NSCLC)(最常见的类型)和小细胞肺癌。NSCLC有几种亚型，包括鳞状细胞癌、腺癌和大细胞癌。肺癌的一般预后很差，因为肺癌通常不引起明显的症状，直到传遍肺，且有时也扩散到身体的其他部位。有效的早期检测方法可以导致改善后果，然而没有可以用于早期诊断的很好的肺癌筛查方法，特别是在出现症状之前。已经研究了三种筛查测试以确定它们是否能够降低肺癌的死亡率：胸部低剂量计算机断层扫描(CT)、胸部X光和痰细胞学。在所测试的方法中，只有对高风险个体(重度吸烟者)的低剂量CT筛查显示降低肺癌死亡率。然而，CT扫描，即使在低剂量，也会使胸部暴露于辐射。另外，低剂量CT扫描发现的许多异常证明不是癌症，而是仍需要用更多的CT扫描和另外的测试来检查，其中一些是侵入性的。肺癌的明确诊断是基于对本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于鉴定人受试者的肺癌的方法，所述方法包括：(a)将来自从所述受试者获得的血浆样品的DNA应用于用至少一种甲基化敏感性限制性内切核酸酶的消化，以获得限制性内切核酸酶处理的DNA；(b)从所述限制性内切核酸酶处理的DNA共扩增包含SEQ ID NO:4中列出的基因座的至少一种限制性基因座和对照基因座，从而生成每种基因座的扩增产物；(c)计算所述至少一种限制性基因座的每一种和所述对照基因座的扩增产物的信号强度之间的比率；以及(d)检测所述比率关于肺癌比率的高概率评分，从而鉴定人受试者的肺癌。

【技术特征摘要】
2018.01.18 US 62/618,6491.一种用于鉴定人受试者的肺癌的方法，所述方法包括：(a)将来自从所述受试者获得的血浆样品的DNA应用于用至少一种甲基化敏感性限制性内切核酸酶的消化，以获得限制性内切核酸酶处理的DNA；(b)从所述限制性内切核酸酶处理的DNA共扩增包含SEQIDNO:4中列出的基因座的至少一种限制性基因座和对照基因座，从而生成每种基因座的扩增产物；(c)计算所述至少一种限制性基因座的每一种和所述对照基因座的扩增产物的信号强度之间的比率；以及(d)检测所述比率关于肺癌比率的高概率评分，从而鉴定人受试者的肺癌。2.如权利要求1所述的方法，其中所述至少一种限制性基因座还包括选自SEQIDNO:1、SEQIDNO:2、SEQIDNO:3、SEQIDNO:5和SEQIDNO:6中列出的基因座的组的至少一种另外的限制性基因座，并且所述概率评分为所述SEQIDNO:4的比率以及所述至少一种另外的限制性基因座的至少一种另外的比率关于肺癌比率的组合概率评分。3.如权利要求2所述的方法，其中所述至少一种另外的限制性基因座包括SEQIDNO:1、SEQIDNO:2、SEQIDNO:3、SEQIDNO:5和SEQIDNO:6中列出的所有基因座，并且所述组合概率评分为SEQIDNO:4的比率、SEQIDNO:1的比率、SEQIDNO:2的比率、SEQIDNO:3的比率、SEQIDNO:5的比率和SEQIDNO:6的比率关于肺癌比率的组合概率评分。4.如权利要求1所述的方法，所述方法还包括：提供第一对照DNA和第二对照DNA，所述第一对照DNA和所述第二对照DNA各自包括人细胞系来源的DNA，其中所述第一对照DNA包括来自其中所述至少一种限制性基因座大部分被甲基化的人细胞系的DNA，且所述第二对照DNA包括来自其中所述至少一种限制性基因座的一种或更多种大部分未被甲基化的人细胞系的DNA；用所述甲基化敏感性限制性内切核酸酶消化所述第一对照DNA和所述第二对照DNA；以及从所述第一对照DNA和所述第二对照DNA扩增所述至少一种限制性基因座和所述对照基因座；其中所述第一对照DNA中所述至少一种限制性基因座和所述对照基因座的充分扩增的检测指示成功的DNA扩增，且其中所述第二对照DNA中所述至少一种限制性基因座的一种或更多种的低扩增或不扩增伴随所述对照基因座的正常扩增指示成功的DNA消化。5.如权利要求4所述的方法，其中，所述其中所述至少一种限制性基因座大部分被甲基化的人细胞系是HCT-15。6.如权利要求4所述的方法，其中，所述其中所述至少一种限制性基因座的一种或更多种大部分未被甲基化的人细胞系是A673。7.如权利要求1所述的方法，其中所述至少一种甲基化敏感性限制性内切核酸酶选自由以下组成的组：AatII、Acc65I、AccI、Acil、ACII、Afel、Agel、Apal、ApaLI、AscI、AsiSI、Aval、AvaII、BaeI、BanI、BbeI、BceAI、BcgI、BfuCI、BglI、BmgBI、BsaAI、BsaBI、BsaHI、BsaI、BseYI、BsiEI、BsiWI、BslI、BsmAI...

【专利技术属性】
技术研发人员：丹尼·弗鲁姆金，亚当·瓦瑟斯特罗姆，
申请(专利权)人：纽克莱克斯有限公司，
类型：发明
国别省市：以色列,IL