乳腺癌诊治用生物标志物制造技术

本发明专利技术公开了乳腺癌诊治用生物标志物，所述生物标志物为lncRNA LINC02544。本发明专利技术通过检测癌组织与正常组织中的差异表达基因，发现了LINC02544在乳腺癌中表达上调，提示LINC02544可作为检测靶标应用于乳腺癌的诊断和治疗。

Biomarkers for diagnosis and treatment of breast cancer

【技术实现步骤摘要】
乳腺癌诊治用生物标志物
本专利技术属于生物医药领域，涉及乳腺癌诊治用生物标志物，所述生物标志物为LINC02544。
技术介绍
乳腺癌是包括中国在内的许多国家的常见肿瘤，在世界范围内，有12.2％的新发乳腺癌病例和9.6％的乳腺癌死亡病例来自中国，并且乳腺癌是中国女性最常见肿瘤和第六位因癌症死亡病因(S.Zheng,J.Q.Bai,J.Li,etal.ThepathologiccharacteristicsofbreastcancerinChinaanditsshiftduring1999-2008:anational-widemulticentercross-sectionalimageover10years[J].IntJCancer,2012,131(11):2622-2631)，其发病率和死亡率具有上升的趋势(W.Chen,R.Zheng,P.D.Baade,etal.CancerstatisticsinChina,2015[J].CACancerJClin,2016,66(2):115一132)。乳腺癌是一种复杂的疾病，通常认为乳腺癌是环境、基因、生殖因素共同作用的结果。许多研究结果显示:不健康生活方式、初潮年龄早、绝经年龄晚、未哺乳、乳腺癌家族史等环境、生殖因素与乳腺癌相关(F.Islami,Y.Liu,A.Jemal,etal.Breastfeedingandbreastcancerriskbyreceptorstatus-asystematicreviewandmeta-analysis[J].AnnalsOfOncology,2015,2398-240726(12):)。越来越多的证据显示基因在乳腺癌中起到重要作用。长链非编码RNA(longnon-codingRNA，LncRNA))是一种长度大于200bp，缺少开放阅读框，不能编码蛋白质的RNA，与细胞的增殖、分化、代谢、免疫和凋亡相关(L.L.Chen.LinkingLongNoncodingRNALocalizationandFunction[J].TrendsBiochemSci,2016,41(9):761-772)。近期的研究发现1ncRNA可能影响肿瘤的发生发展。越来越多的证据表明，lncRNA在肿瘤的发生发展中起着重要的作用。研究与乳腺癌相关的lncRNA，对于实现乳腺癌的进一步分型，以及精准医疗具有重要的意义。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术经过广泛而深入的研究，通过高通量测序的方法，检测乳腺癌标本中lncRNA在肿瘤组织和正常组织的表达，发现其中具有明显表达差异的lncRNA，探讨其与乳腺癌的发生之间的关系，从而为乳腺癌的诊断及精准靶向治疗寻找更好的途径和方法。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术的第一方面提供了一种试剂，所述试剂能够检测样本中LINC02544的水平。“LINC02544”位于6号染色体上，基因ID为101929504，包括LINC02544基因及其的同源物，突变，和同等型。该术语涵盖全长，未加工的LINC02544，以及源自细胞中加工的任何形式的LINC02544。该术语涵盖LINC02544的天然发生变体(例如剪接变体或等位变体)。该术语涵盖例如LINC02544基因，人LINC02544的基因序列(NR_125863.1)，以及来自任何其它脊椎动物来源。进一步，所述试剂包括：特异性识别LINC02544的探针；或特异性扩增LINC02544的引物。“探针”指能与特别预期的靶生物分子，例如由内在基因编码的或相应于内在基因的核苷酸转录物或蛋白选择性结合的分子。探针可以由本领域技术人员合成，或者可以来自于合适的生物制备物。可以特异性地设计探针以对其进行标记。可以用作探针的分子的实例包括，但不限于RNA、DNA、蛋白、抗体、和有机分子。在本专利技术的一个具体实施方案中，特异性扩增LINC02544的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。本专利技术的第二方面提供了一种试剂盒，所述试剂盒包括本专利技术第一方面所述的试剂。在本专利技术公开的一个实施方案中，捕获探针固定在阵列上。“阵列”指固体支持物或基质，具有肽或核酸探针与该支持物或基质相连。阵列典型地包含与基质表面在不同的、已知的部位偶联的多个不同的捕获探针。本专利技术的阵列包含具有多个捕获探针的基质，所述捕获探针可以与内在基因表达产物特异性结合。基质上捕获探针的数量随阵列的预期目的而不同。阵列可以是低密度阵列或高密度阵列，并可以含有4个或更多个、8个或更多个、12个或更多个、16个或更多个、32个或更多个编址(addresses)，但是最低限度包含本专利技术所述的内在基因的捕获探针。使用机械合成方法合成这些阵列的技术是已知的。阵列可以装配在几乎任何形状的表面或者甚至多个表面上。阵列可以是珠子、凝胶、聚合物表面、纤维如光纤、玻璃或任何其它适合基质上的探针(例如核酸结合探针)。在另一个实施方案中，试剂盒包含一组寡核苷酸引物，所述引物足以检测和/或定量本专利技术所述的内在基因。寡核苷酸引物可以以冻干或重构的形式提供，或者可以作为一组核苷酸序列提供。在一个实施方案中，以微孔板(microplate)的形式提供引物，其中每一个引物组占用微孔板中的一个孔(或多个孔，如在重复的情况下)。微孔板可以进一步包含足以检测如下所述的一个或多个看家基因的引物。试剂盒可以进一步包含足以扩增本专利技术所述的基因的表达产物的试剂和说明。为了便于快速访问，例如为进行比较、检查、恢复、和/或修改，分子特征/表达概况典型地记录在数据库中。最典型地，数据库是可由计算机设备访问的关系数据库，虽然可以使用其它形式，例如作为照片、模拟或数字成像读数、电子表格等的表达概况的手动访问索引文件。无论最初记录的表达模式本质上是模拟的或数字的，表达模式、表达概况(集合的表达模式)和分子特征(相关表达模式)以数字形式储存并通过数据库访问。典型地，数据库在中央设备编辑并维持，可以在本地和/或远程访问。本专利技术的第三方面提供了一种芯片，所述芯片包括本专利技术第一方面所述的试剂。进一步，试剂盒还可以包含计算机可读介质。“芯片”也称为“阵列”，指包含连接的核酸或肽探针的固体支持物。阵列通常包含按照不同的已知位置连接至基底表面的多种不同的核酸或肽探针。这些阵列，也称为“微阵列”，通常可以利用机械合成方法或光引导合成方法来产生这些阵列，所述光引导合成方法合并了光刻方法和固相合成方法的组合。阵列可以包含平坦的表面，或者可以是珠子、凝胶、聚合物表面、诸如光纤的纤维、玻璃或任何其它合适的基底上的核酸或肽。可以以一定的方式来包装阵列，从而允许进行全功能装置的诊断或其它方式的操纵。“微阵列”是杂交阵列原件有序排列在基质上，所述杂交阵列原件诸如聚核苷酸探针(例如寡核苷酸)或结合剂(例如抗体)。所述基质可以是固体基质，例如，玻璃或二氧化硅玻片、珠、纤维光学粘结剂或半固态基质，例如硝酸纤维素膜。核苷酸序列可以是DNA、RNA或其中的任何排列。本专利技术的第四方面提供了一种核酸膜条，所述核酸膜条包括本专利技术第一方面所述的试剂。核酸膜条包括基底和固定于所述基底上的寡核苷酸探针；所述基底可以是任何适于固定寡核苷酸探针的基底，例如尼龙膜、硝酸纤维素膜、本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种试剂，其特征在于，所述试剂能够检测样本中LINC02544的水平。

【技术特征摘要】
1.一种试剂，其特征在于，所述试剂能够检测样本中LINC02544的水平。2.根据权利要求1所述的试剂，其特征在于，包括：特异性识别LINC02544基因的探针；或特异性扩增LINC02544基因的引物。3.根据权利要求2所述的试剂，其特征在于，特异性扩增LINC02544的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。4.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求1-3任一项所述的试剂。5.一种芯片，其特征在于，所述芯片包括权利要求1-3任一项所述的试剂。6.一种核酸膜条，其特征在于，所述核酸膜条包括权利要求1-3任一项所述的试剂。7.一种组合物，其特征在于，所述组合物包括LINC02544的抑制剂。8.根据权利要求7所述的组合物，其特征在于，所述抑制剂为siRNA。9.一种筛选治疗乳腺癌的候选药物的方法，其特征在于，所述方法包括：用待筛选物质...

【专利技术属性】
技术研发人员：雷海，贾新建，罗雪，易瑛，
申请(专利权)人：德阳市人民医院，
类型：发明
国别省市：四川,51